[9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-ylmethyl]-phosphonic acid (3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-purin-9-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl ester methyl ester | 231627-04-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: [9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-ylmethyl]-phosphonic acid (3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-purin-9-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl ester methyl ester
• CAS: 231627-04-6
• 化学式: C₂₅H₃₂N₉O₁₁P
• 分子量: 665.557
• InChiKey: KHGZQKMFCRYNEH-WDBHNFLXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.07
• 重原子数：
  46.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  266.33
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-ylmethyl]-phosphonic acid (3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-purin-9-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl ester methyl ester 在 水 作用下， 反应 15.0h， 生成 [9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-ylmethyl]-phosphonic acid mono-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-purin-9-yl)-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethyl] ester; compound with tert-butylamine
  参考文献：
  名称：

  GMP Synthetase: Synthesis and Biological Evaluation of a Stable Analog of the Proposed AMP-XMP Reaction Intermediate

  摘要：

  酶鸟苷酸合成酶是新生嘌呤合成途径的一部分，负责将黄苷酸单磷酸转化为鸟苷酸单磷酸。已提出磷酸链接的腺苷-XMP 1是这一转化过程的中间体。然而，由于磷酸链接的高不稳定性，直接观察1（无论是在酶反应中产生的或作为潜在合成目标）并不容易。因此，我们进行了磷酸酯2的合成，作为这一提议中间体的稳定类似物。成功的合成策略涉及将2-磷酸甲基肌苷与腺苷衍生物在Mitsunobu反应条件下偶联。经过去保护和初始偶联产物的5′单磷酸形成后得到了化合物2。化合物2以0.56 μM的Ki值抑制了GMP合成酶。

  DOI：

  10.1055/s-1999-3104
• 作为产物：
  描述：

  阿卡地新 在 palladium on activated charcoal 咪唑 、 potassium bisulfite 、 ammonium hydroxide 、 2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶 、 四丁基氟化铵 、 甲酸铵 、 sodium hydride 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 201.03h， 生成 [9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-ylmethyl]-phosphonic acid (3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-purin-9-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl ester methyl ester
  参考文献：
  名称：

  GMP Synthetase: Synthesis and Biological Evaluation of a Stable Analog of the Proposed AMP-XMP Reaction Intermediate

  摘要：

  酶鸟苷酸合成酶是新生嘌呤合成途径的一部分，负责将黄苷酸单磷酸转化为鸟苷酸单磷酸。已提出磷酸链接的腺苷-XMP 1是这一转化过程的中间体。然而，由于磷酸链接的高不稳定性，直接观察1（无论是在酶反应中产生的或作为潜在合成目标）并不容易。因此，我们进行了磷酸酯2的合成，作为这一提议中间体的稳定类似物。成功的合成策略涉及将2-磷酸甲基肌苷与腺苷衍生物在Mitsunobu反应条件下偶联。经过去保护和初始偶联产物的5′单磷酸形成后得到了化合物2。化合物2以0.56 μM的Ki值抑制了GMP合成酶。

  DOI：

  10.1055/s-1999-3104