(R)-2-(3-((tert-butoxycarbonyl)(methyl)amino)-4-methylpentyl)thiazole-4-carboxylic acid | 1053805-76-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: (R)-2-(3-((tert-butoxycarbonyl)(methyl)amino)-4-methylpentyl)thiazole-4-carboxylic acid
• 英文别名: 2-{(3R)-3-[(tert-butoxycarbonyl)(methyl)amino]-4-methylpentyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid；2-[(3R)-4-methyl-3-[methyl-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]pentyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid
• CAS: 1053805-76-7
• 化学式: C₁₆H₂₆N₂O₄S
• 分子量: 342.459
• InChiKey: BFRKNKGZOYDIGR-GFCCVEGCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-2-(3-((tert-butoxycarbonyl)(methyl)amino)-4-methylpentyl)thiazole-4-carboxylic acid 在 lithium hydroxide monohydrate 、 三(2-氨基乙基)胺 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 46.08h， 生成 pretubulysin D
  参考文献：
  名称：

  天然和设计的微管溶素的全合成和生物学评价

  摘要：

  描述了基于 CH 激活策略的 N(14)-去乙酰氧基微管溶素 H (Tb1) 的简化全合成和 pretubulysin D (PTb-D43) 的短全合成。还报告了所开发的合成策略和技术在合成一系列微管溶素类似物（Tb2-Tb41 和 PTb-D42）中的应用。针对一系列癌细胞的合成化合物的生物学评估揭示了许多新的类似物（例如，Tb14），其中一些对某些细胞系具有特殊的效力[例如，Tb32 对 MES SA（子宫肉瘤）细胞系的 IC50 = 12 pM和 2 pM 针对 HEK 293T（人胚胎肾）细胞系]，以及一组有价值的构效关系。

  DOI：

  10.1021/jacs.5b12557
• 作为产物：
  描述：

  2-甲基-2-丙基[(2R)-1-氰基-3-甲基-2-丁烷基]氨基甲酸酯 在 sodium chlorite 、 sodium tetrahydroborate 、 正丁基锂 、 sodium dihydrogenphosphate dihydrate 、 2-甲基-2-丁烯 、 四溴化碳 、 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 、 二异丁基氢化铝 、 戴斯-马丁氧化剂 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 mineral oil 、 叔丁醇 、 苯 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 (R)-2-(3-((tert-butoxycarbonyl)(methyl)amino)-4-methylpentyl)thiazole-4-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  天然和设计的微管溶素的全合成和生物学评价

  摘要：

  描述了基于 CH 激活策略的 N(14)-去乙酰氧基微管溶素 H (Tb1) 的简化全合成和 pretubulysin D (PTb-D43) 的短全合成。还报告了所开发的合成策略和技术在合成一系列微管溶素类似物（Tb2-Tb41 和 PTb-D42）中的应用。针对一系列癌细胞的合成化合物的生物学评估揭示了许多新的类似物（例如，Tb14），其中一些对某些细胞系具有特殊的效力[例如，Tb32 对 MES SA（子宫肉瘤）细胞系的 IC50 = 12 pM和 2 pM 针对 HEK 293T（人胚胎肾）细胞系]，以及一组有价值的构效关系。

  DOI：

  10.1021/jacs.5b12557

文献信息

• [EN] DESACETOXYTUBULYSIN H AND ANALOGS THEREOF<br/>[FR] DÉSACÉTOXYTUBULYSINE H ET SES ANALOGUES
  申请人：UNIV RICE WILLIAM M

  公开号：WO2016138288A1

  公开（公告）日：2016-09-01

  In one aspect, the present disclosure provides tubulysin analogs of the formula (I) wherein R1, R2, R3, R4, X1, X2, X3, and A1 are as defined herein. In another aspect, the present disclosure also provides methods of preparing the compounds disclosed herein. In another aspect, the present disclosure also provides pharmaceutical compositions and methods of use of the compounds disclosed herein.

