(2Z, 6Z)-farnesyl phosphate | 15416-91-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (2Z, 6Z)-farnesyl phosphate
• 英文别名: (Z,Z)-farnesyl phosphate；farnesyl phosphate；Farnesyl monophosphate；[(2Z,6Z)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trienyl] dihydrogen phosphate
• CAS: 15416-91-8
• 化学式: C₁₅H₂₇O₄P
• 分子量: 302.351
• InChiKey: ALEWCKXBHSDCCT-FBXUGWQNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  66.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2Z, 6Z)-farnesyl phosphate 、 在 pyruvate kinase 、 2-乙酰氨基-2-脱氧-Alpha-D-吡喃糖 、 磷烯醇丙酮酸 、 GlcNAc-1-phosphate uridyltransferase 、 N-acetylhexosamine 1-kinase 、 phospho-MurNAc-pentapeptide translocase 、 5’-三磷酸腺苷 、 三羟甲基氨基甲烷 、 尿苷5'-(2-乙酰氨基-2-脱氧-ALPHA-D-葡糖基焦磷酸酯) 、 magnesium chloride 作用下， 以65%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  脂质II及其类似物的酶促合成

  摘要：

  抗生素抗性的出现促使人们积极研究具有新作用方式的抗生素。在所有必需的细菌蛋白中，转糖基化酶将脂质II聚合成肽聚糖，并且由于其在肽聚糖合成中的重要作用而成为最有利的靶标之一。在这项研究中描述的是一种实用的酶促方法，可以合成脂质II，并辅以辅因子再生，从而以50-70％的收率获得该产品。这一发展取决于两个关键步骤：MraY在脂质I合成中的过表达和十一碳烯醇激酶在制备聚戊二烯磷酸酯中的应用。该方法进一步应用于脂质II类似物的合成。已经发现，MraY和十一碳烯醇激酶可以接受包含各种长度和构型的多种脂质。还评估了脂质II类似物对细菌转葡聚糖酶的活性。

  DOI：

  10.1002/anie.201402313
• 作为产物：
  描述：

  (2Z,6Z)-3,7,11-三甲基-2,6,10-十二碳三烯-1-醇 在 pyruvate kinase 、 磷烯醇丙酮酸 、 undecaprenol kinase 、 5’-三磷酸腺苷 、 三羟甲基氨基甲烷 、 magnesium chloride 作用下， 反应 24.0h， 以76%的产率得到(2Z, 6Z)-farnesyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  脂质II及其类似物的酶促合成

  摘要：

  抗生素抗性的出现促使人们积极研究具有新作用方式的抗生素。在所有必需的细菌蛋白中，转糖基化酶将脂质II聚合成肽聚糖，并且由于其在肽聚糖合成中的重要作用而成为最有利的靶标之一。在这项研究中描述的是一种实用的酶促方法，可以合成脂质II，并辅以辅因子再生，从而以50-70％的收率获得该产品。这一发展取决于两个关键步骤：MraY在脂质I合成中的过表达和十一碳烯醇激酶在制备聚戊二烯磷酸酯中的应用。该方法进一步应用于脂质II类似物的合成。已经发现，MraY和十一碳烯醇激酶可以接受包含各种长度和构型的多种脂质。还评估了脂质II类似物对细菌转葡聚糖酶的活性。

  DOI：

  10.1002/anie.201402313

文献信息

• Metabolomics-Based Identification of Disease-Causing Agents
  申请人：Skolnick Jeffrey

  公开号：US20110246081A1

  公开（公告）日：2011-10-06

  A method, computer-readable medium, and system for identifying one or more metabolites associated with a disease, comprising: comparing gene expression data from diseased cells to gene expression data from control cells in order to deduce genes that are differentially-regulated in the diseased cells relative to the control cells; based on enzyme function and pathway data for all human metabolites that utilize the genes that are differentially-regulated in the disease cells, identifying one or more metabolites whose intracellular levels are higher or lower in diseased cells than in control cells, and thereby associating the one or more metabolites with the disease.
• [EN] METABOLOMICS-BASED IDENTIFICATION OF DISEASE-CAUSING AGENTS<br/>[FR] IDENTIFICATION D'AGENTS PROVOQUANT UNE MALADIE BASÉE SUR LA MÉTABOLOMIQUE
  申请人：GEORGIA TECH RES INST

  公开号：WO2009052186A1

  公开（公告）日：2009-04-23

  A method, computer-readable medium, and system for identifying one or more metabolites associated with a disease, comprising: comparing gene expression data from diseased cells to gene expression data from control cells in order to deduce genes that are differentially-regulated in the diseased cells relative to the control cells; based on enzyme function and pathway data for all human metabolites that utilize the genes that are differentially-regulated in the disease cells, identifying one or more metabolites whose intracellular levels are higher or lower in diseased cells than in control cells, and thereby associating the one or more metabolites with the disease.
• [EN] NUCLEIC ACIDS AND PROTEIN SEQUENCES OF COSTUNOLIDE SYNTHASE<br/>[FR] ACIDES NUCLÉIQUES ET SÉQUENCES DE PROTÉINE DE COSTUNOLIDE SYNTHASE
  申请人：UTI LIMITED PARTNERSHIP

  公开号：WO2011121456A2

  公开（公告）日：2011-10-06

  Sesquiterpene lactones (STLs) are characteristic natural products in Asteraceae, but the biochemistry and evolution of STLs in Asteraceae remain unexplored at the molecular level. The present invention relates to gene and protein sequences for costunolide synthases, with exemplary sequences from Asteraceae. Recombinant microorganisms containing these genes, and methods of their use, also are provided.
• Enzymatic Synthesis of Lipid II and Analogues
  作者：Lin-Ya Huang、Shih-Hsien Huang、Ya-Chih Chang、Wei-Chieh Cheng、Ting-Jen R. Cheng、Chi-Huey Wong

  DOI：10.1002/anie.201402313

  日期：2014.7.28

  polymerizes lipid II into peptidoglycan and is one of the most favorable targets because of its vital role in peptidoglycan synthesis. Described in this study is a practical enzymatic method for the synthesis of lipid II, coupled with cofactor regeneration, to give the product in a 50–70 % yield. This development depends on two key steps: the overexpression of MraY for the synthesis of lipid I and the

  抗生素抗性的出现促使人们积极研究具有新作用方式的抗生素。在所有必需的细菌蛋白中，转糖基化酶将脂质II聚合成肽聚糖，并且由于其在肽聚糖合成中的重要作用而成为最有利的靶标之一。在这项研究中描述的是一种实用的酶促方法，可以合成脂质II，并辅以辅因子再生，从而以50-70％的收率获得该产品。这一发展取决于两个关键步骤：MraY在脂质I合成中的过表达和十一碳烯醇激酶在制备聚戊二烯磷酸酯中的应用。该方法进一步应用于脂质II类似物的合成。已经发现，MraY和十一碳烯醇激酶可以接受包含各种长度和构型的多种脂质。还评估了脂质II类似物对细菌转葡聚糖酶的活性。