(6aR,9aS)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydro-8H-furo[3,2-f ][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-one | 169526-37-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 内酯类
• 英文名称: (6aR,9aS)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydro-8H-furo[3,2-f ][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-one
• 英文别名: 2-Deoxy-3,5-O-[1,1,3,3-tetrakis(1-methylethyl)-1,3-disiloxanediyl]-D-erythro-pentonic acid, γ-lactone；3',5'-O-((1,1,3,3-tetraisopropyl)disiloxanediyl)-2'-deoxy-D-ribono-1',4'-lactone；3',5'-O-((1,1,3,3-tetraisopropyl)disiloxanediyl)-2'-deoxy-D-ribono-1,4-lactone；3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-deoxy-D-ribono-1,4-lactone；2-deoxy-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)-D-ribono-1,4-lactone；3,5-O-((1,1,3,3-tetraisopropyl)disiloxanediyl)-2-deoxy-D-ribono-1,4-lactone；(6aR,9aS)-2,2,4,4-Tetraisopropyldihydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8(6aH)-one；(6aR,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6,6a,9,9a-tetrahydrofuro[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-one
• CAS: 169526-37-8
• 化学式: C₁₇H₃₄O₅Si₂
• 分子量: 374.625
• InChiKey: VKUSERFNLBNDGI-JKSUJKDBSA-N

物化性质

• 沸点：
  383.7±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.02±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.26
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  54
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (6aR,9aS)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydro-8H-furo[3,2-f ][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-one 在 吡啶 、 三乙基硅烷 、 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 三氟化硼乙醚 、 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 10.5h， 生成 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl)oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  Towards a DNA-Like Duplex Without Hydrogen Bonds

  摘要：

  The inverse quadrupolar moments of the phenyl and pentafluorophenyl residues in the base pair P-F-5 promotes strong intramolecular stacking interactions in DNA duplexes. The more natural base pairs are replaced by this novel pair the higher the thermodynamic stability of the resulting duplex if they are arranged in an alternating fashion.

  DOI：

  10.1081/ncn-120022831
• 作为产物：
  描述：

  2-deoxy-D-ribose 在 咪唑 、 溴 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 120.0h， 生成 (6aR,9aS)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydro-8H-furo[3,2-f ][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-one
  参考文献：
  名称：

  受立体电子效应控制的甲硅烷基保护的五元环氧代碳鎓离子的亲核加成

  摘要：

  研究了一系列含有二硅氧烷环的稠合双环缩醛，以评估甲硅烷基保护的 2-脱氧核糖系统中的选择性来源。二硅氧烷环出人意料地使阳离子的双轴构象异构体能够通过 C-3 处的负电原子稳定。这种低能构象异构体随后经历立体电子控制的亲核加成，得到具有高非对映选择性的取代四氢呋喃。

  DOI：

  10.1021/jo400945j

文献信息

• Optimization of Interstrand Hydrophobic Packing Interactions within Unnatural DNA Base Pairs
  作者：Shigeo Matsuda、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/ja047291m

  日期：2004.11.1

  As part of an effort to expand the genetic alphabet, we have evaluated a large number of predominantly hydrophobic unnatural base pairs. We now report the synthesis and stability of unnatural base pairs formed between simple phenyl rings modified at different positions with methyl groups. Surprisingly, several of the unnatural base pairs are virtually as stable as a natural base pair in the same sequence

  作为扩大遗传字母表努力的一部分，我们评估了大量主要为疏水性的非天然碱基对。我们现在报告在不同位置用甲基修饰的简单苯环之间形成的非天然碱基对的合成和稳定性。令人惊讶的是，在同一序列环境中，一些非天然碱基对实际上与天然碱基对一样稳定。结果表明，双链 DNA 内的碱基对稳定性既不需要氢键键合，也不需要大的芳香族表面积，并且可以优化小芳香环之间的链间相互作用以提高稳定性和选择性。这些较小的核碱基预计不会引起双链 DNA 或引物末端的扭曲，这些扭曲似乎限制了较大的非天然碱基对的复制，
• Nonpolar thymidine analogs
  申请人：Kool Todd Eric

  公开号：US20070065360A1

  公开（公告）日：2007-03-22

  Nonpolar thymidine analogs are provided comprising a dihalogenated or trihalogenated base of the structure: where R 1 is a sugar moiety; R 2 is H or CH 3 ; an imaging moiety or a cytotoxic moiety and X 1 and X 2 are independently selected from I, Cl, Br, and F, with the proviso that not more than one F will be present at these positions.

