Family-wide analysis of aminoacyl-sulfamoyl-3-deazaadenosine analogues as inhibitors of aminoacyl-tRNA synthetases
作者:Baole Zhang、Steff De Graef、Manesh Nautiyal、Luping Pang、Bharat Gadakh、Matheus Froeyen、Lieve Van Mellaert、Sergei V. Strelkov、Stephen D. Weeks、Arthur Van Aerschot
DOI:10.1016/j.ejmech.2018.02.013
日期:2018.3
Aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs) are enzymes that precisely attach an amino acid to its cognate tRNA. This process, which is essential for protein translation, is considered a viable target for the development of novel antimicrobial agents, provided species selective inhibitors can be identified. Aminoacyl-sulfamoyl adenosines (aaSAs) are potent orthologue specific aaRS inhibitors that demonstrate
氨酰基-tRNA合成酶(aaRSs)是一种将氨基酸精确地与其同源tRNA相连的酶。如果可以鉴定出物种选择性抑制剂,则该过程对于蛋白质翻译至关重要,被认为是开发新型抗菌剂的可行目标。氨酰基氨磺酰酰基腺苷(aaSAs)是强直向同源物特异性aaRS抑制剂,在体外表现出纳摩尔亲和力,但吸收受限。继我们之前关于碱基部分取代的工作之后,我们评估了N 3的作用通过合成相应的3-脱氮杂腺苷类似物(aaS3DAs)将腺嘌呤定位在-位。一个典型的生物具有20种不同的aaRS,可以将其分为两个不同的结构类别。因此,我们通过氨基磺酸桥将六种不同的氨基酸(均等地靶向两种酶)偶联到3-deazaadenosine。在评估所获得的类似物的抑制能力时,注意到明显的类别偏倚,与等效的aaSA相比,针对II类酶的aaS3DA类似物的活性丧失。对可用晶体学结构的评估指出了保守水分子的存在,该分子对于II类酶中的碱基识别可能具有