pentalenene | 73306-73-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: pentalenene
• 英文别名: (1R,2R,5S,8S)-2,6,10,10-tetramethyltricyclo[6.3.0.01,5]undec-6-ene
• CAS: 73306-73-7
• 化学式: C₁₅H₂₄
• 分子量: 204.356
• InChiKey: YGIVIHRLDOVJLL-GUIRCDHDSA-N

物化性质

• 沸点：
  262.5±7.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.94±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.87
• 拓扑面积：
  0
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  pentalenene 在 selenium(IV) oxide 、 水 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 20.0h， 以88%的产率得到(1R,3aR,5aS,8aR)-1,7,7-trimethyl-1,2,3,3a,5a,6,7,8-octahydrocyclopenta[c]pentalene-4-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  来自松果链霉菌的松香萜烯合成物，用于丁香烯，戊烯和表异异氮烯。

  摘要：

  表征了来自邦戈链霉菌的倍半萜烯合酶并产生新的化合物邦戈烯。使用同位素标记的底物对酶机理进行了深入研究。从其他两种酶S. bungoensis制成外延-isozizaene和pentalenene。探索了与结构相关的岩藻糖醇和戊烯醛的合成氧化化学。

  DOI：

  10.1039/d0ob00606h
• 作为产物：
  描述：

  farnesyl pyrophosphate 在 pentalenene synthase 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 pentalenene
  参考文献：
  名称：

  倍半萜烯环化酶 PenA、Omp6/7 和 BcBOT2 的机制相似性被非自然的“FPP-醚”衍生物解开

  摘要：

  倍半萜烯环化酶戊烯合酶 (PenA) 和两种 Δ 6 -原甲苯烯合酶 Omp6 和 Omp7 将 FPP 醚转化为几种新的四氢呋喃萜类化合物，其中一种也是倍半萜烯环化酶 BcBOT2 作为主要产物形成的。因此，尽管氨基酸序列相似性水平较低，PenA、Omp6/7 和 BcBOT2 遵循密切相关的催化途径并诱导其二磷酸底物的类似折叠。一些新的萜类化合物显示出明显的嗅觉特性。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.1c00882

文献信息

• An asymmetric total synthesis of (+)-pentalenene
  作者：Yoon-Jung Kim、Yeokwon Yoon、Hee-Yoon Lee

  DOI：10.1016/j.tet.2013.05.095

  日期：2013.9

  stereoselective total synthesis of (+)-pentalenene was achieved through the tandem cycloaddition reaction of the allenyl diazo substrate prepared from (+)-citronellal. The initial intramolecular [2+3] cycloaddition reaction between the diazo functionality and the allenyl group produced the trimethylenemethane (TMM) intermediate after immediate loss of nitrogen molecule from the cycloaddition intermediate.

  通过（+）-香茅醛制得的烯丙基重氮底物的串联环加成反应实现了（+）-戊烯的立体选择性全合成。重氮官能团和烯基之间的初始分子内[2 + 3]环加成反应在环加成中间体中立即失去氮分子后产生了三亚甲基甲烷（TMM）中间体。TMM随后与烯烃的[2 + 3]环加成反应选择性地产生了角熔融的三喹烷结构。
• Exploiting the Synthetic Potential of Sesquiterpene Cyclases for Generating Unnatural Terpenoids
  作者：Clara Oberhauser、Vanessa Harms、Katja Seidel、Benjamin Schröder、Kimia Ekramzadeh、Sascha Beutel、Sven Winkler、Lukas Lauterbach、Jeroen S. Dickschat、Andreas Kirschning

  DOI：10.1002/anie.201805526

  日期：2018.9.3

  The substrate flexibility of eight purified sesquiterpene cyclases was evaluated using six new heteroatom‐modified farnesyl pyrophosphates, and the formation of six new heteroatom‐modified macrocyclic and tricyclic sesquiterpenoids is described. GC‐O analysis revealed that tricyclic tetrahydrofuran exhibits an ethereal, peppery, and camphor‐like olfactoric scent.

