spiruchostatin A | 328548-11-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: spiruchostatin A
• 英文别名: SP-1；(1S,5S,6R,9S,15E,20R)-5-hydroxy-20-methyl-6-propan-2-yl-2-oxa-11,12-dithia-7,19,22-triazabicyclo[7.7.6]docos-15-ene-3,8,18,21-tetrone
• CAS: 328548-11-4
• 化学式: C₂₀H₃₁N₃O₆S₂
• 分子量: 473.615
• InChiKey: XFLBOEMFLGLWFF-HDXRNPEWSA-N

物化性质

• 沸点：
  865.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.190±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  ethyl (4R)-4-<(tert-butyloxycarbonyl)amino>-3-oxo-5-methylhexanoate 在 吗啉 、 咪唑 、 2,6-二甲基吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 四(三苯基膦)钯 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 钾硼氢 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 2-甲基-6-硝基苯甲酸酐 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 碘 、 potassium carbonate 、 氟化氢吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 80.33h， 生成 spiruchostatin A
  参考文献：
  名称：

  Total Synthesis of Spiruchostatin A — A Potent Histone Deacetylase Inhibitor

  摘要：

  DOI：

  10.3987/com-07-s(n)5

文献信息

• Total Synthesis of Spiruchostatin A via Chemoselective Macrocyclization using an Accessible Enantiomerically Pure Latent Thioester
  作者：Nicole A. Calandra、Yim Ling Cheng、Kimberly A. Kocak、Justin S. Miller

  DOI：10.1021/ol900436f

  日期：2009.5.7

  HDAC inhibitor Spiruchostatin A was synthesized via a route that differs significantly from previously reported routes. The key step involves a latent thioester that initiates a chemoselective transformation similar to native chemical ligation to form the macrocyclic alanine−cysteine amide bond. The easily prepared latent thioester—the first such moiety reported in enantiomerically pure form—is designed

  HDAC抑制剂Spiruchostatin A的合成路线与以前报道的路线明显不同。关键步骤涉及潜在的硫酯，该硫酯引发类似于自然化学连接的化学选择性转化反应，形成大环丙氨酸-半胱氨酸酰胺键。易于制备的潜在硫代酯（第一个以对映体纯形式报告的此类部分）与侧链羧酸一起设计，用作固相连接剂，用于合成环状，含半胱氨酸的肽类物质。
• Total Synthesis of the Bicyclic Depsipeptide HDAC Inhibitors Spiruchostatins A and B, 5′′-<i>epi</i>-Spiruchostatin B, FK228 (FR901228) and Preliminary Evaluation of Their Biological Activity
  作者：Koichi Narita、Takuya Kikuchi、Kazuhiro Watanabe、Toshiya Takizawa、Takamasa Oguchi、Kyosuke Kudo、Keisuke Matsuhara、Hideki Abe、Takao Yamori、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1002/chem.200901552

  日期：2009.10.26

  Julia–Kocienski olefination of a 1,3‐propanediol‐derived sulfone and a L‐ or D‐malic acid‐derived aldehyde to access the most synthetically challenging unit, (3S or 3R,4E)‐3‐hydroxy‐7‐mercaptohept‐4‐enoic acid, present in a D‐alanine‐ or D‐valine‐containing segment; ii) a condensation of a D‐valine‐D‐cysteine‐ or D‐allo‐isoleucine‐D‐cysteine‐containing segment with a D‐alanine‐ or D‐valine‐containing

  双环去肽肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂spiruchostatins A和B，5'′- epi- spiruchostatin B和FK228可以通过聚合和统一的方式高效合成。合成方法涉及以下关键步骤：i）1，3-丙二醇衍生的砜和L-或D-苹果酸衍生的醛的Julia-Kocienski烯化反应，以合成最具挑战性的单元（3 S或3 R，4 E）-3-羟基-7-巯基庚基-4-烯酸，存在于含有D-丙氨酸或D-缬氨酸的链段中；ii）D-缬氨酸-D-半胱氨酸-或D的缩合-同种异体-isoleucine- d -半胱氨酸含与段d -alanine-或d含缬氨酸段直接组装相应的开环-acids; 和iii）的大环化开环使用椎名法或光延法构造必需15-或16-元大环内酯-酸。本合成已建立了螺旋藻抑素B的C5'立体化学。此外，对合成的二肽的HDAC抑制测定和细胞生长抑制分析确定了其效力的顺序，并揭示了
• Depsipeptides and Their Therapeutic Use
  申请人：Ganesan Arasu

