阿贝卡星 | 51025-85-5

• 物质功能分类: 原料药 - 抗生素类药物 - 其它抗生素类药
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 阿贝卡星
• 英文名称: arbekacin
• 英文别名: Habekacin；ABK；(S)-1-N-(4-amino-2-hydroxybutyroyl)dibekacin；(2S)-4-amino-N-[(1R,2S,3S,4R,5S)-5-amino-4-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)oxan-2-yl]oxy-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-amino-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3-hydroxycyclohexyl]-2-hydroxybutanamide
• CAS: 51025-85-5
• 化学式: C₂₂H₄₄N₆O₁₀
• mdl: MFCD00864919
• 分子量: 552.626
• InChiKey: MKKYBZZTJQGVCD-XTCKQBCOSA-N

物化性质

• 沸点：
  904.0±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)
• 物理描述：
  Solid
• 熔点：
  178°C
• 溶解度：
  4.10e+01 g/L
• 稳定性/保质期：

  二碳酸阿贝卡星(Ajbekacin Dicarbonate)：化学式为Q2H44N6O10·2H2CO3，是一种无色结晶性粉末，熔点为178℃（分解）。其旋光性质为[α]{D}^24 +86.8°(C=0.77，水)。急性毒性试验表明，通过静脉注射给小鼠的半数致死剂量(LD50)大于150 mg/kg。

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.8
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.954
• 拓扑面积：
  297
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  15

ADMET

毒理性

• 蛋白质结合

3-12%

3-12%

来源:DrugBank

吸收、分配和排泄

• 吸收

氨基糖苷类药物从胃肠道吸收不良。通过注射给药，它们的吸收显著提高。

Aminoglycosides are not well absorbed from the gastrointestinal tract. Their absorption is markedly improved by parenteral administration.

来源:DrugBank

制备方法与用途

化学性质
二碳酸阿贝卡星（Ajbekacin Dicarbonate）：Q2H44N6O10·2H2CO3。这是一种无色结晶性粉末，熔点为178℃（分解）。在水中，其比旋光度为[α]D24+86.8°（C=0.77）。急性毒性实验表明，通过静脉注射给小鼠的LD50值大于150 mg/kg。

用途
对卡那霉素、庆大霉素及丁胺卡那霉素耐药菌表现出强烈的抗菌活性。主要用于治疗由敏感细菌引起的各种败血症和肺炎等疾病。

生产方法
3′，4′-二脱氧卡那霉素B与等当量的叔丁氧羰基叠氮化物，在水、吡啶和三乙胺（10：10：1）混合溶液中于室温下反应18小时。通过Amberlite CG50(NH4+)柱层析，得到6′-N-叔丁氧羰基-3′，4′-二脱氧卡那霉素B，收率为49%，熔点为136～140℃（分解），其比旋光度为[α]D26+112°（C=1.0，水）。同时回收了约36%未反应的3′，4′-二脱氧卡那霉素B。

将1.1g（2.0mmol）6′-N-叔丁氧羰基-3′，4′-二脱氧卡那霉素B与320mg（2.2mmol）叔丁氧羰基叠氮化物在相同条件下反应，得到1.41g黄色粉末。不经纯化，溶于20ml水和10ml二甲氧基乙烷中，再加入(S)-4-叔丁氧羰基氨基-2-羟基丁酸(N-羟基丁二酰亚胺)酯（696mg，2.2mmol）的10ml二甲氧基乙烷溶液，在室温下酰化反应20小时。然后与10ml 90%三氟乙酸在室温下反应40分钟以去除叔丁氧羰基。浓缩后使用Amberlite CG50(NH4+)柱层析，用水和0.5mol/L氨水洗脱，再用0.75mol/L氨水将产物洗脱。最终得到162mg二碳酸阿贝卡星，收率为12%，熔点为178℃（分解），比旋光度为[α]D24+87°（C=0.77，水）。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  阿贝卡星 在 palladium on activated charcoal zinc diacetate 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and antibacterial activity of 5-deoxy-5-episubstituted arbekacin derivatives

  摘要：

  5-Deoxy-5-episubstituted arbekacin derivatives have been designed and efficiently synthesized. The synthetic compounds showed potent antibacterial activity against both Staphylococcus aureus, including methicillin-resistant S. aureus, and Pseudomonas aeruginosa. In particular, these derivatives were superior to arbekacin against MRSA strains expressing the bifunctional aminoglycoside-modifying enzyme AAQ6')-APH(2"). The antibacterial activity of the 5-deoxy-5-episubstituted arbekacin derivatives against Pseudomonas aeruginosa was markedly influenced by the efflux system of MexXY/OprM. The 6'-N-methyl derivative of the 5-epi arbekacin was effective against Pseudomonas aeruginosa expressing the aminoglycoside-modifying enzyme AAC(6'). (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2007.04.065

