N-methyl-4,8-dimethyl-3E,7E-nonadien-1-amine | 141320-84-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: N-methyl-4,8-dimethyl-3E,7E-nonadien-1-amine
• 英文别名: (3E)-N,4,8-trimethylnona-3,7-dien-1-amine
• CAS: 141320-84-5
• 化学式: C₁₂H₂₃N
• 分子量: 181.321
• InChiKey: YFYLPPXPWXZWRJ-FMIVXFBMSA-N

物化性质

• 沸点：
  253.7±29.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.815±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  12
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-methyl-4,8-dimethyl-3E,7E-nonadien-1-amine 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 18.0h， 以99%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  胍基和Am基抑制剂的研究表明，脱氢角鲨烯和角鲨烯合酶对烯丙基碳正离子中间体的稳定作用最小

  摘要：

  脱氢角鲨烯和角鲨烯合酶分别催化氧化法中性和法呢基二磷酸的还原，头对头二聚化。在每种情况下，认为反应是通过法呢基二磷酸的初始离解而进行的，以形成烯丙基碳正离子-焦磷酸根离子对。这项工作描述了抑制剂的合成和测试，其中胍基或am基部分侧接有膦酰基次膦酸酯基和烃尾。这些官能团带有平面的，离域的正电荷，因此应作为烯丙基碳正离子的出色模拟物。还制备了带有中性脲部分的抑制剂作为对照。带正电荷的抑制剂可作为抗金黄色葡萄球菌脱氢角鲨烯合酶的竞争性抑制剂。ķ我值在低微摩尔范围内。令人惊讶的是，中性尿素抑制剂是这三种中最有效的。人角鲨烯合酶的上半年反应也看到了类似的趋势。这些结果的一种解释是这些酶的活性位点不会通过静电或π-阳离子相互作用直接稳定烯丙基碳正离子化。取而代之的是，这些酶可能与焦磷酸盐和脂质部分紧密结合，以促进催化作用，并且所结合的焦磷酸盐产物可提供碳阳离子的静电稳定作用。另一种可能性是这些抑制剂不

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.8b00731
• 作为产物：
  描述：

  香叶基溴 在 氢氧化钾 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 N-methyl-4,8-dimethyl-3E,7E-nonadien-1-amine
  参考文献：
  名称：

  （1α，2β，3β，4α）-1,2-双[N-丙基-N-（4-苯氧基苄基）氨基]羰基]环丁烷-3,4-二羧酸（A-87049）：新型强力角鲨烯合酶抑制剂。

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jm970058x

文献信息

• Inhibition of Geranylgeranyl Diphosphate Synthase by Bisphosphonates and Diphosphates:  A Potential Route to New Bone Antiresorption and Antiparasitic Agents
  作者：Christina M. Szabo、Yoshihiro Matsumura、Sayaka Fukura、Michael B. Martin、John M. Sanders、Suraj Sengupta、John A. Cieslak、Timothy C. Loftus、Christopher R. Lea、Hyung-Jae Lee、Ali Koohang、Robert M. Coates、Hiroshi Sagami、Eric Oldfield

  DOI：10.1021/jm010412y

  日期：2002.5.1

  We report the inhibition of a human recombinant geranylgeranyl diphosphate synthase (GGPPSase) by 23 bisphosphonates and six azaprenyl diphosphates. The IC50 values range from 140 nM to 690,muM. None of the nitrogen-containing bisphosphonates that inhibit farnesyl diphosphate synthase were effective in inhibiting the GGPPSase enzyme. Using three-dimensional quantitative structure-activity relationship/comparative molecular field analysis (CoMFA) methods, we find a good correlation between experimental and predicted activity: R-2 = 0.938, R-cv(2) = 0.900, R-bs(2) = 0.938, and F-test = 86.8. To test the predictive utility of the CoMFA approach, we used three training sets of 25 compounds each to generate models to predict three test sets of three compounds. The rms pIC(50) error for the nine predictions was 0.39. We also investigated the pharmacophore of these GGPPSase inhibitors using the Catalyst method. The results demonstrated that Catalyst predicted the pIC(50) values for the nine test set compounds with an rms error of 0.28 (R-2 between experimental and predicted activity of 0.948).
• Amidinium cation as a mimic of allylic carbocation: synthesis and squalene synthetase inhibitory activity of an amidinium analog of a carbocation intermediate
  作者：Mahavir Prashad