  提供了非极性的胸腺嘧啶类似物，包括结构为的二卤化或三卤化碱基，其中R1是糖基；R2是H或CH3；成像基团或细胞毒基团，以及X1和X2分别选自I、Cl、Br和F，但F在这些位置上不会超过一个。
• A metallo base-pair incorporating a terpyridyl-like motif: bipyridyl-pyrimidinone·Ag(i)·4-pyridine
  作者：Dongwon Shin、Christopher Switzer

  DOI：10.1039/b709291a

  日期：——

  The design and characterization of a geometrically unique, metallo base-pair motif is reported.

  报道了一种几何独特的金属碱基对模体的设计和表征。
• Preparation of Stilbene-Tethered Nonnatural Nucleosides for Use with Blue-Fluorescent Antibodies
  作者：Da-Wei Chen、Beuscher、Raymond C. Stevens、Peter Wirsching、Richard A. Lerner、Kim D. Janda

  DOI：10.1021/jo001676f

  日期：2001.3.1

  The synthesis of the first examples of stilbene-tethered hydrophobic C-nucleosides is described. Compounds of this type are targeted for use with our recently reported "blue-fluorescent antibodies" with the aim of probing native and nonnatural DNA. The nucleophilic addition of aryl Grignard reagents to either a protected 2'-deoxy-1'-chloro-ribofuranose or a protected 2'-deoxy-ribonolactone was the

  描述了1，2，5-二苯乙烯系的疏水性C-核苷的合成。这类化合物的目标是与我们最近报道的“蓝色荧光抗体”一起使用，目的是探测天然和非天然的DNA。芳基格氏试剂亲核加成到保护的2'-脱氧-1'-氯-呋喃核糖或保护的2'-脱氧核糖内酯是关键的合成步骤，并以良好的收率提供了C-核苷。两种途径均导致最终产物为β-端基异构体的> / = 90％。评估了反式二苯乙烯与核碱基连接的酰胺基和醚基接头在合成过程中以及配体与蓝色荧光单克隆抗体结合中的效用。获得了每种复合物的X射线结构，并将其用作第二代二苯乙烯连接的C-核苷的指南。这些疏水性核苷的开发将在当前的天然和非天然DNA研究中有用，并且对于将来关于新型非天然基因组的研究具有宝贵的意义。
• Improved synthesis of mercapto C-nucleoside possessing p-phenyl thiol as base using a lithiated coupling reaction
  作者：Akihiko Hatano、Munehiro Okada、Kentaro Dezaki、Seitaro Hirai

  DOI：10.1016/j.tet.2014.12.085

  日期：2015.2

  undesired coupling compound was formed by cleavage of the S-tert-butyl group of S-tert-butyl phenyl sulfide by Lewis acids (BF3 Et2O, SnCl4). The highly stereoselective synthesis of mercapto C-nucleoside was, however, achieved by the addition of p-(tert-butyl)thiophenyllithium to a disiloxane-protected 2-deoxyribonolactone. This route showed moderately good yield at all steps. The tert-butyl moiety coupled

  我们已经开发了一种使用有机金属试剂合成具有苯基硫醇基的巯基C-核苷的新途径。掺入氧化还原活性核碱基类似物的双链体在氧化条件下显示出高的熔融温度。最初，我们预期在路易斯酸存在下，通过双（甲苯甲酰基）保护的核糖和叔丁基苯基硫化物的弗里德-克来福特偶联反应，可以生产巯基C-核苷。然而，不期望的偶合化合物通过开裂而形成的小号-叔丁基组的小号-叔丁基苯基由路易斯酸（BF硫化物3的Et 2 O，的SnCl 4）。但是，巯基C-核苷的高度立体选择性合成是通过在对二硅氧烷保护的2-脱氧核糖内酯中加入对-（叔丁基）硫代苯基锂来实现的。该路线在所有步骤中均显示出中等良好的产量。在苯基上与硫原子偶联的叔丁基部分被转化为2-硝基苯基亚硫基（Nps），并且Nps基团易于被乙硫醇裂解，得到所需化合物及其二硫键二聚体。