1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)ethanone | 1134395-17-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)ethanone
• 英文别名: 1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)ethan-1-one；Ethanone, 1-[4-[3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl]phenyl]-；1-[4-[3-(trifluoromethyl)diazirin-3-yl]phenyl]ethanone
• CAS: 1134395-17-7
• 化学式: C₁₀H₇F₃N₂O
• 分子量: 228.174
• InChiKey: CYJMBCIRKFTBLI-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  268.0±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.40±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  41.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)ethanone 在 2-甲基-2-硝基丙烷 、 sodium hydride 、 β-环糊精 、 copper(ll) bromide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 19.08h， 生成 ethyl 2-(but-3-yn-1-yloxy)-4-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)thiazole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Wnt途径屏幕上的目标反卷积工作揭示了氧化磷酸化和SERCA2的双重调节。

  摘要：

  Wnt信号传导对于发育，细胞增殖和分化至关重要，这种途径中导致组成性信号传导的突变与多种癌症有关。使用依赖于Wnt的报道分子进行的途径筛选确定了基于1,2,3-噻二唑-5-羧酰胺（TDZ）核心且具有亚微摩尔效价的化学系列。在此，我们报告了一项全面的作用机理反卷积研究，旨在确定该功效系列的功效目标和生物学含义，涉及自下而上的定量化学蛋白质组学，细胞生物学和生化方法。通过观察我们的探针对代谢的影响并进行验证性的细胞和生化测定，我们发现该化学系列通过解偶联线粒体电位来抑制ATP合成。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201700028
• 作为产物：
  描述：

  2-(4-溴苯基)-2-甲基-1,3-二氧戊环 在 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 盐酸羟胺 、 氨 、 sodium ethanolate 、 三乙胺 、 对甲苯磺酰氯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 78.0h， 生成 1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)ethanone
  参考文献：
  名称：

  Unravelling the Allosteric Targeting of PHGDH at the ACT-Binding Domain with a Photoactivatable Diazirine Probe and Mass Spectrometry Experiments

  摘要：

  丝氨酸生物合成途径是肿瘤增殖的关键因素之一。近年来，针对磷酸甘油醛脱氢酶（PHGDH）这一途径的第一酶的靶向作用加强，被证实是开发新抗癌药物的一种有前途的策略。在吸引人的PHGDH抑制剂中，α-酮硫胺酰胺是其中之一。在先前的研究中，我们已经证明了它们在体外和细胞内抑制PHGDH的有效性。然而，这一系列的作用位点尚未明确，这将有助于合理设计新的抑制剂。在本研究中，利用几种互补的实验技术报告了代表性α-酮硫胺酰胺抑制剂的详细作用机制。引人注目的是，我们的工作导致了在PHGDH上识别出一个可以用于药物开发的变构位点。利用质谱实验和一种原创的α-酮硫胺酰胺二氮基基团光亲和探针，我们确定了PHGDH的ACT调控结构域上的523Q-533F序列作为α-酮硫胺酰胺的结合位点。突变实验进一步证明了我们的化合物在这个变构位点的特异性。因此，我们的结果为利用全新的作用机制开发新的抗癌药物铺平了道路。

  DOI：

  10.3390/molecules26020477

文献信息

• Capture compounds, collections thereof and methods for analyzing the proteome and complex compositions
  申请人：Köster Hubert

  公开号：US20100298168A1

  公开（公告）日：2010-11-25

  Capture compounds and collections thereof and methods using the compounds for the analysis of biomolecules are provided. In particular, collections, compounds and methods are provided for analyzing complex protein mixtures, such as the proteome. The compounds are multifunctional reagents that provide for the separation and isolation of complex protein mixtures. Automated systems for performing the methods also are provided.

  提供了用于分析生物分子的捕获化合物及其集合和方法。特别是，提供了用于分析复杂蛋白质混合物（如蛋白质组）的集合、化合物和方法。这些化合物是多功能试剂，可用于分离和分离复杂的蛋白质混合物。还提供了执行这些方法的自动化系统。
• Synthesis and evaluation of photoreactive probes to elucidate iodide efflux in thyrocytes
  作者：Séverine Derbré、Nathalie Lecat-Guillet、Florence Pillon、Yves Ambroise

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.12.008

  日期：2009.2

  Four photoreactive analogues of 3-biphenyl-40-yl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b]thiazole were prepared and evaluated as iodide sequestering agents in sodium iodide symporter-expressing cells. One of these new photoactivatable compounds retained biological activity and was further radiolabeled with tritium. This compound may provide a useful tool for labeling, purification, and identification of target protein responsible for iodide efflux in thyrocytes. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• NOVEL MOLECULES FOR TARGETING RIBOSOMES AND RIBOSOME-INTERACTING PROTEINS, AND USES THEREOF
  申请人：Immagina Biotechnology S.r.l.

