7-dimethylallyl-L-tryptophan | 20880-68-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 7-dimethylallyl-L-tryptophan
• 英文别名: tryptophan, 1-(1,1-dimethylallyl)-, L-；N-(1,1-dimethyl-1-allyl)tryptophan；R-N-Dmat；(2S)-2-amino-3-[1-(2-methylbut-3-en-2-yl)indol-3-yl]propanoic acid
• CAS: 20880-68-6
• 化学式: C₁₆H₂₀N₂O₂
• 分子量: 272.347
• InChiKey: LOCNLUOBLWSOIZ-ZDUSSCGKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  68.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-dimethylallyl-L-tryptophan 在 sodium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.17h， 生成 (S)-2-[[(S)-3-[1-(1,1-Dimethyl-allyl)-1H-indol-3-yl]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-propionyl]-(3-methyl-but-2-enyl)-amino]-3-(1H-indol-3-yl)-propionic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Okaramine N 的短、对映选择性全合成

  摘要：

  已通过中间体 2-7 完成了双吲哚生物碱 okaramine 家族成员 okaramine N (1) 的首次对映选择性全合成。(S)-色氨酸甲酯 (2) 的 N-异戊二烯化衍生物与 Fmoc 保护的 N-叔异戊二烯化色氨酸 (3) 偶联形成酰胺 4，产率为 70%。Pd(II) 介导的环化/重排是合成中的关键步骤，将 4 转化为吲哚氮辛 5 (44%)，在一步中脱保护和环化得到六环二酮哌嗪 6 (95%)。在以下新颖的关键序列中，6 转化为 1：(1) 与 N-甲基三唑啉二酮的选择性烯反应，(2) 剩余的叔异戊二烯化吲哚亚基光氧化以提供 7，以及 (3) 7 的热逆烯反应得到 okaramine N (70% from 6)。

  DOI：

  10.1021/ja034491+
• 作为产物：
  描述：

  1,1-二甲基丙-2-炔基乙酸酯 在 palladium on activated charcoal 喹啉 、 lithium hydroxide 、 氯化亚砜 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 、 copper(l) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.33h， 生成 7-dimethylallyl-L-tryptophan
  参考文献：
  名称：

  Okaramine N 的短、对映选择性全合成

  摘要：

  已通过中间体 2-7 完成了双吲哚生物碱 okaramine 家族成员 okaramine N (1) 的首次对映选择性全合成。(S)-色氨酸甲酯 (2) 的 N-异戊二烯化衍生物与 Fmoc 保护的 N-叔异戊二烯化色氨酸 (3) 偶联形成酰胺 4，产率为 70%。Pd(II) 介导的环化/重排是合成中的关键步骤，将 4 转化为吲哚氮辛 5 (44%)，在一步中脱保护和环化得到六环二酮哌嗪 6 (95%)。在以下新颖的关键序列中，6 转化为 1：(1) 与 N-甲基三唑啉二酮的选择性烯反应，(2) 剩余的叔异戊二烯化吲哚亚基光氧化以提供 7，以及 (3) 7 的热逆烯反应得到 okaramine N (70% from 6)。

  DOI：

  10.1021/ja034491+

文献信息

• Biochemical and Mechanistic Characterization of the Fungal Reverse <i>N-</i>1-Dimethylallyltryptophan Synthase DMATS1_Ff
  作者：Immo Burkhardt、Zhongfeng Ye、Slavica Janevska、Bettina Tudzynski、Jeroen S. Dickschat

  DOI：10.1021/acschembio.9b00828

  日期：2019.12.20

  to convert tyrosine into its regularly O-prenylated derivative. Investigation of the binding sites of DMATS1Ff by homology modeling and comparison to the crystal structure of 4-DMATS FgaPT2 showed an almost identical site for DMAPP binding but different residues for tryptophan coordination. Several putative active site residues were verified by site directed mutagenesis of DMATS1Ff. Homology models of

