(2R,3R,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-(4-azidobutoxy)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuranol | 1548502-83-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3R,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-(4-azidobutoxy)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuranol
• CAS: 1548502-83-5
• 化学式: C₁₄H₂₀N₈O₄
• 分子量: 364.364
• InChiKey: ZLEKFNWZGPYUCJ-IDTAVKCVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.13
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  177.3
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-(4-azidobutoxy)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuranol 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 氨基磺酰氯 、 sodium hydride 、 caesium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙二醇二甲醚 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Development of a chemical scaffold for inhibiting nonribosomal peptide synthetases in live bacterial cells

  摘要：

  The adenylation (A) domain is essential for non-ribosomal peptide synthetases (NRPSs), which synthesize various peptide-based natural products, including virulence factors, such as siderophores and genotoxins. Hence, the inhibition of A-domains could attenuate the virulence of pathogens. 5’-O-N-(Aminoacyl or arylacyl)sulfamoyladenosine (AA-AMS) is a bisubstrate small-molecule inhibitor of the A-domains of NRPSs. However, the bacterial cell permeability of AA-AMS is typically a problem owing to its high hydrophilicity. In this study, we investigated the influence of a modification of 2′-OH in the AMS scaffold with different functional groups on binding to target enzymes and bacterial cell penetration. The inhibitor 7 with a cyanomethyl group at 2′-OH showed desirable inhibitory activity against both recombinant and intracellular gramicidin S synthetase A (GrsA) in the gramicidin S-producer Aneurinibacillus migulanus ATCC 9999, providing an alternative scaffold to develop novel A-domain inhibitors.

  DOI：

  10.3762/bjoc.20.39
• 作为产物：
  描述：

  1-叠氮基-4-溴丁烷 、 腺苷 在 四丁基碘化铵 、 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 48.0h， 以45%的产率得到(2R,3R,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-(4-azidobutoxy)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuranol
  参考文献：
  名称：

  通过腺苷酸化结构域的亲和探针特异性富集非核糖体肽合成酶模块

  摘要：

  我们针对腺苷酸化（A）域的亲和力探针的开发目标，该亲和力探针可促进非核糖体肽合成酶（NRPS）-聚酮化合物合酶（PKS）杂种和NRPSs中含有A域的模块的富集，鉴定和定量。已经报道了单磷酸腺苷（AMP）的5'- O-氨磺酰腺苷（AMS）不可水解类似物作为支架的支架，用于设计表现出腺苷酸化酶紧密结合的抑制剂。在这里，我们描述了针对A域的亲和探针的应用。我们的合成探针，一种生物素化的I -Phe-AMS（I -Phe-AMS-生物素）专门针对NRPS模块中的A结构域，从而激活I -Phe-AMS。-在重组NRPS酶系统和整个蛋白质组中均转化为氨基酰基腺苷酸中间体。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2013.12.082