(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[1-(2-methylbut-3-en-2-yl)indol-3-yl]propanoic acid | 539795-20-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[1-(2-methylbut-3-en-2-yl)indol-3-yl]propanoic acid
• CAS: 539795-20-5
• 化学式: C₃₁H₃₀N₂O₄
• 分子量: 494.59
• InChiKey: FMPDDWAGZOVTLU-MHZLTWQESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.1
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  80.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[1-(2-methylbut-3-en-2-yl)indol-3-yl]propanoic acid 在 palladium diacetate 、 氧气 、 亚甲兰 、 溶剂黄146 、 二乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 okaramine N
  参考文献：
  名称：

  Okaramine N 的短、对映选择性全合成

  摘要：

  已通过中间体 2-7 完成了双吲哚生物碱 okaramine 家族成员 okaramine N (1) 的首次对映选择性全合成。(S)-色氨酸甲酯 (2) 的 N-异戊二烯化衍生物与 Fmoc 保护的 N-叔异戊二烯化色氨酸 (3) 偶联形成酰胺 4，产率为 70%。Pd(II) 介导的环化/重排是合成中的关键步骤，将 4 转化为吲哚氮辛 5 (44%)，在一步中脱保护和环化得到六环二酮哌嗪 6 (95%)。在以下新颖的关键序列中，6 转化为 1：(1) 与 N-甲基三唑啉二酮的选择性烯反应，(2) 剩余的叔异戊二烯化吲哚亚基光氧化以提供 7，以及 (3) 7 的热逆烯反应得到 okaramine N (70% from 6)。

  DOI：

  10.1021/ja034491+
• 作为产物：
  描述：

  1,1-二甲基丙-2-炔基乙酸酯 在 palladium on activated charcoal 喹啉 、 lithium hydroxide 、 氯化亚砜 、 氢气 、 sodium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 、 copper(l) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.5h， 生成 (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[1-(2-methylbut-3-en-2-yl)indol-3-yl]propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Okaramine N 的短、对映选择性全合成

  摘要：

  已通过中间体 2-7 完成了双吲哚生物碱 okaramine 家族成员 okaramine N (1) 的首次对映选择性全合成。(S)-色氨酸甲酯 (2) 的 N-异戊二烯化衍生物与 Fmoc 保护的 N-叔异戊二烯化色氨酸 (3) 偶联形成酰胺 4，产率为 70%。Pd(II) 介导的环化/重排是合成中的关键步骤，将 4 转化为吲哚氮辛 5 (44%)，在一步中脱保护和环化得到六环二酮哌嗪 6 (95%)。在以下新颖的关键序列中，6 转化为 1：(1) 与 N-甲基三唑啉二酮的选择性烯反应，(2) 剩余的叔异戊二烯化吲哚亚基光氧化以提供 7，以及 (3) 7 的热逆烯反应得到 okaramine N (70% from 6)。

  DOI：

  10.1021/ja034491+

文献信息

• Total synthesis of desoxycyclomarin C and the cyclomarazines A and B
  作者：Philipp Barbie、Uli Kazmaier

  DOI：10.1039/c6ob00801a

  日期：——

  Removing the β-hydroxy group from the prenylated tryptophan moiety of cyclomarins simplifies the synthesis of these interesting natural products significantly, without having a noteworthy effect on the anti-tuberculosis activity of the cyclomarins. In contrast, cyclomarazines did not show biological activity.

  从环海马的烯丙基化的色氨酸部分除去β-羟基显着简化了这些有趣的天然产物的合成，而对环海马的抗结核活性没有显着影响。相反，环马拉嗪没有显示生物活性。
• 10.1021/jacs.4c04711
  作者：Ding, Yaoyu、Lambden, Edward、Peate, Jessica、Picken, Lewis J.、Rees, Thomas W.、Perez-Ortiz, Gustavo、Newgas, Sophie A.、Spicer, Lucy A. R.、Hicks, Thomas、Hess, Jeannine、Ulmschneider, Martin B.、Müller, Manuel M.、Barry, Sarah M.

  DOI：10.1021/jacs.4c04711

  日期：——

  biosynthetic precursor peptide sequence with a highly reactive C-terminus to produce NRcPs and analogues in minutes. The method was applied to several NRcPs of varying sequences, ring sizes, and cyclization modes including rufomycin, colistin, and gramicidin S with comparable success. We thus demonstrate that the linear order of modules in NRPS enzymes that determines peptide sequence encodes the key structural

  非核糖体环肽（NRcP）是结构复杂的天然产物，也是重要的治疗药物，特别是抗生素。它们的结构多样性源于多域酶组装线、非核糖体肽合成酶 (NRPS) 的能力，能够利用定制的非蛋白氨基酸、在延伸过程中修饰线性肽，并催化一系列环化模式，例如头到尾、侧面链到尾。 NRcP 的研究和药物开发往往因缺乏容易合成的 NRcP 及其类似物而受到限制，其中选择性大环内酰胺化是一个主要瓶颈。在此，我们报告了一种普遍适用的化学大环化方法，其速度和选择性前所未有。受生物合成环化的启发，它将脱保护的线性生物合成前体肽序列与高反应性C末端相结合，可在几分钟内产生 NRcP 和类似物。该方法适用于多种不同序列、环大小和环化模式的 NRcP，包括红霉素、粘菌素和短杆菌肽 S，并取得了相当的成功。因此，我们证明了 NRPS 酶中决定肽序列的模块的线性顺序编码关键结构信息，以产生构象偏向于大环化的肽。为了在合成上充分利用这种构
• Short, Enantioselective Total Synthesis of Okaramine N
  作者：Phil S. Baran、Carlos A. Guerrero、E. J. Corey

  DOI：10.1021/ja034491+

  日期：2003.5.1

  enantioselective total synthesis of a member of the okaramine family of bis-indole alkaloids, okaramine N (1), has been accomplished via intermediates 2-7, as outlined. The N-prenylated derivative of (S)-tryptophan methyl ester (2) was coupled with Fmoc-protected N-tert-prenylated tryptophan (3) to form the amide 4 in 70% yield. Pd(II)-mediated cyclization/rearrangement, a key step in the synthesis, transformed

  已通过中间体 2-7 完成了双吲哚生物碱 okaramine 家族成员 okaramine N (1) 的首次对映选择性全合成。(S)-色氨酸甲酯 (2) 的 N-异戊二烯化衍生物与 Fmoc 保护的 N-叔异戊二烯化色氨酸 (3) 偶联形成酰胺 4，产率为 70%。Pd(II) 介导的环化/重排是合成中的关键步骤，将 4 转化为吲哚氮辛 5 (44%)，在一步中脱保护和环化得到六环二酮哌嗪 6 (95%)。在以下新颖的关键序列中，6 转化为 1：(1) 与 N-甲基三唑啉二酮的选择性烯反应，(2) 剩余的叔异戊二烯化吲哚亚基光氧化以提供 7，以及 (3) 7 的热逆烯反应得到 okaramine N (70% from 6)。