methyl (4-O-benzyl-2-chloro-2-deoxy-α-L-rhamnopyranosyl)-(1->3)-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside | 864815-50-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl (4-O-benzyl-2-chloro-2-deoxy-α-L-rhamnopyranosyl)-(1->3)-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: 2-[(2R,4aR,6R,7R,8R,8aS)-8-[(2S,3R,4R,5R,6S)-3-chloro-4-hydroxy-6-methyl-5-phenylmethoxyoxan-2-yl]oxy-6-methoxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]isoindole-1,3-dione
• CAS: 864815-50-9
• 化学式: C₃₅H₃₆ClNO₁₀
• 分子量: 666.125
• InChiKey: UHPJMKYYHNHGSC-PKVSHTQRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (4-O-benzyl-2-chloro-2-deoxy-α-L-rhamnopyranosyl)-(1->3)-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside 在 N-乙基吗啉 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 三氟甲磺酸 、 四丁基氟化铵 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 一水合肼 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 52.0h， 生成 methyl (2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-mannopyranosyl)-(1->3)-(4-O-benzyl-2-chloro-2-deoxy-α-L-rhamnopyranosyl)-(1->3)-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-(N-fluorenylmethoxycarbonyl-β-alanyl)-amido-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  开发高亲和力的低聚糖抑制剂：构象预组织和官能团修饰。

  摘要：

  分子内束缚与官能团修饰相结合已被研究为设计高亲和力寡糖配体的一种方法。先前的论文报道了成功的束缚，以抗体结合状态约束三糖，从而使缔合常数增加了15倍。在这里，我们报告了两种采用单氯化和单脱氧策略来生成抑制剂的β-丙氨酰系链衍生物的合成，该抑制剂应将目标分子的结合亲和力提高10-25倍，前提是在束缚时自由能的变化是可加性的与功能组更改配对。通过等温滴定量热法测量新配体的结合参数，并通过分子动力学计算和简单的对接分析使结果合理化。数据表明，虽然丙氨酸系链是约束三糖的合理方法，但通过将其与官能团修饰配对获得的自由能增加并没有加成，有时甚至适得其反。

  DOI：

  10.1039/b416106h
• 作为产物：
  描述：

  methyl 4,6-O-benzylidene-2-N-phthalimido-β-D-mannopyranoside 在 甲醇 、 3 A molecular sieve 、 sodium methylate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 13.25h， 生成 methyl (4-O-benzyl-2-chloro-2-deoxy-α-L-rhamnopyranosyl)-(1->3)-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  开发高亲和力的低聚糖抑制剂：构象预组织和官能团修饰。

  摘要：

  分子内束缚与官能团修饰相结合已被研究为设计高亲和力寡糖配体的一种方法。先前的论文报道了成功的束缚，以抗体结合状态约束三糖，从而使缔合常数增加了15倍。在这里，我们报告了两种采用单氯化和单脱氧策略来生成抑制剂的β-丙氨酰系链衍生物的合成，该抑制剂应将目标分子的结合亲和力提高10-25倍，前提是在束缚时自由能的变化是可加性的与功能组更改配对。通过等温滴定量热法测量新配体的结合参数，并通过分子动力学计算和简单的对接分析使结果合理化。数据表明，虽然丙氨酸系链是约束三糖的合理方法，但通过将其与官能团修饰配对获得的自由能增加并没有加成，有时甚至适得其反。

  DOI：

  10.1039/b416106h

文献信息

• Developing high affinity oligosaccharide inhibitors: conformational pre-organization paired with functional group modification
  作者：Robert S. McGavin、David R. Bundle

  DOI：10.1039/b416106h

  日期：——

  Intramolecular tethering combined with functional group modification has been investigated as an approach to design high affinity oligosaccharide ligands. The preceding paper reported successful tethering to constrain a trisaccharide in the conformation of its bound state with an antibody and thereby achieved a 15-fold increase in association constant. Here we report the synthesis of two beta-alanyl

  分子内束缚与官能团修饰相结合已被研究为设计高亲和力寡糖配体的一种方法。先前的论文报道了成功的束缚，以抗体结合状态约束三糖，从而使缔合常数增加了15倍。在这里，我们报告了两种采用单氯化和单脱氧策略来生成抑制剂的β-丙氨酰系链衍生物的合成，该抑制剂应将目标分子的结合亲和力提高10-25倍，前提是在束缚时自由能的变化是可加性的与功能组更改配对。通过等温滴定量热法测量新配体的结合参数，并通过分子动力学计算和简单的对接分析使结果合理化。数据表明，虽然丙氨酸系链是约束三糖的合理方法，但通过将其与官能团修饰配对获得的自由能增加并没有加成，有时甚至适得其反。