Fluorogenic d-amino acids enable real-time monitoring of peptidoglycan biosynthesis and high-throughput transpeptidation assays
作者:Yen-Pang Hsu、Edward Hall、Garrett Booher、Brennan Murphy、Atanas D. Radkov、Jacob Yablonowski、Caitlyn Mulcahey、Laura Alvarez、Felipe Cava、Yves V. Brun、Erkin Kuru、Michael S. VanNieuwenhze
DOI:10.1038/s41557-019-0217-x
日期:2019.4
efficient, biocompatible probes. Here, we report the design, synthesis and application of rotor-fluorogenic D-amino acids (RfDAAs), enabling real-time, continuous tracking of transpeptidation reactions. These probes allow peptidoglycan biosynthesis to be monitored in real time by visualizing transpeptidase reactions in live cells, as well as real-time activity assays of D,D- and L,D-transpeptidases and sortases
肽聚糖是维持几乎所有细菌的形态和活力的基本细胞壁成分。它的生物合成需要周质转肽反应,在多糖链之间构建肽交联以赋予机械强度。然而,在体内和体外追踪转肽反应具有挑战性,主要是由于缺乏有效的、生物相容的探针。在这里,我们报告了转子荧光 D-氨基酸 (RfDAA) 的设计、合成和应用,能够实时、连续地跟踪转肽反应。这些探针可以通过可视化活细胞中的转肽酶反应以及体外 D,D-和 L,D-转肽酶和分选酶的实时活性测定来实时监测肽聚糖的生物合成。