1,6-二氢-6-氧代-2-[[(苯甲氧基)羰基]氨基]-9H-嘌呤-9-乙酸 | 169287-69-8

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 中文名称: 1,6-二氢-6-氧代-2-[[(苯甲氧基)羰基]氨基]-9H-嘌呤-9-乙酸
• 英文名称: N²-Z-N-9-carboxymethylguanine
• 英文别名: 2-N-(benzyloxycarbonyl)-9-(carboxymethyl)guanine；N²-benzyloxycarbonyl-N-9-carboxymethylguanine；2-[2-(benzyloxycarbonyl)amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl]acetic acid；2-N-(benzyloxycarbonyl)guanine-9-acetic acid；[2-N-(benzyloxycarbonyl)-guanin-9-yl]-acetic acid；N²-Cbz-guanin-9-yl acetic acid；G(z)-AcOH；2-[2-(Benzyloxycarbonylamino)-6-hydroxy-purin-9-yl]acetic acid；2-[6-oxo-2-(phenylmethoxycarbonylamino)-1H-purin-9-yl]acetic acid
• CAS: 169287-69-8
• 化学式: C₁₅H₁₃N₅O₅
• 分子量: 343.299
• InChiKey: PLQMFGXJLNMTQH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.60±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.13
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,6-二氢-6-氧代-2-[[(苯甲氧基)羰基]氨基]-9H-嘌呤-9-乙酸 在 四(三苯基膦)钯 2,4,6-三甲基吡啶 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 三正丁基氢锡 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 2-[[2-[[2-[[2-[[9H-fluoren-9-ylmethoxy(hydroxy)methylidene]amino]phenyl]methyl-[2-[6-[[hydroxy(phenylmethoxy)methylidene]amino]purin-9-yl]acetyl]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]phenyl]methyl-[2-[6-hydroxy-2-[[hydroxy(phenylmethoxy)methylidene]amino]purin-9-yl]acetyl]amino]acetic acid
  参考文献：
  名称：

  Hybridization Properties of Aromatic Peptide Nucleic Acids:  A Novel Class of Oligonucleotide Analogues

  摘要：

  [GRAPHICS]The synthesis of APNA-PNA chimeras containing all four DNA bases will be described. The hybridization properties of APNA-PNA chimeras with DNA and RNA are consistent with plausible intramolecular interactions that could preorganize the oligomers in a duplex or triplex structure with complementary DNA or RNA.

  DOI：

  10.1021/ol010231q
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (6-chloro-9H-purin-2-yl)carbamate 在 甲酸 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 10.5h， 生成 1,6-二氢-6-氧代-2-[[(苯甲氧基)羰基]氨基]-9H-嘌呤-9-乙酸
  参考文献：
  名称：

  开发方便的路线，以制备Boc介导的PNA合成所需的N 2 -Cbz保护的鸟苷基合成子

  摘要：

  已经开发了一种高效，高产，化学和区域选择性的五步合成N 2 -Cbz-鸟嘌呤-9-基乙酸的合成路线，该路线避免了使用三光气。在形成后Ñ 2 -Boc由2-氨基-6-氯嘌呤保护嘌呤，两个连续的基控制烷基化允许一个Ñ 9 -叔丁基乙酸酯功能后跟Ñ 2 -Cbz部分进行安装。通过对6-（2-硝基苯氧基）类似物的X射线晶体学研究证实了这些反应的选择性。最后水解脱氯并去除Boc和叔叔同时在酸性条件下完成叔丁酯保护基团，以总产率53％得到鸟嘌呤-9-基PNA单体合成子。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2013.09.034

文献信息

• [EN] PNA MONOMER AND PRECURSOR<br/>[FR] MONOMERE ET PRECURSEUR PNA
  申请人：PANAGENE INC

  公开号：WO2003091231A1

  公开（公告）日：2003-11-06

  This application relates to monomers of the general formula (I) for the preparation PNA (peptide nucleic acid) oligomers and provides method for the synthesis of both predefined sequence PNA oligomers and random sequence PNA oligomers: (I) wherein E is nitrogen or C-R'; J is sulfur or oxygen; R', Rl, R2, R3, R4 is independently H, halogen, alkyl, nitro, nitrile, alkoxy, halogenated alkyl, halogenated alkoxy, phenyl or halogenated phenyl, RS is H or protected or unprotected side chain of natural or unnatural a-amino acid; and B is a natural or unnatural nucleobase, wherein when said nucleobase has an exocyclic amino function, said function is protected by protecting group which is labile to acids but stable to weak to medium bases in the presence of thiol.

  该应用程序涉及通用式(I)的单体，用于制备PNA（肽核酸）寡聚体，并提供了合成预定义序列PNA寡聚体和随机序列PNA寡聚体的方法：(I)其中E为氮或C-R'; J为硫或氧; R'，Rl，R2，R3，R4独立地为H，卤素，烷基，硝基，腈基，烷氧基，卤代烷基，卤代烷氧基，苯基或卤代苯基，RS为H或天然或非天然α-氨基酸的保护或未保护侧链; B为天然或非天然核碱基，其中当所述核碱基具有外环氨基功能时，所述功能由对酸敏感但在巯基存在下对弱到中等碱稳定的保护基保护。
• PNA monomer and precursor
  申请人：——

  公开号：US20030225252A1

  公开（公告）日：2003-12-04

  This application relates to monomers of the general formula (I) for the preparation of PNA (peptide nucleic acid) oligomers and provides method for the synthesis of both predefined sequence PNA oligomers and random sequence PNA oligomers: 1 wherein E is nitrogen or C—R′; J is sulfur or oxygen; R′, R1, R2, R3, R4 is independently H, halogen, alkyl, nitro, nitrile, alkoxy, halogenated alkyl, halogenated alkoxy, phenyl or halogenated phenyl, R5 is H or protected or unprotected side chain of natural or unnatural &agr;-amino acid; and B is a natural or unnatural nucleobase, wherein when said nucleobase has an exocyclic amino function, said function is protected by protecting group which is labile to acids but stable to weak to medium bases in the presence of thiol.

