(2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-(acetyloxymethyl)-6-bis(phenylmethoxy)phosphoryloxyoxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]propanoic acid | 367276-30-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-(acetyloxymethyl)-6-bis(phenylmethoxy)phosphoryloxyoxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]propanoic acid
• CAS: 367276-30-0
• 化学式: C₄₄H₅₈N₃O₂₁P
• 分子量: 995.926
• InChiKey: HQOQLVMTEUVIPC-MZALUPDRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  69
• 可旋转键数：
  27
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  312
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  H-γ-D-Glu(OTMSE)-Lys(NTEOC)-D-Ala-D-AlaOTMSE 、 (2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-(acetyloxymethyl)-6-bis(phenylmethoxy)phosphoryloxyoxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]propanoic acid 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以61%的产率得到2-trimethylsilylethyl (2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-(acetyloxymethyl)-6-bis(phenylmethoxy)phosphoryloxyoxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]propanoyl]amino]-5-oxo-5-[[(2S)-1-oxo-1-[[(2R)-1-oxo-1-[[(2R)-1-oxo-1-(2-trimethylsilylethoxy)propan-2-yl]amino]propan-2-yl]amino]-6-(2-trimethylsilylethoxycarbonylamino)hexan-2-yl]amino]pentanoate
  参考文献：
  名称：

  脂质 II：细菌细胞壁前体的全合成和利用作为底物用于通过大肠杆菌的青霉素结合蛋白 (PBP) 1b 进行糖基转移和转肽

  摘要：

  革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌生命周期中的一个基本特征是新细胞壁的产生。细胞壁也称为 murein，是一种二维聚合物，由线性重复的 N-乙酰胞壁酸 (MurNAc) 和 N-乙酰氨基葡萄糖 (GlcNAc) 基序组成，通过附加到 MurNAc 的肽交联。murein 成熟的最后一步是由一种单一的双功能酶催化，称为高分子量 A 类青霉素结合蛋白 (PBP)。PBP 催化糖单元的聚合（糖基转移），以及利用脂质 II 作为底物的肽交联（转肽）。由于难以获得足够量的脂质 II 以及方便且信息丰富的检测方法，因此对该酶的详细酶学研究受到限制。

  DOI：

  10.1021/ja0166848
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-{(R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6S)-2-Acetoxymethyl-5-acetylamino-6-benzyloxy-3-((2S,3R,4R,5S,6R)-4,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-3-acetylamino-tetrahydro-pyran-2-yloxy)-tetrahydro-pyran-4-yloxy]-propionylamino}-propionic acid 2-trimethylsilanyl-ethyl ester 在 10percent Pd/C 四氮唑 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 (2S)-2-[[(2R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-(acetyloxymethyl)-6-bis(phenylmethoxy)phosphoryloxyoxan-4-yl]oxypropanoyl]amino]propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  脂质 II：细菌细胞壁前体的全合成和利用作为底物用于通过大肠杆菌的青霉素结合蛋白 (PBP) 1b 进行糖基转移和转肽

  摘要：

  革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌生命周期中的一个基本特征是新细胞壁的产生。细胞壁也称为 murein，是一种二维聚合物，由线性重复的 N-乙酰胞壁酸 (MurNAc) 和 N-乙酰氨基葡萄糖 (GlcNAc) 基序组成，通过附加到 MurNAc 的肽交联。murein 成熟的最后一步是由一种单一的双功能酶催化，称为高分子量 A 类青霉素结合蛋白 (PBP)。PBP 催化糖单元的聚合（糖基转移），以及利用脂质 II 作为底物的肽交联（转肽）。由于难以获得足够量的脂质 II 以及方便且信息丰富的检测方法，因此对该酶的详细酶学研究受到限制。

  DOI：

  10.1021/ja0166848

文献信息

• One-Pot Protection-Glycosylation Reactions for Synthesis of Lipid II Analogues
  作者：Katsuhiko Mitachi、Priya Mohan、Shajila Siricilla、Michio Kurosu

  DOI：10.1002/chem.201400307

  日期：2014.4.14

  applied to a one‐pot protection‐glycosylation reaction to form the disaccharide derivative 7 d for the synthesis of lipid II analogues. The temporary protecting group or linker at the C‐6 position and N‐Troc protecting group of 7 d can be cleaved simultaneously through a reductive condition. Overall yields of syntheses of lipid II (1) and neryl‐lipid II Nε‐dansylthiourea are significantly improved by

  (2,6-二氯-4-甲氧基苯基)(2,4-二氯苯基)甲基三氯乙酰亚胺酯( 3 )及其聚合物支撑试剂4可成功应用于一锅保护糖基化反应，形成二糖衍生物7d 用于合成脂质 II 类似物。C-6位的临时保护基或连接基和7d的N -Troc保护基可以通过还原条件同时裂解。通过使用所描述的方法，脂质 II ( 1 ) 和橙花基脂质 II N ε -丹磺基硫脲的合成总产率显着提高。
• The First Total Synthesis of Lipid II:  The Final Monomeric Intermediate in Bacterial Cell Wall Biosynthesis
  作者：Michael S. VanNieuwenhze、Scott C. Mauldin、Mohammad Zia-Ebrahimi、Brian E. Winger、William J. Hornback、Shankar L. Saha、James A. Aikins、Larry C. Blaszczak