  使用六种新的杂原子修饰的法呢基焦磷酸酯评估了八种纯化的倍半萜环化酶的底物柔性，并描述了六种新的杂原子修饰的大环和三环倍半萜的形成。GC‐O分析表明，三环四氢呋喃具有醚味，胡椒味和樟脑味的嗅觉气味。
• Pentalenene Synthase. Analysis of Active Site Residues by Site-Directed Mutagenesis
  作者：Myriam Seemann、Guangzhi Zhai、Jan-Willem de Kraker、Chiana M. Paschall、David W. Christianson、David E. Cane

  DOI：10.1021/ja026058q

  日期：2002.7.1

  and k(cat)/K(m). By contrast, single H309 mutants gave rise to both (+)-germacrene A (7) and protoilludene (8) in addition to pentalenene (2). Mutation to glutamate of each of the three aspartate residues in the Mg(2+)-binding aspartate-rich domain, (80)DDLFD, resulted in reduction in the k(cat)/K(m) for farnesyl diphosphate and formation of varying proportions of pentalenene and (+)-germacrene A (7)

  法呢基二磷酸 (1) 与戊烯合酶的 W308F 或 W308F/H309F 突变体（一种来自链霉菌属 UC5319 的酶）一起孵育，产生戊烯 (2)，伴随着不同比例的 (+)-germacrene A (7) k(cat) 和 k(cat)/K(m)。相比之下，单个 H309 突变体除了产生戊烯 (2) 外还产生 (+)-germacrene A (7) 和原伊露烯 (8)。Mg(2+) 结合富含天冬氨酸的域 (80)DDLFD 中三个天冬氨酸残基中的每一个突变为谷氨酸导致法呢基二磷酸的 k(cat)/K(m) 降低，并形成不同的戊烯和 (+)-germacrene A (7) 的比例。各种戊烯合酶突变体形成 (+)-germacrene A (7) 是天然抗马尔科夫尼科夫环化反应脱轨的结果，而不仅仅是捕获通常神秘的碳阳离子中间体的结果。戊烯合酶的 N219A 和 N219L 突变体均完全失活，而相应的
• Theoretical Studies on Farnesyl Cation Cyclization:  Pathways to Pentalenene
  作者：Pradeep Gutta、Dean J. Tantillo

  DOI：10.1021/ja058031n

  日期：2006.5.1

  In this article, we describe studies, using quantum chemical computations, on possible polycyclization pathways of the farnesyl cation leading to the complex sesquiterpene pentalenene. Two distinct pathways to pentalenene with similar activation barriers are described, each differing from previous mechanistic proposals, and each involving unusual and unexpected intermediates. Direct deprotonation of

  在本文中，我们描述了使用量子化学计算对法呢基阳离子导致复杂倍半萜戊烯的可能多环化途径的研究。描述了两种具有相似活化障碍的戊烯的不同途径，每一种都不同于以前的机制建议，并且每一种都涉及不寻常和意想不到的中间体。这些途径中中间体的直接去质子化导致倍半萜副产物，例如葎烯、原茚烯和茋苒烯，支持戊烯合酶（自然界中产生戊烯的酶）的关键功能是调节质子去除的时间和位置的观点. 讨论了计算结果对戊烯合酶实验研究的影响。
• A Gene Cluster for Biosynthesis of the Sesquiterpenoid Antibiotic Pentalenolactone in <i>Streptomyces avermitilis</i>
  作者：Charles N. Tetzlaff、Zheng You、David E. Cane、Satoshi Takamatsu、Satoshi Omura、Haruo Ikeda

  DOI：10.1021/bi060419n

  日期：2006.5.1

  biochemical function of the individual biosynthetic genes came from expression of the ptlA gene (SAV2998) in Escherichia coli. Assay of the resultant protein established that PtlA is a pentalenene synthase, catalyzing the cyclization of farnesyl diphosphate to pentalenene, the parent hydrocarbon of the pentalenolactone family of metabolites. The most upstream gene in the cluster, gap1 (SAV2990), was shown to

  Streptomyces avermitilis 是一种工业有机体，负责生产抗蠕虫阿维菌素，拥有一个 13.4 kb 的基因簇，其中包含 13 个单向转录的开放阅读框，对应于倍半萜类抗生素戊内酯的明显生物合成操纵子。高级中间体戊烯内酯 F 以及分流代谢物戊烯酸可以从阿维链霉菌的培养物中分离出来，从而确定戊烯内酯生物合成途径在阿维链霉菌中发挥作用。从 S. avermitilis 中删除整个 13.4 kb 簇消除了戊烯内酯代谢物的形成，而将完整簇转移到戊烯内酯非生产者 Streptomyces lividans 1326 导致了戊烯酸的产生。单个生物合成基因的生化功能的直接证据来自 ptlA 基因 (SAV2998) 在大肠杆菌中的表达。对所得蛋白质的测定确定 PtlA 是一种戊烯合酶，催化二磷酸法呢基环化为戊烯，戊烯内酯代谢物家族的母体烃。簇中最上游的基因 gap1 (SAV2990)