9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-chloropurin-2-amine | 141320-73-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-chloropurin-2-amine
• CAS: 141320-73-2
• 化学式: C₂₈H₅₄ClN₅O₄Si₃
• 分子量: 644.477
• InChiKey: QZVOPKBJACNRGH-UMCMBGNQSA-N

物化性质

• 沸点：
  622.4±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.12±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.76
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-chloropurin-2-amine 在 四丁基氟化铵 、 氨 、 亚硝酸异戊酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 24.33h， 生成 海绵核苷
  参考文献：
  名称：

  A New Method for Synthesis of 2-Alkoxyadenosine Analogs

  摘要：

  O(6)-Methylguanosine and 2-amino-6-chloropurine riboside derivative were treated with isoamylnitrite in the presence of an appropriate alcohol to give the corresponding 2-alkoxy-6-methoxy (or chloro) purine riboside derivatives.

  DOI：

  10.3987/com-11-12295
• 作为产物：
  描述：

  2-amino-6-chloro-9-(2,3,5-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)purine 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-chloropurin-2-amine
  参考文献：
  名称：

  羧酸存在下O6-甲基鸟苷与亚硝酸盐的反应：嘌呤-2-基羧酸酯的合成

  摘要：

  在羧酸存在下，用亚硝酸钠或亚硝酸异戊酯处理O6-甲基鸟苷衍生物，得到嘌呤-2-基羧酸盐，其为嘌呤部分2-位带有羧基的不寻常产物。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2005.09.140

文献信息

• Synthetic approaches to new doubly modified nucleosides: Congeners of cordycepin and related 2′-deoxyadenosine
  作者：Vasu Nair、David F. Purdy

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)90496-x

  日期：1991.1

  molecules and their purities were established by UV, high-field 1H and 13C NMR, and FAB HBMS data. The synthetic approaches presented have generality and provide entry into a variety of doubly modified nucleosides.

  报道了虫草素（化合物20-25）和2'-脱氧腺苷（化合物11、13-15、18、19）的新型类似物的合成。为了从共同的起始化合物2-氨基-6-氯嘌呤核糖核苷进入3'-脱氧和2'-脱氧异构体系列，通过转化为2'，5'-的混合物来保护该前体和3′，5′--甲硅烷基化合物，然后在碳水化合物部分的2'-或3'-位置和基础成分的2-位置进行修饰。讨论了甲硅烷基基团异构化的观察。合成中的其他关键转化是自由基脱氧（碳水化合物部分），自由基碘化（为修饰碱基而定）和金属介导的官能化反应（碱基成分的区域特异性修饰）。通过紫外线，高场1 H和13 C NMR以及FAB HBMS数据确定了最终目标分子的结构及其纯度。所提出的合成方法具有一般性，并提供了进入多种双修饰核苷的途径。
• Nucleic acid related compounds. 74. Synthesis and biological activity of 2'(and 3')-deoxy-2'(and 3')-methylenenucleoside analogs that function as mechanism-based inhibitors of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase and/or ribonucleotide reductase
  作者：Morris J. Robins、Vicente Samano、Weijian Zhang、Jan Balzarini、Erik De Clercq、Ronald T. Borchardt、Younha Lee、Chong Sheng Yuan

  DOI：10.1021/jm00090a020

  日期：1992.6

  with TBDMS chloride/imidazole/DMF gave a separable mixture of 5'-O, 2',5'-bis-O (22), 3',5'-bis-O (23), and 2',3',5'-tris-O-TBDMS derivatives. Oxidation of 22 and 23 with CrO3/pyridine/Ac2O, treatment of the respective ketonucleosides with methylenetriphenylphosphorane, and deprotection gave 2-amino-6-chloro-9-[3(and 2)-deoxy-3(and 2)-methylene- beta-D-erythro-pentofuranosyl]purines (28 and 37) that

  用TBDMS氯化物/咪唑/ DMF处理2-氨基-6-氯-9-（β-D-呋喃呋喃糖基）嘌呤（21）得到5'-O，2'，5'-bis-O的可分离混合物（ 22），3'，5'-bis-O（23）和2'，3'，5'-tris-O-TBDMS衍生物。用CrO3 /吡啶/ Ac2O氧化22和23，用亚甲基三苯基膦烷处理各个酮核苷，并脱保护得到2-氨基-6-氯-9- [3（和2）-脱氧-3（和2）-亚甲基- β-D-赤型-五呋喃糖基]嘌呤（28和37）被转化为其他2-氨基-6-取代的嘌呤类似物。通过类似的方法，将结核菌素转化为2'-脱氧-2'-亚甲基tubercidin（49）。研究了2'-和3'-亚甲基腺苷类似物对S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶的灭活作用。
• The Transcriptome-Wide Mapping of 2-Methylthio-<i>N</i>⁶-isopentenyladenosine at Single-Base Resolution
  作者：Zhentian Fang、Ziang Lu、Shaoqing Han、Yuanyuan Zhou、Wei Yang、Xiaolian Zhang、Xiang Zhou

  DOI：10.1021/jacs.2c13894

  日期：2023.3.8

  A transcriptome-wide and single-base resolution method that enables absolute mapping of ms2i6A along with analysis of its distribution in different RNAs is lacking. Here, through chemoselective methylthio group bioconjugation, we introduce a new approach (redox activated chemical tagging sequencing, ReACT-seq) to detect ms2i6A transcriptome-wide at single-base resolution. Using the chemoselectivity

  已鉴定出数百个修饰碱基并进行酶促修饰以转移 RNA (tRNA) 以调节各种生物体中的 RNA 功能。2-甲硫基-N 6 -异戊烯基腺苷 (ms 2 i 6 A) 是一种在 tRNA 第 37 位发现的超修饰碱基，存在于原核生物和真核生物中。ms 2 i 6 A 传统上是通过使用 RNA 质谱法从总 RNA 中分离和消化每个 tRNA 来识别的。一种全转录组和单碱基分辨率方法，可实现 ms 2 i 6的绝对映射缺乏对其在不同 RNA 中分布的分析。在这里，通过化学选择性甲硫基生物偶联，我们引入了一种新方法（还原激活化学标记测序，ReACT-seq ）以单碱基分辨率检测全转录组 ms 2 i 6 A。利用甲硫基和氧氮丙啶基团之间的化学选择性，ms 2 i 6A 用叠氮基进行生物正交标记，不受规范核苷酸的干扰，从而在测序前促进甲硫基修饰的 RNA 的富集。ReACT-seq 在九个已知的 tRNA
• NAIR, VASU;PURDY, DAVID F., TETRAHEDRON, 47,(1991) N, C. 365-367
  作者：NAIR, VASU、PURDY, DAVID F.

  DOI：——

  日期：——