  DOI：10.1021/ja017386d

  日期：2002.4.1

  Bacterial peptidoglycan is composed of a network of beta-[1,4]-linked glyan strands that are cross-linked through pendant peptide chains. The final product, the murein sacculus, is a single, covalently closed macromolecule that precisely defines the size and shape of the bacterial cell. The recent increase in bacterial resistance to cell wall active agents has led to a resurgence of activity directed

  细菌肽聚糖由通过悬垂肽链交联的β-[1,4]-连接的聚糖链网络组成。最终产物，胞壁质球囊，是一个单一的、共价闭合的大分子，它精确地定义了细菌细胞的大小和形状。最近细菌对细胞壁活性剂耐药性的增加导致了旨在提高我们对分子水平耐药机制理解的活动的复苏。生物合成酶及其天然底物可以成为这一努力的宝贵工具。虽然现代实验技术已经导致肽聚糖生物合成中使用的生物合成酶的分离和纯化，但从天然底物中确保其必需底物的有用数量仍然存在问题。
• Oxyma-based phosphates for racemization-free peptide segment couplings
  作者：Katsuhiko Mitachi、Yuki E. Kurosu、Brandon T. Hazlett、Michio Kurosu

  DOI：10.1002/psc.2859

  日期：2016.3

  aprotic solvents and is an effective coupling reagent for N‐acyl‐protected α‐amino acids and oligo peptide segments. The conditions reported here is also effective in lactam‐forming reactions. Unlike most of the reported coupling reagents, simple aqueous work‐up procedures can remove the reagents and by‐products generated in the reactions. Copyright © 2016 European Peptide Society and John Wiley & Sons

  甘油丙酮醛-氧[[（2,2-二甲基-1,3-二氧杂戊-4-基）甲基2-氰基-2-（羟基亚氨基）乙酸酯（1）]显示出显着的理化性质，作为肽形成反应的添加剂。尽管已经在水或DMF介质中对具有EDCI，1和NaHCO 3的N氨基甲酸酯保护的α氨基酸建立了无消旋的酰胺形成反应，但N酰基保护的α氨基的酰胺形成了反应。酸和寡肽的片段偶联仍需要进一步开发。二乙基磷酰基-甘油丙酮酸-氧化酶（DPGOx 3）在非质子传递溶剂中表现出相对的稳定性，是一种有效的偶联剂，可用于N酰基保护的α氨基酸和寡肽片段。此处报道的条件在形成内酰胺的反应中也有效。与大多数报道的偶合试剂不同，简单的水溶液后处理程序可以除去反应中产生的试剂和副产物。版权所有©2016欧洲多肽协会和John Wiley＆Sons，Ltd.
• Insights into the Mechanism of Action of the Two-Peptide Lantibiotic Lacticin 3147
  作者：Alireza Bakhtiary、Stephen A. Cochrane、Pascal Mercier、Ryan T. McKay、Mark Miskolzie、Clarissa S. Sit、John C. Vederas

  DOI：10.1021/jacs.7b04728

  日期：2017.12.13

  LtnA2) that displays nanomolar activity against many Gram-positive bacteria. Lacticin 3147 may exert its antimicrobial effect by several mechanisms. Isothermal titration calorimetry experiments show that only LtnA1 binds to the peptidoglycan precursor lipid II, which could inhibit peptidoglycan biosynthesis. An experimentally supported model of the resulting complex suggests that the key binding partners

  Lacticin 3147 是一种双肽 lantibiotc（LtnA1 和 LtnA2），对许多革兰氏阳性菌显示出纳摩尔级的活性。Lacticin 3147 可能通过多种机制发挥其抗菌作用。等温滴定量热实验表明，只有 LtnA1 与肽聚糖前体脂质 II 结合，可以抑制肽聚糖的生物合成。所得复合物的实验支持模型表明，关键的结合伙伴是 LtnA1 的 C 端和脂质 II 的焦磷酸盐。体内和体外检测的组合表明 LtnA1 和 LtnA2 可以诱导快速膜裂解，而无需脂质 II 结合。然而，脂质 II 的存在大大增加了乳酸菌素 3147 的活性。此外，
• Optimizations of lipid II synthesis: an essential glycolipid precursor in bacterial cell wall synthesis and a validated antibiotic target
  作者：Milandip Karak、Cian R Cloonan、Brad R Baker、Rachel V K Cochrane、Stephen A Cochrane

  DOI：10.3762/bjoc.20.22

  日期：——

  glycolipid found in bacteria. Accessing this valuable cell wall precursor is important both for studying cell wall synthesis and for studying/identifying novel antimicrobial compounds. Herein, we describe optimizations to the modular chemical synthesis of lipid II and unnatural analogues. In particular, the glycosylation step, a critical step in the formation of the central disaccharide unit (GlcNAc-MurNAc)

  抽象的 脂质 II 是细菌中发现的一种必需糖脂。获取这种有价值的细胞壁前体对于研究细胞壁合成和研究/鉴定新型抗菌化合物都很重要。在此，我们描述了脂质 II 和非天然类似物的模块化化学合成的优化。特别是，优化了糖基化步骤，这是形成中心二糖单元（GlcNAc-MurNAc）的关键步骤。这是通过使用具有不同离去基团的糖基供体来实现的。这种方法的主要优点在于其适应性，允许通过在合成的不同阶段合并替代构建模块来生成多种类似物。 Beilstein J. Org. Chem. 2024, 20, 220–227. doi:10.3762/bjoc.20.22