1',2'-dideoxy-1'β-(4-mercaptophenyl)-D-ribofuranose | 705971-56-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1',2'-dideoxy-1'β-(4-mercaptophenyl)-D-ribofuranose
• 英文别名: (2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(4-sulfanylphenyl)oxolan-3-ol
• CAS: 705971-56-8
• 化学式: C₁₁H₁₄O₃S
• 分子量: 226.296
• InChiKey: UPCVTTCZPZFJLQ-HBNTYKKESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  50.7
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1',2'-dideoxy-1'β-(4-mercaptophenyl)-D-ribofuranose 在 吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 Thiobenzoic acid S-(4-{(2R,4S,5R)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-phenyl) ester
  参考文献：
  名称：

  含有巯基C-核苷的DNA的合成和氧化还原活性碱基配对特性

  摘要：

  在这里，我们描述了携带巯基苯酚的核苷碱基类似物C-脱氧核糖核苷3的合成和掺入。1'-β化合物3是通过Friedel-Crafts烷基化反应，然后进行脱保护反应合成的。在SnCl 4的存在下，与3,5-ditoluoyl-1-α/β-甲氧基-2-deoxy-d-核糖和二苯二硫的偶联反应得到α/β混合物2（β/α= 2.8），用硅胶色谱法分离β型。形成亚磷酰胺衍生物后，将C-核苷3掺入DNA中。当将巯基碱基掺入互补的单链（ss）DNA中时，在使用鼓泡O处理后，所得双链体显示出高的热稳定性。2（T m 73℃），但在巯基乙醇存在下（T m 33℃）不稳定。CD谱显示该双链体具有右旋双链结构。氨基质子NMR的温度稳定性研究表明，鼓泡的O 2处理的巯基C-核苷周围的氢键结合强度大于还原剂处理的氢键结合强度。因此，碱对碱二硫键的形成增加了双链体的稳定性。相应地，将二硫键还原为两个硫醇碱基可逆地使DNA

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.12.038
• 作为产物：
  描述：

  (6aR,9aS)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydro-8H-furo[3,2-f ][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-one 在 三乙基硅烷 、 正丁基锂 、 三氟化硼乙醚 、 四丁基氟化铵 、 三乙胺 、 乙硫醇 、 2-巯基乙醇 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 1',2'-dideoxy-1'β-(4-mercaptophenyl)-D-ribofuranose
  参考文献：
  名称：

  使用锂化的偶联反应改进了以对苯硫醇为碱的巯基C-核苷的合成

  摘要：

  我们已经开发了一种使用有机金属试剂合成具有苯基硫醇基的巯基C-核苷的新途径。掺入氧化还原活性核碱基类似物的双链体在氧化条件下显示出高的熔融温度。最初，我们预期在路易斯酸存在下，通过双（甲苯甲酰基）保护的核糖和叔丁基苯基硫化物的弗里德-克来福特偶联反应，可以生产巯基C-核苷。然而，不期望的偶合化合物通过开裂而形成的小号-叔丁基组的小号-叔丁基苯基由路易斯酸（BF硫化物3的Et 2 O，的SnCl 4）。但是，巯基C-核苷的高度立体选择性合成是通过在对二硅氧烷保护的2-脱氧核糖内酯中加入对-（叔丁基）硫代苯基锂来实现的。该路线在所有步骤中均显示出中等良好的产量。在苯基上与硫原子偶联的叔丁基部分被转化为2-硝基苯基亚硫基（Nps），并且Nps基团易于被乙硫醇裂解，得到所需化合物及其二硫键二聚体。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2014.12.085

文献信息

• Synthesis and characterization of a DNA analogue stabilized by mercapto C-nucleoside induced disulfide bonding
  作者：Akihiko Hatano、Seiji Makita、Masayuki Kirihara

  DOI：10.1016/j.bmcl.2004.03.015

  日期：2004.5

  A redox-active nucleobase analogue of a nucleotide was synthesized and incorporated into DNA using phosphoramidite chemistry. An analogue-containing oligonucleotide in the absence of a reducing reagent formed a stable duplex with a substantially higher melting temperature compared to that of a standard DNA duplex of the same length. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Improved synthesis of mercapto C-nucleoside possessing p-phenyl thiol as base using a lithiated coupling reaction
  作者：Akihiko Hatano、Munehiro Okada、Kentaro Dezaki、Seitaro Hirai

  DOI：10.1016/j.tet.2014.12.085

  日期：2015.2

  undesired coupling compound was formed by cleavage of the S-tert-butyl group of S-tert-butyl phenyl sulfide by Lewis acids (BF3 Et2O, SnCl4). The highly stereoselective synthesis of mercapto C-nucleoside was, however, achieved by the addition of p-(tert-butyl)thiophenyllithium to a disiloxane-protected 2-deoxyribonolactone. This route showed moderately good yield at all steps. The tert-butyl moiety coupled

  我们已经开发了一种使用有机金属试剂合成具有苯基硫醇基的巯基C-核苷的新途径。掺入氧化还原活性核碱基类似物的双链体在氧化条件下显示出高的熔融温度。最初，我们预期在路易斯酸存在下，通过双（甲苯甲酰基）保护的核糖和叔丁基苯基硫化物的弗里德-克来福特偶联反应，可以生产巯基C-核苷。然而，不期望的偶合化合物通过开裂而形成的小号-叔丁基组的小号-叔丁基苯基由路易斯酸（BF硫化物3的Et 2 O，的SnCl 4）。但是，巯基C-核苷的高度立体选择性合成是通过在对二硅氧烷保护的2-脱氧核糖内酯中加入对-（叔丁基）硫代苯基锂来实现的。该路线在所有步骤中均显示出中等良好的产量。在苯基上与硫原子偶联的叔丁基部分被转化为2-硝基苯基亚硫基（Nps），并且Nps基团易于被乙硫醇裂解，得到所需化合物及其二硫键二聚体。
• Synthesis and redox-active base-pairing properties of DNA incorporating mercapto C-nucleosides
  作者：Akihiko Hatano、Seiji Makita、Masayuki Kirihara

  DOI：10.1016/j.tet.2004.12.038

  日期：2005.2

  73 °C), but was destabilized in the presence of mercaptoethanol (Tm 33 °C). CD spectra showed that the duplex had a right-handed double-stranded structure. Imino proton NMR studies of temperature stability suggested that the strength of hydrogen bonding around the mercapto C-nucleoside was larger when treated with bubbling O2 than when in treated with reducing agent. Thus, formation of the base-to-base

  在这里，我们描述了携带巯基苯酚的核苷碱基类似物C-脱氧核糖核苷3的合成和掺入。1'-β化合物3是通过Friedel-Crafts烷基化反应，然后进行脱保护反应合成的。在SnCl 4的存在下，与3,5-ditoluoyl-1-α/β-甲氧基-2-deoxy-d-核糖和二苯二硫的偶联反应得到α/β混合物2（β/α= 2.8），用硅胶色谱法分离β型。形成亚磷酰胺衍生物后，将C-核苷3掺入DNA中。当将巯基碱基掺入互补的单链（ss）DNA中时，在使用鼓泡O处理后，所得双链体显示出高的热稳定性。2（T m 73℃），但在巯基乙醇存在下（T m 33℃）不稳定。CD谱显示该双链体具有右旋双链结构。氨基质子NMR的温度稳定性研究表明，鼓泡的O 2处理的巯基C-核苷周围的氢键结合强度大于还原剂处理的氢键结合强度。因此，碱对碱二硫键的形成增加了双链体的稳定性。相应地，将二硫键还原为两个硫醇碱基可逆地使DNA