2-acetamido-2-deoxy-α-D-glucopyranosyl fluoride

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2-acetamido-2-deoxy-α-D-glucopyranosyl fluoride
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-2-fluoro-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₈H₁₄FNO₅
• 分子量: 223.201
• InChiKey: IANKFFYQXUALKP-PVFLNQBWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  99
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-acetamido-2-deoxy-α-D-glucopyranosyl fluoride 在 N,N'-Diacetylchitobiose 、 BcChi-A, GH₁₉ chitinase from moss Bryum coronatum 、 chitobiose phosphorylase from Vibrio proteolyticus 、 水 作用下， 反应 99.0h， 生成 di-N-acetylchitobiose
  参考文献：
  名称：

  A glycosynthase derived from an inverting GH19 chitinase from the moss Bryum coronatum

  摘要：

  BcChi-A 是一种来自藓苔 Bryum coronatum 的 GH19 几丁质酶，它是一种内作用酶，可通过倒置机制水解几丁质的糖苷键 (GlcNAc)n[聚合度为 n 的 GlcNAc（N-乙酰葡糖胺）β-1,4 链式多糖]。在没有(GlcNAc)2或有(GlcNAc)2存在的情况下，野生型酶与α-(GlcNAc)2-F [α-(GlcNAc)2氟化物]孵育时，发现(GlcNAc)2和氟化氢是通过Hehre再合成-水解机制产生的。为了将 BcChi-A 转化为糖合成酶，我们采用了 Honda 等人报告的策略[（2006）J. Biol. Chem. 281, 1426-1431; （2008）Glycobiology 18, 325-330]，即突变具有亲核水分子的 Ser102 和作为催化碱基的 Glu70，产生 S102A、S102C、S102D、S102G、S102H、S102T、E70G 和 E70Q。在我们使用的条件下，除 S102T 外，所有突变酶都检测不到对 (GlcNAc)6 的水解活性。在无活性的 BcChi-A 突变体中，发现 S102A、S102C、S102G 和 E70G 能在 (GlcNAc)2 存在的情况下成功合成 (GlcNAc)4 作为来自 α-(GlcNAc)2-F的主要产物。S102A 突变体的糖合成酶活性最强，因为它的 F 释放活性增强，水解活性被抑制。这是首次报道使用氨基糖氟化物作为供体底物的糖合成酶。

  DOI：

  10.1042/bj20120036
• 作为产物：
  描述：

  2-deoxy-2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-D-glucopyranose 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 2-acetamido-2-deoxy-α-D-glucopyranosyl fluoride
  参考文献：
  名称：

  A glycosynthase derived from an inverting GH19 chitinase from the moss Bryum coronatum

  摘要：

  BcChi-A 是一种来自藓苔 Bryum coronatum 的 GH19 几丁质酶，它是一种内作用酶，可通过倒置机制水解几丁质的糖苷键 (GlcNAc)n[聚合度为 n 的 GlcNAc（N-乙酰葡糖胺）β-1,4 链式多糖]。在没有(GlcNAc)2或有(GlcNAc)2存在的情况下，野生型酶与α-(GlcNAc)2-F [α-(GlcNAc)2氟化物]孵育时，发现(GlcNAc)2和氟化氢是通过Hehre再合成-水解机制产生的。为了将 BcChi-A 转化为糖合成酶，我们采用了 Honda 等人报告的策略[（2006）J. Biol. Chem. 281, 1426-1431; （2008）Glycobiology 18, 325-330]，即突变具有亲核水分子的 Ser102 和作为催化碱基的 Glu70，产生 S102A、S102C、S102D、S102G、S102H、S102T、E70G 和 E70Q。在我们使用的条件下，除 S102T 外，所有突变酶都检测不到对 (GlcNAc)6 的水解活性。在无活性的 BcChi-A 突变体中，发现 S102A、S102C、S102G 和 E70G 能在 (GlcNAc)2 存在的情况下成功合成 (GlcNAc)4 作为来自 α-(GlcNAc)2-F的主要产物。S102A 突变体的糖合成酶活性最强，因为它的 F 释放活性增强，水解活性被抑制。这是首次报道使用氨基糖氟化物作为供体底物的糖合成酶。

