benzyl O-(4-deoxy-4-fluoro-β-D-glucopyranosiduronic acid)-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside | 461026-01-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: benzyl O-(4-deoxy-4-fluoro-β-D-glucopyranosiduronic acid)-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: GlcA4F(b1-3)GalNAc(b)-O-Bn；(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-phenylmethoxyoxan-4-yl]oxy-3-fluoro-4,5-dihydroxyoxane-2-carboxylic acid
• CAS: 461026-01-7
• 化学式: C₂₁H₂₈FNO₁₁
• 分子量: 489.452
• InChiKey: UETCSAWDZGDCDT-ILGKSQHWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl O-(4-deoxy-4-fluoro-β-D-glucopyranosiduronic acid)-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside 在 chondroitin AC lyase 作用下， 生成 benzyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside 、 acide 4-desoxy-β-D-hex-4-enopyranosyluronique
  参考文献：
  名称：

  阐明肝素黄杆菌软骨素AC裂解酶裂解多糖的机制

  摘要：

  来自肝素黄杆菌的软骨素 AC 裂解酶通过消除机制降解硫酸软骨素糖胺聚糖，产生在其非还原端具有 delta4,5-不饱和糖醛酸残基的二糖或寡糖。关于该酶促反应的键断裂和形成步骤的顺序的机制细节不存在，主要是由于聚合物底物的不均匀性质。为这种酶创建了一类新的合成底物，可以测量定义的和可重复的 k(cat) 和 K(m) 值，并扩大了可以进行的机械研究的范围。主要氘动力学同位素对 k(cat)/K(m) 的质子 α 提取到羧酸的影响测量为 1.67 +/- 0.07，表明去质子化发生在限速步骤中。使用具有不同反应性的离去基团的底物，产生了平坦的线性自由能关系，表明 C4-O4 键在速率决定步骤中没有断裂。综上所述，这些结果强烈暗示了一种逐步机制。与此一致的是二次氘动力学同位素对 4-[(2)H]-基板上的 1.01 +/- 0.03 的 k(cat)/K(m) 影响的测量，表明在C4 在限速步骤

  DOI：

  10.1021/ja020627c
• 作为产物：
  描述：

  1,2,3,6-tetra-O-benzoyl-α-D-galactopyranose 在 四丁基溴化铵 、 碳酸氢钠 甲醇 、 sodium hypochlorite 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 methyl diethylaminosulfur trifluoride 、 氢溴酸 、 sodium methylate 、 silver trifluoromethanesulfonate 、 对甲苯磺酸 、 溶剂黄146 、 sodium bromide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 29.25h， 生成 benzyl O-(4-deoxy-4-fluoro-β-D-glucopyranosiduronic acid)-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  阐明肝素黄杆菌软骨素AC裂解酶裂解多糖的机制

  摘要：

  来自肝素黄杆菌的软骨素 AC 裂解酶通过消除机制降解硫酸软骨素糖胺聚糖，产生在其非还原端具有 delta4,5-不饱和糖醛酸残基的二糖或寡糖。关于该酶促反应的键断裂和形成步骤的顺序的机制细节不存在，主要是由于聚合物底物的不均匀性质。为这种酶创建了一类新的合成底物，可以测量定义的和可重复的 k(cat) 和 K(m) 值，并扩大了可以进行的机械研究的范围。主要氘动力学同位素对 k(cat)/K(m) 的质子 α 提取到羧酸的影响测量为 1.67 +/- 0.07，表明去质子化发生在限速步骤中。使用具有不同反应性的离去基团的底物，产生了平坦的线性自由能关系，表明 C4-O4 键在速率决定步骤中没有断裂。综上所述，这些结果强烈暗示了一种逐步机制。与此一致的是二次氘动力学同位素对 4-[(2)H]-基板上的 1.01 +/- 0.03 的 k(cat)/K(m) 影响的测量，表明在C4 在限速步骤

  DOI：

  10.1021/ja020627c