2,3,4,6-tetra-O-acetyl-α-D-mannopyranosyl-(1->3)-2,4-di-O-acetyl-β-D-glucopyranuronosyl azide | 844884-87-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-α-D-mannopyranosyl-(1->3)-2,4-di-O-acetyl-β-D-glucopyranuronosyl azide
• 英文别名: Man2Ac3Ac4Ac6Ac(a1-3)GlcA2Ac4Ac(b)-N3；(2S,3S,4S,5R,6R)-3,5-diacetyloxy-6-azido-4-[(2R,3S,4S,5R,6R)-3,4,5-triacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxane-2-carboxylic acid
• CAS: 844884-87-3
• 化学式: C₂₄H₃₁N₃O₁₇
• 分子量: 633.52
• InChiKey: LSJUOGSYTNUUDQ-XVEYSNRLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  237
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,3,4,6-tetra-O-acetyl-α-D-mannopyranosyl-(1->3)-2,4-di-O-acetyl-β-D-glucopyranuronosyl azide 在 二正丁基氧化锡 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 (2S,3S,4S,5R,6R)-6-azido-N-[4-[[(2S,3S,4S,5R,6R)-6-azido-3,5-dihydroxy-4-[(2R,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxane-2-carbonyl]amino]phenyl]-3,5-dihydroxy-4-[(2R,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxane-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  基于葡萄糖醛酸酐的用于二价配体展示的结构确定的支架的合成。叔酰胺异构度和折叠度取决于叠氮化糖基的构型

  摘要：

  描述了基于葡萄糖醛酸的酸酐的二价碳水化合物的合成和结构分析。次要苯甲酸酯主要采用Z- anti结构；也有证据表明Z -syn异构体的数量。二价叔酸酐在其NMR光谱中显示出两个信号集，与（i）一种主要异构体（两种酰胺均具有E构型（EE）和（ii）一种次要异构体（其中一种酰胺为E而另一种Z（EZ））的存在相一致）。解决方案中的定性NOE / ROE光谱学研究支持以下建议：抗构象是E的首选酰胺。一种二价叔苯胺的晶体结构显示E -anti和E -syn结构异构体。观察到分子内碳水化合物-碳水化合物堆积，并通过羰基-吡喃糖，叠氮化物-叠氮化物和吡喃糖-芳族相互作用介导。在EE到EZ对于含有两个α-糖基叠氮化物基团的二价化合物，叔酰胺的异构体比率或折叠度最大。这在水中得到增强，表明疏水相互作用是部分但不是全部的原因。计算方法预测了折叠异构体的叠氮化物-芳香族（N···HC相互作用）和叠氮化物－叠氮化物

  DOI：

  10.1021/jo050200z
• 作为产物：
  描述：

  1-叠氮基-1-脱氧-D-半乳糖醛酸酯2,3,4-三乙酸酯甲酯 在 四(三苯基膦)钯 四氢吡咯 、 lithium hydroxide 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 4 A molecular sieve 、 水 、 乙酸酐 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 47.5h， 生成 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-α-D-mannopyranosyl-(1->3)-2,4-di-O-acetyl-β-D-glucopyranuronosyl azide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Structurally Diverse and Defined Bivalent Mannosides on Saccharide Scaffolding

  摘要：

  The synthesis of bivalent mannosides by the grafting of alpha-D-mannopyranoside onto monosaccharide acceptors and conjugation to terephthalic acid or phenylenediamine is described. Computational methods were used to predict accessible orientations and distances between the mannose units.

  DOI：

  10.1021/ol047841l

文献信息

• Phenylenediamine-based bivalent glycocyclophanes: synthesis and analysis of the influence of scaffold rigidity and ligand spacing on lectin binding in cell systems with different glycomic profiles
  作者：Sabine André、Trinidad Velasco-Torrijos、Rosaria Leyden、Sebastien Gouin、Manuela Tosin、Paul V. Murphy、Hans-Joachim Gabius

  DOI：10.1039/b913010a

  日期：——

  The conjugation of carbohydrates to synthetic scaffolds has the goal of preparing potent inhibitors of lectin binding. We herein report the synthesis of a panel of bivalent compounds (cyclophane and terephthalamide-derivatives) then used to establish the influence of scaffold flexibility on respective inhibitory potency in a medically relevant test system. Synthetic routes to two phenylenediamine-based glycocyclophanes involving Ugi reactions of glucuronic acid derivatives and subsequent ring closing metathesis are described, as are improvements for producing terephthalamide-based carbohydrate carriers. Assays were performed with human tumour cells measuring quantitatively the influence of the test compounds on fluorescent surface staining by labelled lectins. Biological evaluation using two different lines of cancer cells as well as cells with known alterations in the glycomic profile (cells treated with an inhibitor of glycan processing and a glycosylation mutant) reduced the risk of generating premature generalizations regarding inhibitor potency. Bioactivity relative to free mannose was invariably determined for the synthetic compounds. A clear trend for enhanced inhibitory properties for macrocyclic compounds compared to non-macrocyclic derivatives was discerned for one type of glycocyclophane. Herein we also document the impact of altering the spacing between the mannose residues, altering cell surface ligand density and cell-type reactivity. The applied strategy for the cell assays is proposed to be of general importance in the quest to identify medically relevant lectin inhibitors.

  将碳水化合物与合成支架共轭的目的是制备有效的凝集素结合抑制剂。我们在此报告了一组二价化合物（环烷和对苯二甲酰胺-衍生物）的合成过程，然后用来确定支架的灵活性在医学相关测试系统中对各自抑制效力的影响。文中介绍了两种苯二胺基糖环烷的合成路线，包括葡萄糖醛酸衍生物的乌基反应和随后的闭环偏析，以及生产对苯二甲酰胺基碳水化合物载体的改进方法。用人类肿瘤细胞进行了试验，定量测量了试验化合物对标记凝集素荧光表面染色的影响。使用两种不同的癌细胞系以及已知糖型改变的细胞（使用糖加工抑制剂和糖基化突变体处理的细胞）进行生物评估，降低了过早概括抑制剂效力的风险。合成化合物相对于游离甘露糖的生物活性始终是确定的。与非大环衍生物相比，一种类型的糖环烷明显具有增强大环化合物抑制性的趋势。在此，我们还记录了改变甘露糖残基间距、改变细胞表面配体密度和细胞类型反应性的影响。我们提出的细胞试验应用策略在寻找医学相关凝集素抑制剂的过程中具有普遍意义。