benzyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside | 41355-95-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: benzyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-2-phenylmethoxyoxan-3-yl]acetamide
• CAS: 41355-95-7
• 化学式: C₁₅H₂₁NO₆
• 分子量: 311.335
• InChiKey: SKOZFDIGKDPQBO-UXXRCYHCSA-N

物化性质

• 沸点：
  594.9±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.34±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside 在 吡啶 、 iron(III) chloride 、 二乙胺基三氟化硫 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 dibenzylphosphate-2-acetamido-3,6-di-O-benzoyl-2,4-dideoxy-4-fluoro-α-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  化学合成4-氟-N-乙酰基己糖胺尿苷二磷酸供体：糖胺聚糖合成中的链终止剂。

  摘要：

  使用化学方法和化学方法制备了非天然尿苷二磷酸（UDP）糖供体UDP-4-脱氧-4-氟-N-乙酰氨基葡萄糖（4FGlcNAc）和UDP-4-脱氧-4-氟-N-乙酰半乳糖胺（4FGalNAc）。化学酶合成依赖于N-乙酰氨基葡糖-1-磷酸尿嘧啶转移酶（GlmU）。然后将所得的非天然UDP-糖供体作为通过各种合酶催化的糖胺聚糖合成中的底物进行测试。UDP-4FGlcNAc被多杀巴斯德氏菌肝素合酶1转移到受体上，随后用作链终止剂。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b02929
• 作为产物：
  描述：

  2-乙酰氨基-3,4,6-三-O-乙酰-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖酰基氯 在 吡啶 、 甲醇 、 水 、 碘 、 sodium methylate 、 silver carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 benzyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  阐明肝素黄杆菌软骨素AC裂解酶裂解多糖的机制

  摘要：

  来自肝素黄杆菌的软骨素 AC 裂解酶通过消除机制降解硫酸软骨素糖胺聚糖，产生在其非还原端具有 delta4,5-不饱和糖醛酸残基的二糖或寡糖。关于该酶促反应的键断裂和形成步骤的顺序的机制细节不存在，主要是由于聚合物底物的不均匀性质。为这种酶创建了一类新的合成底物，可以测量定义的和可重复的 k(cat) 和 K(m) 值，并扩大了可以进行的机械研究的范围。主要氘动力学同位素对 k(cat)/K(m) 的质子 α 提取到羧酸的影响测量为 1.67 +/- 0.07，表明去质子化发生在限速步骤中。使用具有不同反应性的离去基团的底物，产生了平坦的线性自由能关系，表明 C4-O4 键在速率决定步骤中没有断裂。综上所述，这些结果强烈暗示了一种逐步机制。与此一致的是二次氘动力学同位素对 4-[(2)H]-基板上的 1.01 +/- 0.03 的 k(cat)/K(m) 影响的测量，表明在C4 在限速步骤

  DOI：

  10.1021/ja020627c

文献信息

• Protecting group free glycosylation: one-pot stereocontrolled access to 1,2-<i>trans</i> glycosides and (1→6)-linked disaccharides of 2-acetamido sugars
  作者：Xin Qiu、Anna L. Garden、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1039/d2sc00222a

  日期：——

  and acid catalysed reaction with an alcohol as solvent produces the corresponding 1,2-trans-glycosides in good yield. Alternatively, dissolution in an aprotic solvent system and acidic activation in the presence of an excess of an unprotected glycoside as a glycosyl acceptor, results in the stereoselective formation of the corresponding 1,2-trans linked disaccharides without any protecting group manipulations

  未受保护的 2-乙酰氨基糖可以在水溶液中使用 2-氯-1,3-二甲基咪唑啉 (DMC) 和合适的碱直接转化为它们的恶唑啉。以醇为溶剂的冷冻干燥和酸催化反应以良好的收率产生相应的1,2-反式-糖苷。或者，在非质子溶剂系统中溶解并在存在过量未保护糖苷作为糖基受体的情况下进行酸性活化，导致立体选择性形成相应的1，2-反式连接的二糖，而无需任何保护基团操作。使用芳基糖苷作为受体的反应是完全区域选择性的，仅产生 (1→6)-连接的二糖。
• Fluorescence Activated Cell Sorting as a General Ultra-High-Throughput Screening Method for Directed Evolution of Glycosyltransferases
  作者：Guangyu Yang、Jamie R. Rich、Michel Gilbert、Warren W. Wakarchuk、Yan Feng、Stephen G. Withers

  DOI：10.1021/ja104167y

  日期：2010.8.4

  Glycosyltransferases (GTs) offer very attractive approaches to the synthesis of complex oligosaccharides. However, the limited number of available GTs, together with their instability and strict substrate specificity, have severely hampered the broad application of these enzymes. Previous attempts to broaden the range of substrate scope and to increase the activity of GTs via protein engineering have met with