  公开号：US20100056435A1

  公开（公告）日：2010-03-04

  A compound of the general Structure (VII) or (VIII) including isoteres and pharmaceutically acceptable salts thereof, wherein R 1 , R 2 (where X=—CONR 6 —), R 3 and R 7 are the same or different and each represents an amino-acid side chain moiety; R 2 (where X=—CHZ—), R 4 and R 6 are the same or different and each represents hydrogen, C 1 -C 6 alkyl, C 2 -C 6 alkenyl, or C 2 -C 6 alkynyl; K represents a linear or branched chain of carbon atoms and containing 1-10 atoms; L represents a moiety capable of chelating zinc in the active site of a histone deacetylase (HDAC) or of conversion to such a moiety in vivo (by hydrolysis or reduction, for example); M is a linear or branched chain of carbon or other atoms and containing 1-10 atoms, and capable of undergoing in vivo cleavage to give Structure (VII); and Z is a heteroatom bonded to the macrocycle by a single or double bond, and any other group bonded to Z is H or a protecting group.

  化合物的一般结构（VII）或（VIII）的化合物，包括同位素体和药学上可接受的盐，其中R1、R2（其中X = -CONR6-）、R3和R7相同或不同，每个代表一种氨基酸侧链基团；R2（其中X = -CHZ-）、R4和R6相同或不同，每个代表氢、C1-C6烷基、C2-C6烯基或C2-C6炔基；K代表一条含有1-10个碳原子的线性或支链；L代表一种能够在组蛋白去乙酰化酶（HDAC）的活性位点中螯合锌或在体内转化为这种基团的基团（例如通过水解或还原）；M是一条含有1-10个碳或其他原子的线性或支链，能够在体内发生裂解以得到结构（VII）；Z是通过单个或双键与大环结合的杂原子，与Z结合的任何其他基团是H或保护基团。
• NOVEL PHOSPHATIDYLINOSITOL-3-KINASE INHIBITOR AND PHARMACEUTICAL COMPOSITION
  申请人：Tohoku University

  公开号：EP2762148A1

  公开（公告）日：2014-08-06

  The purpose of the present invention is to provide a novel PI3K inhibitor. The purpose of the present invention is also to provide a substance that combines a PI3K inhibitory effect and an HDAC inhibitory effect. Finally, the present invention further provides a novel anti-cancer pharmaceutical composition containing the substance, in particular an anti-cancer pharmaceutical composition that is effective even against intractable cancer. One embodiment of the present invention is a phosphatidylinositol-3-kinase (PI3K) inhibitor comprising a depsipeptide-class compound represented by formula (1), or a physiologically acceptable salt thereof.

  本发明的目的是提供一种新型 PI3K 抑制剂。本发明的目的还在于提供一种兼具 PI3K 抑制作用和 HDAC 抑制作用的物质。最后，本发明进一步提供了一种含有该物质的新型抗癌药物组合物，特别是一种即使对难治性癌症也有效的抗癌药物组合物。本发明的一个实施方案是一种磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）抑制剂，包含由式（1）表示的去肽类化合物或其生理上可接受的盐。
• Compositions and methods for treating kabuki syndrome and related disorders
  申请人：THE JOHNS HOPKINS UNIVERSITY

  公开号：US10568854B2

  公开（公告）日：2020-02-25

  A method is provided for treating a Mendelian disorder of the epigenetic machinery (e.g., Kabuki syndrome) in a subject in need thereof. In particular, the method comprises administering to the subject a ketogenic composition in an amount sufficient to produce a physiologically acceptable ketosis in the subject. A method for selecting a subject for treatment of a Mendelian disorder of the epigenetic machinery (e.g., Kabuki syndrome) is also provided. Ketogenic compositions and kits useful for practicing the methods are also provided.

  本发明提供了一种方法，用于治疗有需要的受试者的孟德尔表观遗传机制紊乱（如卡布基综合征）。特别是，该方法包括向受试者施用生酮组合物，其用量足以在受试者体内产生生理上可接受的酮病。还提供了一种选择受试者治疗孟德尔表观遗传机制紊乱（如歌舞伎综合征）的方法。还提供了用于实施这些方法的生酮组合物和试剂盒。