文献信息

• [EN] DERIVATIVES OF AMANITA TOXINS AND THEIR CONJUGATION TO A CELL BINDING MOLECULE<br/>[FR] DÉRIVÉS DE TOXINES D'AMANITES ET LEUR CONJUGAISON À UNE MOLÉCULE DE LIAISON CELLULAIRE
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2017046658A1

  公开（公告）日：2017-03-23

  Derivatives of Amernita toxins of Formula (I), wherein, formula (a) R 1, R 2, R 3, R 4, R 5, R 6, R 7, R 8, R 9, R 10, X, L, m, n and Q are defined herein. The preparation of the derivatives. The therapeutic use of the derivatives in the targeted treatment of cancers, autoimmune disorders, and infectious diseases.

  Amernita毒素的衍生物的化学式（I），其中，化学式（a）中的R 1、R 2、R 3、R 4、R 5、R 6、R 7、R 8、R 9、R 10、X、L、m、n和Q在此处被定义。这些衍生物的制备。这些衍生物在靶向治疗癌症、自身免疫性疾病和传染病中的治疗用途。
• [EN] A CONJUGATE OF A CYTOTOXIC AGENT TO A CELL BINDING MOLECULE WITH BRANCHED LINKERS<br/>[FR] CONJUGUÉ D'UN AGENT CYTOTOXIQUE À UNE MOLÉCULE DE LIAISON CELLULAIRE AVEC DES LIEURS RAMIFIÉS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020257998A1

  公开（公告）日：2020-12-30

  Provided is a conjugation of cytotoxic drug to a cell-binding molecule with a side-chain linker. It provides side-chain linkage methods of making a conjugate of a cytotoxic molecule to a cell-binding ligand, as well as methods of using the conjugate in targeted treatment of cancer, infection and immunological disorders.

  提供了一种将细胞毒性药物与一个侧链连接分子结合的共轭物。它提供了制备细胞毒性分子与细胞结合配体的共轭物的侧链连接方法，以及在靶向治疗癌症、感染和免疫性疾病中使用该共轭物的方法。
• [EN] CROSS-LINKED PYRROLOBENZODIAZEPINE DIMER (PBD) DERIVATIVE AND ITS CONJUGATES<br/>[FR] DÉRIVÉ DE DIMÈRE DE PYRROLOBENZODIAZÉPINE RÉTICULÉ (PBD) ET SES CONJUGUÉS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020006722A1

  公开（公告）日：2020-01-09

  A novel cross-linked cytotoxic agents, pyrrolobenzo-diazepine dimer (PBD) derivatives, and their conjugates to a cell-binding molecule, a method for preparation of the conjugates and the therapeutic use of the conjugates.

  一种新型的交联细胞毒剂，吡咯苯并二氮杂环二聚体（PBD）衍生物，以及它们与细胞结合分子的结合物，一种制备这些结合物的方法以及这些结合物的治疗用途。
• [EN] IMIDAZOLIUM REAGENT FOR MASS SPECTROMETRY<br/>[FR] RÉACTIF D'IMIDAZOLIUM POUR SPECTROMÉTRIE DE MASSE
  申请人：HOFFMANN LA ROCHE

  公开号：WO2021234004A1

  公开（公告）日：2021-11-25

  The present invention relates to compounds which are suitable to be used in mass spectrometry as well as methods of mass spectrometric determination of analyte molecules using said compounds.

  本发明涉及适用于质谱的化合物，以及利用该化合物进行分析物分子的质谱测定方法。
• Bifunctional antibiotics for targeting rRNA and resistance-causing enzymes
  申请人：Baasov Timor

  公开号：US20050004052A1

  公开（公告）日：2005-01-06

  A novel group of aminoglycosides which share some structural features of currently available aminoglycosides with regard to the backbone, while also having significant structural differences. The similarity enables these aminoglycosides to be highly potent and effective antibiotics, while the significant differences enable these aminoglycosides to reduce or even block antibiotic resistance.

  一种新型氨基糖苷类药物，与目前已有的氨基糖苷类药物在骨架方面具有一些结构特征，同时又具有显著的结构差异。这种相似性使得这些氨基糖苷类药物具有很高的抗菌作用和有效性，而显著的差异使得这些氨基糖苷类药物能够减少甚至阻止抗生素耐药性的发展。