  二甲基烯丙基色氨酸合酶催化（寡聚）异戊烯基焦磷酸向芳香族底物（如色氨酸衍生物）的区域特异性转移。这些反应是真菌和细菌次生代谢产物许多生物合成途径中的关键步骤。藤本镰刀菌的重组DMATS1Ff的体外研究确定了该酶为真菌来源的第一个选择性反向色氨酸-N-1异戊二烯基转移酶。该酶还能够催化色氨酸的反向N-geranyation。已显示DMATS1Ff与真菌酪氨酸O-异戊二烯基转移酶和真菌7-DMATS在系统发育上相关。像这些酶一样，DMATS1Ff能够将酪氨酸转化为其规则的O-戊烯基化衍生物。通过同源性建模研究DMATS1Ff的结合位点并与4-DMATS FgaPT2的晶体结构进行比较，发现DMAPP结合的位点几乎相同，而色氨酸配位的位点却不同。DMATS1Ff的定点诱变验证了几个推定的活性位点残基。系统发育相关酶的同源性模型显示出相似的色氨酸结合残基，表明色氨酸和DMAPP具有统一的底物结合方
• Tyrosine <i>O</i>-Prenyltransferase SirD Catalyzes <i>S</i>-, <i>C</i>-, and <i>N</i>-Prenylations on Tyrosine and Tryptophan Derivatives
  作者：Jeffrey D. Rudolf、C. Dale Poulter

  DOI：10.1021/cb400691z

  日期：2013.12.20

  prenylation of the hydroxyl group in tyrosine as the first committed step in the biosynthesis of the phytotoxin sirodesmin PL. SirD also catalyzes normal N-prenylation of 4-aminophenylalanine and normal C-prenylation at C7 of tryptophan. In this study, we found that 4-mercaptophenylalanine and several derivatives of tryptophan are also substrates for prenylation by dimethylallyl diphosphate. Incubation

  Leptosphaeria maculans 中的酪氨酸O-异戊二烯基转移酶SirD催化酪氨酸中羟基的正常异戊二烯化，这是植物毒素西洛地明 PL 生物合成的第一步。SirD还催化4-氨基苯丙氨酸的正常N-异戊二烯化和色氨酸C7处的正常C-异戊二烯化。在这项研究中，我们发现 4-巯基苯丙氨酸和色氨酸的几种衍生物也是二甲基烯丙基二磷酸异戊二烯化的底物。将 SirD 与 4-巯基苯丙氨酸一起孵育得到正常的S-异戊二烯化巯基苯丙氨酸。我们发现，除了先前报道的 C7 处的正常异戊二烯化之外，酶与色氨酸的温育还会在 N1 处产生反向异戊二烯化。4-甲基色氨酸也在 C7 处产生正常异戊二烯化，在 N1 处产生反向异戊二烯化，而 4-甲氧基色氨酸在 C7 处产生正常和反向异戊二烯化，7-甲基色氨酸在 C6 处产生正常异戊二烯化，在 N1 处产生反向异戊二烯化。SirD 在吲哚核上三个不同位点异戊二烯化的能
• Substrate Promiscuity of the Cyclic Dipeptide Prenyltransferases from <i>Aspergillus fumigatus</i>
  作者：Huixi Zou、Xiaodong Zheng、Shu-Ming Li

  DOI：10.1021/np800501m

  日期：2009.1.23

  This study reports that a series of tryptophan derivatives with modifications on the side chain or at the indole ring were accepted by two cyclic dipeptide prenyltransferases, CdpNPT and FtmPT1, and converted to prenylated derivatives. The structures of the enzymatic products were elucidated by NMR and MS analyses. In comparison to cyclic dipeptides, which were reversely prenylated by CdpNPT at N-1 and in a regular manner by FtmPT1 at C-2, respectively, tryptophan and its simple derivatives were prenylated reversely by both enzymes at N-1. These results demonstrated the substrate promiscuity of both enzymes.
• Functional Characterization of the Cyclomarin/Cyclomarazine Prenyltransferase CymD Directs the Biosynthesis of Unnatural Cyclic Peptides
  作者：Andrew W. Schultz、Chad A. Lewis、Michael R. Luzung、Phil S. Baran、Bradley S. Moore

  DOI：10.1021/np9006876

  日期：2010.3.26

  In vitro and in vivo characterization of the cyclomarin/cyclomarazine prenyltransferase CymD revealed its ability to prenylate tryptophan prior to incorporation into both cyclic peptides by the nonribosomal peptide synthetase CymA. This knowledge was utilized to bioengineer novel derivatives of these marine bacterial natural products by providing synthetic N-alkyl tryptophans to a mutant of Salinispora arenicola CNS-205.