(2R,3S,5R)-5-[2-amino-6-(methoxyamino)purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol | 68045-42-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-[2-amino-6-(methoxyamino)purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 68045-42-1
• 化学式: C₁₁H₁₆N₆O₄
• 分子量: 296.286
• InChiKey: QDKUJJJRHISDSK-RRKCRQDMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-[2-amino-6-(methoxyamino)purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol 在 吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 N'-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-6-(methoxyamino)purin-2-yl]-N,N-dimethylmethanimidamide
  参考文献：
  名称：

  含有腺嘌呤-鸟嘌呤类似物的寡核苷酸的合成和双链体稳定性。

  摘要：

  已经合成了核苷N6-甲氧基-2'-脱氧腺苷（dZ）和2-氨基-9-（2-脱氧-β-呋喃呋喃糖基）-6-甲氧基氨基嘌呤（dK）并转化为5'-O-二甲氧基三苯甲基3' -（2-氰基乙基N，N-二异丙基亚磷酰胺）。这些单体已用于机器DNA合成中，以提供一组含有多达三个类似核苷酸的七核苷酸。熔解温度（Tm）表明，含有ZT和ZC碱基对的17-mer双链体的稳定性与包含KT和KC对的17-mer双链体的稳定性非常相似。它们不如相应的完全互补双链体稳定，但比包含错配对的双链体稳定。在dZ的情况下，这与在甲基亚砜中观察到的核苷的氨基亚氨基互变异构体比率约为1：4一致。

  DOI：

  10.1016/0008-6215(92)84156-m
• 作为产物：
  描述：

  1-Α-氯-3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖 在 氢氧化钾 、 三(3,6-二氧杂庚基)胺 、 氨 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 反应 4.83h， 生成 (2R,3S,5R)-5-[2-amino-6-(methoxyamino)purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
  参考文献：
  名称：

  含有腺嘌呤-鸟嘌呤类似物的寡核苷酸的合成和双链体稳定性。

  摘要：

  已经合成了核苷N6-甲氧基-2'-脱氧腺苷（dZ）和2-氨基-9-（2-脱氧-β-呋喃呋喃糖基）-6-甲氧基氨基嘌呤（dK）并转化为5'-O-二甲氧基三苯甲基3' -（2-氰基乙基N，N-二异丙基亚磷酰胺）。这些单体已用于机器DNA合成中，以提供一组含有多达三个类似核苷酸的七核苷酸。熔解温度（Tm）表明，含有ZT和ZC碱基对的17-mer双链体的稳定性与包含KT和KC对的17-mer双链体的稳定性非常相似。它们不如相应的完全互补双链体稳定，但比包含错配对的双链体稳定。在dZ的情况下，这与在甲基亚砜中观察到的核苷的氨基亚氨基互变异构体比率约为1：4一致。

  DOI：

  10.1016/0008-6215(92)84156-m

文献信息

• IMPROVEMENTS IN OR RELATING TO MUTAGENESIS OF NUCLEIC ACIDS
  申请人：Amersham Pharmacia Biotech UK Limited

  公开号：EP0866796B1

  公开（公告）日：2000-11-29
• ISOLATION OF NUCLEIC ACID MOLECULES
  申请人：INVITROGEN CORPORATION

  公开号：EP1151093A1

  公开（公告）日：2001-11-07
• EP1151093A4
  申请人：——

  公开号：EP1151093A4

  公开（公告）日：2003-01-08
• METHODS AND DEVICES FOR DNA SEQUENCING AND MOLECULAR DIAGNOSTICS
  申请人：Barany Francis A.

  公开号：US20150099642A1

  公开（公告）日：2015-04-09

  The present invention is directed to methods for capturing, amplifying and identifying one or more of a plurality of target nucleotide sequences in a sample. The present invention is further directed to a device comprising a solid support having a plurality of wells or pillars and a plurality of oligonucleotides attached to the wells or pillars. Other aspects of the invention are directed to methods of making such devices.
• US9670540B2
  申请人：——

  公开号：US9670540B2

  公开（公告）日：2017-06-06