  DOI：

  10.1042/bj20120036

文献信息

• On the phosphorylase activity of GH3 enzymes: A β-N-acetylglucosaminidase from Herbaspirillum seropedicae SmR1 and a glucosidase from Saccharopolyspora erythraea
  作者：Diogo R.B. Ducatti、Madison A. Carroll、David L. Jakeman

  DOI：10.1016/j.carres.2016.09.015

  日期：2016.11

  of the reaction. The enzyme showed a broad aglycone site specificity, being able to hydrolyze sugar phosphates beta-D-GlcNAc 1P and beta-D-Glc 1P, albeit at a fraction of the rate of hydrolysis of aryl glycosides. GH3 beta-glucosidase EryBI, that does not have a histidine as the general acid/base residue, also hydrolyzed beta-D-Glc 1P, at comparable rates to Hsero1941. These data indicate that Hsero1941

  据报道，糖苷水解酶家族3（GH3）的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶具有磷酸化活性，这为不常见的组氨酸作为催化酸/碱残基提供了有趣的解释，并暗示该家族的成员可能是磷酸化酶[J. 生物学 化学 2015，290，4887]。在这里，我们描述了Hsero1941的特征，Hsero1941是一种来自内生固氮细菌草拟螺旋藻SmR1的GH3β-N-乙酰氨基葡糖苷酶。该酶对pNP-β-D-GlcNAcp（Km = 0.24 mM，kcat = 1.2 s-1，kcat / Km = 5.0 mM-1s-1）具有明显高于pNP-β-D-Glcp（Km = 33）的活性mM，kcat = 3.3 x 10-3 s-1，kcat / Km = 9 x 10-4 mM-1s-1）。磷酸盐的存在不能显着改变反应的动力学参数。该酶显示出广泛的糖苷配基位点特异性，能够水解磷酸糖β-D-GlcNAc1P和β-D-Glc1P
• Alkylation of Glycosyl Fluorides
  作者：Joachim Thiem、Matthias Wiesner

  DOI：10.1055/s-1988-27486

  日期：——

  A direct alkylation of unprotected glycosyl fluorides under mild basic conditions without affecting the anomeric group is reported. Thus peralkylated glycosyl fluorides, applied in Lewis acid catalyzed glycosylations, are now effectively available from the starting sugar in two simple steps.

  据报告，在温和的碱性条件下，未保护的糖基氟化物可以直接烷基化，且不影响其异构体。因此，在路易斯酸催化糖基化反应中应用的过烷基化糖基氟化物，现在可以通过两个简单的步骤从起始糖有效制备。
• Efficient Coupling of Complex Fluorooligosaccharides to Phenolic Peptide Mediated by Calcium Iodide
  作者：Pei Liu、Xing Quan、Fangyu Wei、Xianjun Deng、Jie Shen、Jiansong Cheng

  DOI：10.1002/cjoc.202300170

  日期：2023.10

  serving as therapeutic agents and building blocks for glycoprotein synthesis, homogeneous synthetic glycopeptides also benefit understanding function of specific glycoform. However, the selectivity coupling of oligosaccharides to a given peptide remains challenging despite the fact that the synthesis of structure-defined complex oligosaccharides has been greatly facilitated by chemo-enzymatic based approaches

  除了用作治疗剂和糖蛋白合成的构建模块之外，均质合成糖肽还有助于理解特定糖型的功能。然而，尽管基于化学酶的方法极大地促进了结构确定的复杂寡糖的合成，但寡糖与给定肽的选择性偶联仍然具有挑战性。在此，开发了Ca 2+促进的糖基化方法，以使用一组生物学上重要的聚糖专门修饰酚肽。
• [EN] PROCESS FOR PRODUCING 1-FLUORO-GLYCURONIC ACIDS AND THEIR SALTS AND SUCH NEW 1-FLUORO-GLYCONIC ACIDS AND THEIR SALTS
  申请人：HOECHST AKTIENGESELLSCHAFT