  在一个方面，本公开提供了公式（I）的tubulysin类似物，其中R1、R2、R3、R4、X1、X2、X3和A1如本文所定义。在另一个方面，本公开还提供了制备本公开化合物的方法。在另一个方面，本公开还提供了药物组合物和使用本公开化合物的方法。
• Improved Total Synthesis of Tubulysins and Design, Synthesis, and Biological Evaluation of New Tubulysins with Highly Potent Cytotoxicities against Cancer Cells as Potential Payloads for Antibody–Drug Conjugates
  作者：K. C. Nicolaou、Rohan D. Erande、Jun Yin、Dionisios Vourloumis、Monette Aujay、Joseph Sandoval、Stefan Munneke、Julia Gavrilyuk

  DOI：10.1021/jacs.7b12692

  日期：2018.3.14

  streamlined total syntheses of natural tubulysins such as V (Tb45) and U (Tb46) and pretubulysin D (PTb-D43), and their application to the synthesis of designed tubulysin analogues (Tb44, PTb-D42, PTb-D47-PTb-D49, and Tb50-Tb120), are described. Cytotoxicity evaluation of the synthesized compounds against certain cancer cell lines revealed a number of novel analogues with exceptional potencies [e.g., Tb111:

  V (Tb45) 和 U (Tb46) 和 pretubulysin D (PTb-D43) 等天然微管溶素的改进、简化的全合成，以及它们在合成设计的微管溶素类似物（Tb44、PTb-D42、PTb-D47-PTb）中的应用-D49 和 Tb50-Tb120)，进行了描述。合成化合物对某些癌细胞系的细胞毒性评估揭示了许多具有特殊效力的新型类似物[例如，Tb111：IC50 = 40 pM 对 MES SA（子宫肉瘤）细胞系；针对 HEK 293T（人胚胎肾癌）细胞系的 IC50 = 6 pM；和 IC50 = 1.54 nM，对 MES SA DX（具有明显多重耐药性的 MES SA）细胞系]。这些研究产生了一组有价值的构效关系，为进一步的分子设计、合成和生物学评价研究提供指导。
• Design, synthesis and antitumor activity evaluation of pretubulysin analogs
  作者：Xiangrong Xu、Meixia Fan、Junhui Qi、Lei Yao

  DOI：10.1111/cbdd.13852

  日期：——

  lines. Although there are several total synthesis routes to tubulysin and pretubulysin reported, the commercialization still has been hampered due to the complexity of the structure. To find structurally simpler pretubulysin analogs, a series of 2-(3-(methylamino)propyl)thiazole-4-carboxamides are designed and synthesized, and their anticancer activities are screened using MCF-7 (breast cancer), and NCI-H157

  Pretubulysin 是微管溶素的生物合成前体，在多种肿瘤细胞系中显示出强大的生物活性。尽管已有多种微管溶素和预微管溶素全合成路线的报道，但由于结构复杂，商业化仍受到阻碍。为了寻找结构更简单的预管溶素类似物，设计并合成了一系列 2-(3-(甲基氨基)丙基)噻唑-4-甲酰胺，并使用 MCF-7（乳腺癌）和 NCI-H157 筛选了它们的抗癌活性。肺癌）细胞系。紫杉醇 (IC 50  = 0.01 µM) 和 pretubulysin 用作对照。化合物8c (IC 50  = 0.05 µM, MCF-7; 0.09 µM, NCI-H157) 和8h (IC 50 = 0.01 µM，MCF-7；0.02 µM, NCI-H157) 表现出与紫杉醇相当的某些抗肿瘤活性。Pretubulysin 的尿素类似物可能是进一步开发新型抗肿瘤药物的有前途的支架。
• Total Synthesis and Biological Evaluation of Tubulysin Analogues
  作者：Raffaele Colombo、Zhiyong Wang、Junyan Han、Raghavan Balachandran、Hikmat N. Daghestani、Daniel P. Camarco、Andreas Vogt、Billy W. Day、David Mendel、Peter Wipf

