(E)-(2R,3S,4S,6R,7S,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl 3,7,11-trihydroxy-2,4,6,10-tetramethyltridec-8-eneioic acid | 858371-86-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (E)-(2R,3S,4S,6R,7S,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl 3,7,11-trihydroxy-2,4,6,10-tetramethyltridec-8-eneioic acid
• 英文别名: (2R,3S,4S,6R,7S,8E,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl-3,7,11-trihydroxy-2,4,6,10-tetramethyltridec-8-enethioate；S-(2-acetamidoethyl) (E,2R,3S,4S,6R,7S,10R,11R)-3,7,11-trihydroxy-2,4,6,10-tetramethyltridec-8-enethioate
• CAS: 858371-86-5
• 化学式: C₂₁H₃₉NO₅S
• 分子量: 417.61
• InChiKey: RBKLDOCLZAJFRW-OSENBINTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-(2R,3S,4S,6R,7S,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl 3,7,11-trihydroxy-2,4,6,10-tetramethyltridec-8-eneioic acid 在 manganese(IV) oxide 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以35%的产率得到(2R,3S,4S,6R,7R/S,8E,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl-3,11-dihydroxy-2,4,6,10-tetramethyl-7-oxotridec-8-enethioate
  参考文献：
  名称：

  使用天然五肽和六肽链延长中间体的皮克霉素生物合成的生化研究

  摘要：

  pikromycin (Pik) 聚酮化合物合成酶生成 12 和 14 元环大环内酯的独特能力为探索聚酮化合物合成的基本过程提供了机会，特别是链延伸、酮基加工、酰基链释放和大环化。我们合成了天然五肽和六酮链延长中间体作为 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯，并将它们用作与工程化 PikAIII+TE 以及与天然 PikAIII（模块 5）和 PikAIV（模块 6）组合进行体外转化的底物) 多功能蛋白质。这项研究直接证明了这些单体模块在催化一个或两个扩链反应、酮基加工步骤、酰基-ACP 释放、环化生成10-脱氧甲炔内酯和萘内酯。结果揭示了 Pik 单体对其天然聚酮化合物底物的极大偏好，并提供了与先前使用非天然二酮 NAC 硫酯底物的研究的重要比较分析。

  DOI：

  10.1021/ja042592h
• 作为产物：
  描述：

  (S)-4-benzyl-3-((2S,3R)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-2-methylpentanoyl)oxazolidin-2-one 在 4-二甲氨基吡啶 、 锂硼氢 、 ammonium heptamolybdate 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 氢氟酸 、 双氧水 、 双(三甲基硅烷基)氨基钾 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 生成 (E)-(2R,3S,4S,6R,7S,10R,11R)-S-2-acetamidoethyl 3,7,11-trihydroxy-2,4,6,10-tetramethyltridec-8-eneioic acid
  参考文献：
  名称：

  线性糖苷配基是甲基霉素生物合成中糖基转移酶 DesVII 的底物：分析和启示

  摘要：

  大环内酯类抗生素的两个基本结构成分是聚酮苷元和附加糖。苷元的形成由聚酮合酶 (PKS) 催化，糖基化由适当的糖基转移酶催化。虽然已经表明糖基化发生在环状苷元从 PKS 释放后，但尚不清楚与酰基载体蛋白 (ACP) 结合的线性聚酮链是否也可以被相应的糖基转移酶处理。为了探索这种可能性，以线性形式化学合成了作为 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯的糖苷配基 10-脱氧甲炔内酯，它是甲霉素和新甲霉素的前体。随后在专用糖基转移酶 DesVII 和激活剂 DesVIII 存在下与 TDP-d-desosamine 孵育，产生极性更强的产物，其高分辨率质量与预期的糖基化产物一致。该研究首次证明大环内酯糖基转移酶也可以识别和加工其大环内酯底物的线性前体，但活性降低但可测量。

  DOI：

  10.1021/ja058433v

文献信息

• Chemoenzymatic Synthesis of the Polyketide Macrolactone 10-Deoxymethynolide
  作者：Courtney C. Aldrich、Lakshmanan Venkatraman、David H. Sherman、Robert A. Fecik

