phenyl 1-thio-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-β-D-galactopyranoside | 819798-40-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 英文名称: phenyl 1-thio-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: phenyl 2-azido-2-deoxy-4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-galactopyranoside；phenyl 2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-galactopyranoside
• CAS: 819798-40-8
• 化学式: C₁₉H₁₉N₃O₄S
• 分子量: 385.444
• InChiKey: HQUROUFKKPKZML-VWQYPGANSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.66
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  96.68
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phenyl 1-thio-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-β-D-galactopyranoside 在 咪唑 、 硼烷四氢呋喃络合物 、 三氟甲磺酸二丁硼 、 三氟化硼乙醚 、 氢氟酸 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 生成 苯基-3,4,6-三-O-乙酰基-2-脱氧-1-硫代-2-(2,2,2-三氯乙氧基甲酰氨基)-β-D-吡喃葡萄糖苷
  参考文献：
  名称：

  Efficient synthesis of core 2 class glycosyl amino acids by one-pot glycosylation approach

  摘要：

  We describe the one-pot synthesis of core 2 class branched oligosaccharides initiated by chemo-selective glycosylation of silyl anther. Glycosylation of 6-O-silyl-4-benzyl-2-azido-thiogalactoside with glycosyl fluoride provided selectively 6-glycosylated thioglycoside without both O-glycosylation at the 3 position and S-glycosylation. Subsequent coupling of galactosyl fluoride and amino acids afforded the protected branched oligosaccharides in good yields. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2003.12.042
• 作为产物：
  描述：

  1,3,4,6-O-四乙酰基-2-叠氮-2-脱氧-alpha-D-吡喃半乳糖苷 在 三氟化硼乙醚 、 sodium methylate 、 大茴香酸 作用下， 以 甲醇 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 phenyl 1-thio-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Configurations and conformations of glycosyl sulfoxides

  摘要：

  对两种具有 RS 构型的轴向糖基硫醚（苯基 2-叠氮-2-脱氧-1-硫代-α-d-吡喃半乳糖苷 S-氧化物的衍生物）进行的 X 射线晶体学研究表明，它们在固态中呈现反构象，这与之前的观察和假设截然不同。在 B3lYP6-311G+(d,p)/6-31G(d)水平上进行的密度泛函理论（DFT）计算证实，2-叠氮-2-脱氧-α-d-吡喃糖苷的苯基和甲基 RS 糖基硫醚的反构象比气相中的外异构构象更稳定。一维 NOE 测量结果表明，极性较强的外异构体构象在溶液中只占很小的比例。反构象发生了扭曲，使糖基取代基更接近于被 H1 遮挡。如果硫孤对子是 p 型孤对子，则这种扭曲会使 S n → σ* 重叠。这种重叠的证据来自较短的 C1-S 键距离，与 X 射线晶体结构中的可比键距离以及 SS 糖苷的 DFT 计算结果一样短，SS 糖苷在固态和溶液中都采用了预期的外异构构象，并具有正常的 n → σ* 重叠。对于不含 2-叠氮基团的 2-脱氧衍生物，相同水平的气相 DFT 计算表明，反异构构象和外异构构象具有相当的稳定性。对这两个系列的结果进行比较后发现，位于 C2 赤道方向的电负性取代基会使 S-O 平行排列的构象不稳定，而内环 C-O 偶极子与 S-O 偶极子反平行则有利于这种构象，不稳定程度约为 2.5 kcal mol-1 (1 cal = 4.184 J)。X 射线衍射显示，一种赤道糖基亚砜，即 (SS) 苯基 3,4,6-三-O-乙酰基-2-脱氧-2-酞酰亚胺基-1-硫代-β-d-吡喃葡萄糖苷 S-亚砜，在固态下也采用了反构象。它在溶液中也采用这种构象，这与对其他赤道糖基硫醚的研究不同。