  糖基转移酶 (GT) 为合成复杂的寡糖提供了非常有吸引力的方法。然而，可用的 GT 数量有限，加上它们的不稳定性和严格的底物特异性，严重阻碍了这些酶的广泛应用。以前通过蛋白质工程扩大底物范围和增加 GT 活性的尝试取得了有限的成功，部分原因是缺乏有效的高通量筛选方法。最近，我们报道了一种基于荧光激活细胞分选的唾液酸转移酶超高通量筛选方法 (Aharoni et al. Nat. Methods 2006, 3, 609-614)。这里，我们通过引入双色筛选方案大大改进了这种方法，以最大限度地减少假阳性突变体的可能性，并通过中性糖转移酶、β-1,3-半乳糖基转移酶 CgtB 的定向进化证明其普遍性。从 > 10(7) CgtB 突变体库中快速鉴定出一种比野生型酶具有更广泛底物耐受性和 300 倍高活性的变体。重要的是，与母体酶相比，该变体能更有效地合成 G(M1a) 和去唾液酸 G(M1)
• Synthesis of O-(2-O-sulfo-α-l-idopyranosyluronic acid)-(1 → 3)-2-acetamido-2-deoxy-4-O-sulfo-d-galactopyranose trisodium salt, a disaccharide fragment of dermatan sulfate
  作者：Laurence Rochepeau-Jobron、Jean-Claude Jacquinet

  DOI：10.1016/s0008-6215(97)10017-9

  日期：1997.12

  O -benzyl-2-deoxy- α , and β- d -galactopyranoside, respectively, which served as acceptors in glycosylation reactions with variously activated derivatives of methyl 2-O- benzoyl -3-O- benzyl -4-O- chloroacetyl- l -idopyranuronate . Condensation of the chloride derivative promoted by silver triflate led unexpectedly to the formation of the β-linked disaccharide, whereas the trichloroacetimidoyl derivative

  摘要通过三步操作，将苄基2-乙酰氨基-2-脱氧-α和β-d-吡喃葡萄糖苷高产率地转化为相应的d-半乳糖类似物。这些后来以直接的方式分别转化为苄基2-乙酰氨基-4-O-乙酰基-6-O-苄基-2-脱氧-α和β-d-吡喃半乳糖苷，它们在糖基化反应中以各种方式用作受体。活化的2-O-苯甲酰基-3-O-苄基-4-O-氯乙酰基-1-碘吡喃醛酸酯的衍生物。由三氟甲磺酸银促进的氯化物衍生物的缩合出乎意料地导致了β-连接的二糖的形成，而三氯乙酰亚胺基衍生物以63％的收率提供了预期的α-连接的二糖。随后进行O-脱氯乙酰化，然后在糖醛酸部分的O-4处进行4-甲氧基苄基化，
• Design and Synthesis of Unnatural Heparosan and Chondroitin Building Blocks
  作者：Smritilekha Bera、Robert J. Linhardt

  DOI：10.1021/jo200076z

  日期：2011.5.6

  Triazole linked heparosan and chondroitin disaccharide and tetrasaccharide building blocks were synthesized in a stereoselective manner by applying a very efficient copper catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) reaction of appropriately substituted azido-glucuronic acid and propargyluted N-acetyl glucosamine and N-acetyl galactosamine derivative, respectively. The resulting suitably substituted tetrasaccharide analogues can be easily converted into azide and alkyne unit for further synthesis of higher oligosaccharide analogues.
• Investigating Bacterial N-Linked Glycosylation:  Synthesis and Glycosyl Acceptor Activity of the Undecaprenyl Pyrophosphate-Linked Bacillosamine
  作者：Eranthie Weerapana、Kerney Jebrell Glover、Mark M. Chen、Barbara Imperiali

  DOI：10.1021/ja054265v

  日期：2005.10.1

  The chemical synthesis and biological activity of undecaprenyl pyrophosphate bacillosamine (Und-PP-Bac), an obligatory intermediate in the asparagine-linked glycosylation pathway of Campylobacter jejuni, are reported. The key transformation involves the coupling of bacillosamine phosphate and undecaprenyl phosphate. The synthetic Und-PP-Bac can be used to investigate the activity of the enzyme PglA, which catalyzes the first glycosyl transfer in substrate biosynthesis for N-linked protein glycosylation in the pathogenic gram-negative bacterium. The availability of this synthetic substrate makes it possible to access polyprenyl-linked oligosaccharides, such as the GalNAc-alpha-1,3-bacillosamine-alpha-1-PP-Und intermediate, that will enable exploration of the remaining enzymes in the prokaryotic glycosylation pathway. Study of the bacterial glycosylation system will provide insight into the corresponding eukaryotic process, which is currently poorly understood.