  DOI：10.1021/ja0504340

  日期：2005.6.1

  the natural product 10-deoxymethynolide. A steady-state kinetic analysis of the hexaketide chain intermediate with Pik TE was done. A preliminary substrate specificity study with unnatural hexaketide analogues was accomplished, demonstrating the importance of total synthesis in obtaining access to advanced polyketide intermediates. The results show the sensitivity of Pik TE to minor substrate modifications

  聚酮合酶衍生的皮克霉素硫酯酶 (Pik TE)​​ 具有独特的催化 12 和 14 元大环内酯环化的能力。在这项研究中，天然六酮链延长中间体作为其 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯的全合成已经实现，其与 Pik TE 的反应证明了 Pik TE 催化其大环内酯化成天然产物 10-脱氧甲炔内酯。使用 Pik TE 对六酮链中间体进行稳态动力学分析。完成了对非天然六酮化合物类似物的初步底物特异性研究，证明了全合成在获得高级聚酮化合物中间体方面的重要性。结果表明 Pik TE 对微小的底物修饰敏感，
• Biochemical Investigation of Pikromycin Biosynthesis Employing Native Penta- and Hexaketide Chain Elongation Intermediates
  作者：Courtney C. Aldrich、Brian J. Beck、Robert A. Fecik、David H. Sherman

  DOI：10.1021/ja042592h

  日期：2005.6.1

  the pikromycin (Pik) polyketide synthase to generate 12- and 14-membered ring macrolactones presents an opportunity to explore the fundamental processes underlying polyketide synthesis, specifically the mechanistic details of chain extension, keto group processing, acyl chain release, and macrocyclization. We have synthesized the natural pentaketide and hexaketide chain elongation intermediates as N-acetyl

  pikromycin (Pik) 聚酮化合物合成酶生成 12 和 14 元环大环内酯的独特能力为探索聚酮化合物合成的基本过程提供了机会，特别是链延伸、酮基加工、酰基链释放和大环化。我们合成了天然五肽和六酮链延长中间体作为 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯，并将它们用作与工程化 PikAIII+TE 以及与天然 PikAIII（模块 5）和 PikAIV（模块 6）组合进行体外转化的底物) 多功能蛋白质。这项研究直接证明了这些单体模块在催化一个或两个扩链反应、酮基加工步骤、酰基-ACP 释放、环化生成10-脱氧甲炔内酯和萘内酯。结果揭示了 Pik 单体对其天然聚酮化合物底物的极大偏好，并提供了与先前使用非天然二酮 NAC 硫酯底物的研究的重要比较分析。
• Linear Aglycones Are the Substrates for Glycosyltransferase DesVII in Methymycin Biosynthesis:  Analysis and Implications
  作者：Chai-Lin Kao、Svetlana A. Borisova、Hak Joong Kim、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/ja058433v

  日期：2006.5.1

  The two essential structural components of macrolide antibiotics are the polyketide aglycone and the appended sugars. The aglycone formation is catalyzed by polyketide synthase (PKS), and glycosylation is catalyzed by an appropriate glycosyltransferase. Although it has been shown that glycosylation occurs after the cyclic aglycone is released from PKS, it is not known whether the acyl carrier protein

  大环内酯类抗生素的两个基本结构成分是聚酮苷元和附加糖。苷元的形成由聚酮合酶 (PKS) 催化，糖基化由适当的糖基转移酶催化。虽然已经表明糖基化发生在环状苷元从 PKS 释放后，但尚不清楚与酰基载体蛋白 (ACP) 结合的线性聚酮链是否也可以被相应的糖基转移酶处理。为了探索这种可能性，以线性形式化学合成了作为 N-乙酰半胱胺 (NAC) 硫酯的糖苷配基 10-脱氧甲炔内酯，它是甲霉素和新甲霉素的前体。随后在专用糖基转移酶 DesVII 和激活剂 DesVIII 存在下与 TDP-d-desosamine 孵育，产生极性更强的产物，其高分辨率质量与预期的糖基化产物一致。该研究首次证明大环内酯糖基转移酶也可以识别和加工其大环内酯底物的线性前体，但活性降低但可测量。