  公开号：WO1990014350A1

  公开（公告）日：1990-11-29

  (DE) Verfahren zur Herstellung von 1-Fluor-glycuronsäuren, die geschützte Aminogruppen enthalten können, und deren Salzen, dadurch gekennzeichnet, daß man Glycopyranosylfluoride von Mono- bzw. Oligosacchariden, die wenigstens eine primäre OH-Funktion tragen, in wäßriger Lösung im pH-Bereich von 6 bis 9 mit Sauerstoff als Oxydationsmittel in Gegenwart eines Katalysators, der wenigstens ein Platinemetall enthält, oxydiert und die entstehenden 1-Fluor-glycuronsäuren wenigstens teilweise neutralisiert. Die Erfindung bezieht sich ferner auf Verbindungen der allgemeinen Formel (I), in der M für Wasserstoff oder ein Kation, insbesondere Alkalimetall steht und X unabhängig voneinander Sauerstoff oder NH bedeutet, wobei für X = Sauerstoff R die Bedeutung von Wasserstoff oder einem glycosidisch gebundenen Monosaccharid und für X = NH R für einen Acyl-, Alkyl-, Aryl- oder Aralkyl-Schutzgruppenrest mit bis zu 10 C-Atomen steht, wobei aber nur eine der Gruppen RX eine andere Bedeutung als OH hat.(EN) A process for producing 1-fluoro-glycuronic acids which may contain protected amino groups and their salts, in which glycopyranosylfluorides of mono or oligo-saccharides with at least one primary OH function are oxidised in aqueous solution in the pH region of 6 to 9, using oxygen as the oxidising agent, in the presence of a catalyst containing at least one metal of the platinum group, the resultant 1-fluoro-glycuronic acids are at least partially neutralised. The invention also relates to compounds of general formula (I), in which M is hydrogen or a cation, especially an alkaline metal, X is oxygen or NH, mutually independently, where with X = oxygen, R is hydrogen or a glycosidically bonded monosaccharide and where with X = NH, R is an acyl, alkyl, aryl or aralkyl protective group radical with up to 10 C atoms, but where only one of the RX groups stands for anything other than OH.(FR) Selon un procédé de production d'acides 1-fluoroglycuroniques, qui peuvent contenir des groupes amines protégés, et de leurs sels, on oxyde des glycopyranosylfluorures de monosaccharides ou d'oligosaccharides, porteurs d'au moins une fonction OH primaire, dans une solution aqueuse à pH compris entre 6 et 9, avec de l'oxygène en tant qu'oxydant, en présence d'un catalyseur qui contient au moins un métal du groupe platine, puis on neutralise au moins en partie les acides 1-fluoroglycuroniques ainsi obtenus. L'invention concerne en outre des composés ayant la formule générale (I), dans laquelle M représente hydrogène ou un cation, notamment d'un métal alcalin, et X représente oxygène ou NH. Lorsque X représente oxygène, R est de hydrogène ou un monosaccharide lié glycosidiquement et lorsque X représente NH, R est un résidu de groupe protecteur acyle, alkyle, aryle ou aralkyle ayant jusqu'à 10 atomes de carbone, à condition que seul un groupe RX ait une signification différente d'OH.

  一种生产带有可保护基团胺的1-氟-半乳糖苷酸及其盐类的方法，其特征在于将从单糖或多糖聚合物，其中至少含有一个直链羟基的6─9 pH范围内的水溶液中的ᵗ⌘ﾀ流畅基团进行氧化，在铂族金属的催化下，用氧气作为氧化剂，并通过加氢中和产生的1-氟-半乳糖苷酸的至少部分。此外还包括通常有如下式进行表示的化合物： **(I) 其中 M 必须表示氢或者一个阳离子，尤其是碱金属，X 表示氧或者氮，并且相互独立。当 X 为氧时，则R必须表示氢或与直链单糖以糖苷形式连接的多糖聚合物的R组；而当 X 为氮时，R表示酰基、烷基、苯基或者苯环基的保护基团根，最多包含10个碳原子。但是在这样的组合中有且仅有一个复合体的R X 不代表羟基。**
• Micheel; Wulff, Chemische Berichte, 1956, vol. 89, p. 1521,1529
  作者：Micheel、Wulff

  DOI：——

  日期：——