  DOI：10.1021/jm00057a013

  日期：1993.3
• Synthesis and characterization of aza analog inhibitors of squalene and geranylgeranyl diphosphate synthases.
  作者：Arthur Steiger、Hyung Jung Pyun、Robert M. Coates

  DOI：10.1021/jo00038a038

  日期：1992.6

  One-carbon homologation of geranyl and farnesyl chlorides to secondary N-methylamines (12 and 17) via alpha-lithioformamidine alkylations followed by N-alkylation with bromoacetate esters afforded alpha-(homogeranylamino)-and alpha-(homofarnesylamino)acetates 13 and 18. After alpha-farnesylation of 13, hydride reductions gave branched and straight-chain tertiary beta-amino alcohols 15 and 19. The diphosphate derivatives (7 and 8) of 15 and 19 prepared by SN2 displacements may be regarded as "aza analogs" of plausible carbocation intermediates (5 and 6) in the biosynthesis of squalene and geranylgeranyl diphosphate since, in preliminary collaborative evaluations, they inhibit the respective synthase enzymes at micromolar concentrations.
• (1α,2β,3β,4α)-1,2-Bis[[<i>N</i>-propyl-<i>N</i>-(4-phen- oxybenzyl)amino]carbonyl]cyclobutane- 3,4-dicarboxylic Acid (A-87049):  A Novel Potent Squalene Synthase Inhibitor
  作者：Anthony K. L. Fung、William R. Baker、Steven Fakhoury、Herman H. Stein、Jerry Cohen、Bernard G. Donner、David S. Garvey、Kenneth P. Spina、Saul H. Rosenberg

  DOI：10.1021/jm970058x

  日期：1997.7.1
• Studies with Guanidinium- and Amidinium-Based Inhibitors Suggest Minimal Stabilization of Allylic Carbocation Intermediates by Dehydrosqualene and Squalene Synthases
  作者：Walid M. Abdelmagid、Taniya Adak、Jon O. Freeman、Martin E. Tanner

  DOI：10.1021/acs.biochem.8b00731

  日期：2018.9.25

  An inhibitor bearing a neutral urea moiety was also prepared as a control. The positively charged inhibitors acted as competitive inhibitors against Staphylococcus aureus dehydrosqualene synthase with Ki values in the low micromolar range. Surprisingly, the neutral urea inhibitor was the most potent of the three. Similar trends were seen with the first half reaction of human squalene synthase. One

  脱氢角鲨烯和角鲨烯合酶分别催化氧化法中性和法呢基二磷酸的还原，头对头二聚化。在每种情况下，认为反应是通过法呢基二磷酸的初始离解而进行的，以形成烯丙基碳正离子-焦磷酸根离子对。这项工作描述了抑制剂的合成和测试，其中胍基或am基部分侧接有膦酰基次膦酸酯基和烃尾。这些官能团带有平面的，离域的正电荷，因此应作为烯丙基碳正离子的出色模拟物。还制备了带有中性脲部分的抑制剂作为对照。带正电荷的抑制剂可作为抗金黄色葡萄球菌脱氢角鲨烯合酶的竞争性抑制剂。ķ我值在低微摩尔范围内。令人惊讶的是，中性尿素抑制剂是这三种中最有效的。人角鲨烯合酶的上半年反应也看到了类似的趋势。这些结果的一种解释是这些酶的活性位点不会通过静电或π-阳离子相互作用直接稳定烯丙基碳正离子化。取而代之的是，这些酶可能与焦磷酸盐和脂质部分紧密结合，以促进催化作用，并且所结合的焦磷酸盐产物可提供碳阳离子的静电稳定作用。另一种可能性是这些抑制剂不