  DOI：10.1021/acs.joc.6b01314

  日期：2016.11.4

  preserve the exquisite biological activity of acid 1 and offer the opportunity for effective conjugation to cell type-targeting moieties. All analogues had antiproliferative activities in the high picomolar to low nanomolar range and caused apoptosis and mitotic arrest as measured in a high content nuclear morphology assay. The ten synthetic agents described herein spanned a range of almost 4 orders of

  我们报告了第二代合成的非常有力的抗有丝分裂剂N 14 -desacetoxytubulysin H（1）以及该铅结构的九个类似物的制备。我们合成工作的重点包括高效的后期功能化，可用于制备新的侧链和主链修饰的类似物。我们还发现了保留酸1精湛生物活性的C末端修饰并提供了与细胞类型靶向部分有效结合的机会。所有类似物均具有高皮摩尔至低纳摩尔范围的抗增殖活性，并导致细胞凋亡和有丝分裂阻滞，如通过高含量核形态学测定所测。本文所述的十种合成剂的生物学活性跨越了几乎四个数量级的范围，并且说明了发现基于天然产物前导物的非常有效的抗增殖化合物的持续潜力。
• Pretubulysin derived probes as novel tools for monitoring the microtubule network via activity-based protein profiling and fluorescence microscopy
  作者：Jürgen Eirich、Jens L. Burkhart、Angelika Ullrich、Georg C. Rudolf、Angelika Vollmar、Stefan Zahler、Uli Kazmaier、Stephan A. Sieber

  DOI：10.1039/c2mb25144b

  日期：——

  Microtubules (mt) are highly dynamic polymers composed of alpha- and beta-tubulin monomers that are present in all dividing and non-dividing cells. A broad variety of natural products exists that are known to interfere with the microtubule network, by either stabilizing or de-stabilizing these rope-like polymers. Among those tubulysins represent a new and potent class of cytostatic tetrapeptides originating from myxobacteria. Early studies suggested that tubulysins interact with the eukaryotic cytoskeleton by inhibition of tubulin polymerization with EC50 values in the picomolar range. Recently, pretubulysins have been described to retain the high tubulin-degradation activity of their more complex tubulysin relatives and represent an easier synthetic target with an efficient synthesis already in place. Although tubulin has been suggested as the dedicated target of tubulysin a comprehensive molecular target analysis of pretubulysin in the context of the whole proteome has not been carried out so far. Here we utilize synthetic chemistry to develop two pretubulysin photoaffinity probes which were applied in cellular activity-based protein profiling and imaging studies in order to unravel and visualize dedicated targets. Our results clearly show a remarkable selectivity of pretubulysin for beta-tubulin which we independently confirmed by a mass-spectrometry based proteomic profiling platform as well as by tubulin antibody based co-staining on intact cells.

  微管（mt）是由α-和β-微管蛋白单体组成的高动态聚合物，存在于所有分裂和非分裂细胞中。已知有多种天然产品可以通过稳定或降低这些绳状聚合物的稳定性来干扰微管网络。其中，管胞素（tubulysins）是一类新型、强效的细胞抑制四肽，源自粘杆菌。早期研究表明，tubulysins 通过抑制微管蛋白聚合与真核细胞骨架相互作用，其 EC50 值在皮摩尔范围内。最近，前管胞素（pretubulysins）被描述为保留了其更复杂的管胞素近亲的高管胞素降解活性，并且是一种更容易合成的目标，其高效合成已经到位。尽管管蛋白被认为是管胞素的专用靶标，但迄今为止还没有在整个蛋白质组的背景下对前管胞素进行过全面的分子靶标分析。在此，我们利用合成化学方法开发了两种pretubulysin光亲和探针，并将其应用于基于细胞活性的蛋白质分析和成像研究，以揭示和观察专用靶标。我们的研究结果清楚地表明，pretubulysin 对 beta-tubulin（β-微管蛋白）具有显著的选择性，这一点我们已通过基于质谱分析的蛋白质组学分析平台以及基于微管蛋白抗体的完整细胞共染色得到了独立证实。