Probing Synergy between Two Catalytic Strategies in the Glycoside Hydrolase <i>O</i>-GlcNAcase Using Multiple Linear Free Energy Relationships
作者:Ian R. Greig、Matthew S. Macauley、Ian H. Williams、David J. Vocadlo
DOI:10.1021/ja904506u
日期:2009.9.23
revealing changes in mechanism, transition state, and rate-determining step upon concomitant variation of both nucleophilic strength and leaving group abilities are observed. The observed changes in mechanism reflect the roles played by the enzymic general acid and the catalytic nucleophile. Significantly, these results illustrate how the enzyme synergistically harnesses both modes of catalysis; a feature that
人类 O-GlcNAcase 在调节丝氨酸和苏氨酸残基与 β-O 连接的 N-乙酰氨基葡萄糖单糖单元 (O-GlcNAc) 的翻译后修饰方面发挥着重要作用。O-GlcNAcase 的机制涉及底物的 2-乙酰氨基基团的亲核参与以取代糖苷连接的离去基团。这种酶对底物结构变化的耐受性使我们能够使用几个系列的底物来表征 O-GlcNAcase 过渡态,以产生多个同时的自由能关系。观察到伴随亲核强度和离去基团能力变化的机制、过渡态和速率决定步骤的变化模式。观察到的机制变化反映了酶通酸和催化亲核试剂所起的作用。重要的是,这些结果说明了酶如何协同利用两种催化模式;许多小分子催化模型都没有的特征。这些研究还表明了氧代碳鎓离子中间体在 O-GlcNAcase 催化的氨基葡萄糖水解中的动力学意义,探索了使用酶过渡态结构的非原子研究可能学到的知识的局限性,并提供了关于保留超家族的一般见解糖苷水解酶作为有效的催化剂。