  公开号：US20210277044A1

  公开（公告）日：2021-09-09

  Molecule having the structural formula (I): (I) for use as targeting probe of translating ribosomes and ribosome-interacting proteins.
• Target Deconvolution Efforts on Wnt Pathway Screen Reveal Dual Modulation of Oxidative Phosphorylation and SERCA2
  作者：Matias Casás-Selves、Andrew X. Zhang、James E. Dowling、Stefan Hallén、Aarti Kawatkar、Nicholas J. Pace、Christopher R. Denz、Timothy Pontz、Farzin Garahdaghi、Qing Cao、Alan Sabirsh、Kumar Thakur、Nichole O'Connell、Jun Hu、Iván Cornella-Taracido、Eranthie Weerapana、Michael Zinda、Robert A. Goodnow、M. Paola Castaldi

  DOI：10.1002/cmdc.201700028

  日期：2017.6.21

  confirmatory cellular and biochemical assays, we found that this chemical series inhibits ATP synthesis by uncoupling the mitochondrial potential. Affinity chemoproteomics experiments identified sarco(endo)plasmic reticulum Ca2+ -dependent ATPase (SERCA2) as a binding partner of the TDZ series, and subsequent validation studies suggest that the TDZ series can act as ionophores through SERCA2 toward Wnt pathway

  Wnt信号传导对于发育，细胞增殖和分化至关重要，这种途径中导致组成性信号传导的突变与多种癌症有关。使用依赖于Wnt的报道分子进行的途径筛选确定了基于1,2,3-噻二唑-5-羧酰胺（TDZ）核心且具有亚微摩尔效价的化学系列。在此，我们报告了一项全面的作用机理反卷积研究，旨在确定该功效系列的功效目标和生物学含义，涉及自下而上的定量化学蛋白质组学，细胞生物学和生化方法。通过观察我们的探针对代谢的影响并进行验证性的细胞和生化测定，我们发现该化学系列通过解偶联线粒体电位来抑制ATP合成。
• Unravelling the Allosteric Targeting of PHGDH at the ACT-Binding Domain with a Photoactivatable Diazirine Probe and Mass Spectrometry Experiments
  作者：Quentin Spillier、Séverine Ravez、Simon Dochain、Didier Vertommen、Léopold Thabault、Olivier Feron、Raphaël Frédérick

  DOI：10.3390/molecules26020477

  日期：——

  The serine biosynthetic pathway is a key element contributing to tumor proliferation. In recent years, targeting of phosphoglycerate dehydrogenase (PHGDH), the first enzyme of this pathway, intensified and revealed to be a promising strategy to develop new anticancer drugs. Among attractive PHGDH inhibitors are the α-ketothioamides. In previous work, we have demonstrated their efficacy in the inhibition of PHGDH in vitro and in cellulo. However, the precise site of action of this series, which would help the rational design of new inhibitors, remained undefined. In the present study, the detailed mechanism-of-action of a representative α-ketothioamide inhibitor is reported using several complementary experimental techniques. Strikingly, our work led to the identification of an allosteric site on PHGDH that can be targeted for drug development. Using mass spectrometry experiments and an original α-ketothioamide diazirine-based photoaffinity probe, we identified the 523Q-533F sequence on the ACT regulatory domain of PHGDH as the binding site of α-ketothioamides. Mutagenesis experiments further documented the specificity of our compound at this allosteric site. Our results thus pave the way for the development of new anticancer drugs using a completely novel mechanism-of-action.

  丝氨酸生物合成途径是肿瘤增殖的关键因素之一。近年来，针对磷酸甘油醛脱氢酶（PHGDH）这一途径的第一酶的靶向作用加强，被证实是开发新抗癌药物的一种有前途的策略。在吸引人的PHGDH抑制剂中，α-酮硫胺酰胺是其中之一。在先前的研究中，我们已经证明了它们在体外和细胞内抑制PHGDH的有效性。然而，这一系列的作用位点尚未明确，这将有助于合理设计新的抑制剂。在本研究中，利用几种互补的实验技术报告了代表性α-酮硫胺酰胺抑制剂的详细作用机制。引人注目的是，我们的工作导致了在PHGDH上识别出一个可以用于药物开发的变构位点。利用质谱实验和一种原创的α-酮硫胺酰胺二氮基基团光亲和探针，我们确定了PHGDH的ACT调控结构域上的523Q-533F序列作为α-酮硫胺酰胺的结合位点。突变实验进一步证明了我们的化合物在这个变构位点的特异性。因此，我们的结果为利用全新的作用机制开发新的抗癌药物铺平了道路。