  DOI：

  10.1139/v10-091

文献信息

• METHOD OF SYNTHESIZING SUGAR CHAIN
  申请人：MITSUBISHI CHEMICAL CORPORATION

  公开号：EP1640379A1

  公开（公告）日：2006-03-29

  An object of the present invention is to provide a method for efficiently chemically synthesizing biomolecules including a nucleotide (nucleic acid), a peptide (protein), or a sugar chain, as representative examples. The present invention provides a method of solid-phase synthesis of sugar chain(s) for synthesizing multiple types of sugar chains in at least one sugar chain synthesis reaction system comprising multiple types of monosaccharide units, which is characterized in that it comprises changing the temperature in the sugar chain synthesis reaction system depending on the temperature rising rate that has been determined based on a decrease in side reaction(s) in the reaction system as an indicator.

  本发明的目的是提供一种有效地化学合成生物分子的方法，包括核苷酸（核酸）、肽（蛋白质）或糖链等代表性示例。本发明提供了一种固相合成糖链的方法，用于在至少一个糖链合成反应系统中合成多种类型的糖链，其特征在于根据已确定的反应系统中副反应减少的指标，改变糖链合成反应系统中的温度上升速率。
• Synthesis and Biological Evaluation of the Forssman Antigen Pentasaccharide and Derivatives by a One-Pot Glycosylation Procedure
  作者：Hiroshi Tanaka、Ryota Takeuchi、Mitsuru Jimbo、Nami Kuniya、Takashi Takahashi

  DOI：10.1002/chem.201203865

  日期：2013.2.25

  The synthesis and biological evaluation of the Forssman antigen pentasaccharide and derivatives thereof by using a one‐pot glycosylation and polymer‐assisted deprotection is described. The Forssman antigen pentasaccharide, composed of GalNAcα(1,3)GalNAcβ(1,3)Galα(1,4)Galβ(1,4)Glc, was recently identified as a ligand of the lectin SLL‐2 isolated from an octocoral Sinularia lochmodes. The chemo‐ and

  描述了通过单锅糖基化和聚合物辅助脱保护对福斯曼抗原五糖及其衍生物的合成和生物学评估。由GalNAcα（1,3）GalNAcβ（1,3）Galα（1,4）Galβ（1,4）Glc组成的Forssman抗原五糖最近被鉴定为从八齿窦中分离的凝集素SLL-2的配体。 lochmodes。通过使用Tf 2 O，TTBP和Ph 2 SO的混合物，将硫代半乳糖苷与半缩醛供体进行化学和α选择性糖基化反应，然后活化剩余的硫代糖苷，在单罐还原端提供三糖程序。五糖是通过N的α选择性糖基化制备的用2-叠氮基-1-羟基糖基供体对Troc保护的（Troc = 2,2,2,3-三氯乙氧基羰基）硫糖苷，然后通过一锅法将得到的二糖在三糖受体的C3羟基上糖基化。接下来，我们将一锅糖基化方法应用于五糖的合成，其中半乳糖胺单元被半乳糖单元部分和完全取代。通过建立的方法成功制备了三种可能的五糖中的Galα（1,3）GalNAc和Galα（1
• Highly Efficient Stereospecific Preparation of Tn and TF Building Blocks Using Thioglycosyl Donors and the Ph 2 SO/Tf 2 O Promotor System*
  作者：David Cato、Therese Buskas、Geert‐Jan Boons

  DOI：10.1081/car-200067091

  日期：2005.8.1

  The activation of 2‐azido‐2‐deoxy Tn and TF thioglycosyl donors by the powerful thiophilic promoter system Ph2SO/Tf2O has been investigated. Glycosylation of an Fmoc‐protected threonine derivative gave 1,2‐cis glycosides in high yields and excellent stereoselectivities. The galactosylation of phenyl 2‐azido‐4,6‐O‐benzylidene‐2‐deoxy‐1‐thio‐β‐D‐galactopyranoside was achieved in high yield and without