  该应用程序涉及通式（I）的单体，用于制备PNA（肽核酸）寡聚体，并提供了合成预定义序列PNA寡聚体和随机序列PNA寡聚体的方法： 其中 E为氮或C—R′；J为硫或氧； R′、R1、R2、R3、R4独立地为H、卤素、烷基、硝基、腈基、烷氧基、卤代烷基、卤代烷氧基、苯基或卤代苯基， R5为H或天然或非天然α-氨基酸的保护或未保护侧链；以及 B为天然或非天然核碱基，其中当所述核碱基具有外环氨基功能时，所述功能由对酸敏感但在巯基存在下对弱到中等碱稳定的保护基保护。
• Photolabile Peptide Nucleic Acid Monomers: Synthesis and Photodeprotection
  作者：Kumar Bhushan

  DOI：10.1055/s-2006-949621

  日期：2006.8

  The photolabile 2-(2-nitrophenyl)propyloxy carbonyl (NPPOC) group has been introduced as an amino protecting group for peptide nucleic acids (PNA) to be used as building blocks in photolithographic solid-phase PNA synthesis. NPPOC-protected PNA derivatives undergo fast light-promoted deprotection with high per step coupling efficiency.

  光不稳定的 2-(2-硝基苯基)丙氧基羰基 (NPPOC) 基团已被引入作为肽核酸 (PNA) 的氨基保护基团，用作光刻固相 PNA 合成中的构建块。NPPOC 保护的 PNA 衍生物经历快速光促进脱保护，每步耦合效率高。
• Fmoc mediated synthesis of Peptide Nucleic Acids
  作者：Stephen A. Thomson、John A. Josey、Rodolfo Cadilla、Micheal D. Gaul、C. Fred Hassman、Michael J. Luzzio、Adrian J. Pipe、Kathryn L. Reed、Daniel J. Ricca、Robert W. Wiethe、Stewart A. Noble

  DOI：10.1016/0040-4020(95)00286-h

  日期：1995.5

  6-chloro-2-aminopurine followed by acid hydrolysis, Cbz protection with N-(benzyloxycarbonyl)imidazole, ozonolytic cleavage, and oxidation afforded the Cbz-protected guanine acetic acid (5). The base acetic acids (2, 3, 4 and 5) were coupled to the backbone (1) with either EDC (2 and 3) or BOP reagent (4 and 5). Acid hydrolysis of the resulting t-butyl esters and transesterification afforded the corresponding

  描述了腺嘌呤（26），胞嘧啶（23），鸟嘌呤（29）和胸腺嘧啶（20）的Fmoc保护的肽核酸（PNA）单体五氟苯基酯的合成及其低聚反应。Fmoc PNA主链1制备为稳定的盐酸盐。腺嘌呤（的基乙酸4）和胞嘧啶（3）是由环外氨基随后烷基化的Cbz基保护以制备吨-butylbromoacetate和随后的酸水解吨丁基酯。对6-氯-2-氨基嘌呤进行烯丙基化，然后进行酸水解，用N进行Cbz保护-（苄氧基羰基）咪唑，经臭氧分解和氧化得到Cbz-保护的鸟嘌呤乙酸（5）。用EDC（2和3）或BOP试剂（4和5）将基础乙酸（2、3、4和5）偶联到主链（1）。所得叔丁基酯的酸水解和酯交换反应得到相应的五氟苯基酯（20、23、26和29）。在每个偶联循环中，仅以过量的2倍的单体，以0.05 mmol的规模进行低聚。该ñ在HF裂解和脱保护之后，末端Fmoc基团保留在最终的低聚物上，为HPLC纯化提供了方便的亲脂性处理。
• Multicomponent synthesis of novel amino acid–nucleobase chimeras: a versatile approach to PNA-monomers
  作者：Wolfgang Maison、Imre Schlemminger、Ole Westerhoff、Jürgen Martens

  DOI：10.1016/s0968-0896(00)00066-3

  日期：2000.6

  paper describes a multicomponent approach to novel totally protected precursors of PNA-monomers via Ugi 4CC. The obtained bisamides are converted into several partially protected PNA-monomers or derivatives thereof using three different procedures. Methods for hydrolysis are shown to be dependent on the nature of the isocyano component required for Ugi 4CC. Several novel monomers suitable for oligomer

  本文介绍了一种多组分方法，可通过Ugi 4CC对新型完全保护的PNA单体前体进行处理。使用三种不同的方法将获得的双酰胺转化为几种部分保护的PNA单体或其衍生物。已显示水解方法取决于Ugi 4CC所需的异氰基组分的性质。制备了几种适用于低聚物合成的新型单体，证明了该反应序列的高通用性。