  已经研究了强大的亲硫性启动子系统Ph2SO / Tf2O对2-叠氮基-2-脱氧Tn和TF硫糖基供体的活化作用。Fmoc保护的苏氨酸衍生物的糖基化可以高产率和出色的立体选择性得到1,2-顺式糖苷。苯基2-叠氮基-4,6-O-苄叉基-2-脱氧-1-硫代-β-D-吡喃半乳糖苷的半乳糖基化反应是高收率的，使用携带有2-O-（2的三氯乙酰胺基供体不会形成原酸酯。 ，5-二氟苯甲酰基）基团。可以通过van Boom启动子直接激活所构建的TF二糖的异头噻吩基，以实现苏氨酸衍生物的糖基化。*献给Jacques H. van Boom教授
• Synthesis of the repeating unit of the lipoteichoic acid of Streptococcus pneumoniae
  作者：Christian Marcus Pedersen、Ignacio Figueroa-Perez、Artur J. Ulmer、Ulrich Zähringer、Richard R. Schmidt

  DOI：10.1016/j.tet.2011.11.088

  日期：2012.1

  The lipoteichoic acid repeating unit of Streptococcus pneumoniae is a complex pseudopentasaccharide (3). It consists of one ribitol-phosphate, one 2-acetamino-4-amino-2,4,6-trideoxy-galactose, one glucose and two galactosamine residues each differently linked, but both carrying one phosphocholine substituent, at position 6. Suitable building blocks (6–10) for efficient and diastereocontrolled ligations

  肺炎链球菌的脂磷壁酸重复单元是复杂的假五糖（3）。它由一个核糖磷酸酯，一个2-乙酰氨基-4-氨基-2,4,6-三苯氧基-半乳糖，一个葡萄糖和两个半乳糖胺残基组成，每个残基都不同地连接，但都在6位带有一个磷酸胆碱取代基。设计了用于有效和非对映控制的连接的嵌段（6 – 10），从而在完全脱保护后提供了高纯度的目标分子。生物学测试表明，缺少脂质部分的重复单元3不会刺激人类单核细胞（hMNCs）的促炎反应。
• Probing the Influence of a 4,6-<i>O</i>-Acetal on the Reactivity of Galactopyranosyl Donors: Verification of the Disarming Influence of the <i>trans–gauche</i> Conformation of C5–C6 Bonds
  作者：Myriame Moumé-Pymbock、Takayuki Furukawa、Sujit Mondal、David Crich

  DOI：10.1021/ja405588x

  日期：2013.9.25

  6-O-alkylidene acetal on the rate of acid-catalyzed hydrolysis of methyl galactopyranosides and of spontaneous hydrolysis of 2,4-dinitrophenyl galactopyranosides has been studied through the synthesis and hydrolysis of analogs in which O6 is replaced by a methoxymethylene unit in which the methoxy group adopts either an equatorial or an axial position according to the configuration. Consistent with

  4,6-O-亚烷基缩醛对甲基吡喃半乳糖苷酸催化水解和 2,4-二硝基苯基吡喃半乳糖苷自发水解速率的影响已通过类似物的合成和水解进行研究，其中 O6 被替换为甲氧基亚甲基单元，其中甲氧基根据构型采用赤道或轴向位置。与早期在酸催化和自发水解条件下的研究一致，亚烷基缩醛或其 7-carba 类似物相对于缺乏环状保护基团的类似系统延迟水解。7-carba 类似物中 C6 的构型不影响酸催化水解的速率，但对 2,4-二硝基苯基半乳糖苷的自发水解速率影响很小，证实了早期关于羟甲基构象对糖苷反应性所起作用的研究。发现亚苄基缩醛相对于单环类似物稳定吡喃半乳糖衍生物的α-端基异构体。讨论了在 O2 处带有相邻基团活性保护基团的 4,6-O-亚苄基保护的吡喃半乳糖供体的 α 选择性的原因。