ethyl 3-((6-chloro-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoate | 1373423-17-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: ethyl 3-((6-chloro-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoate
• 英文别名: Ethyl 3-((6-chloro-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoate；ethyl 3-[(6-chloro-2-pyridin-2-ylpyrimidin-4-yl)amino]propanoate
• CAS: 1373423-17-6
• 化学式: C₁₄H₁₅ClN₄O₂
• 分子量: 306.752
• InChiKey: CFBWRVFKMINPCG-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  415.4±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.303±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  77
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 3-((6-chloro-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoate 在 palladium 10% on activated carbon 氢气 、 1-丙基磷酸酐 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 41.67h， 生成 ethyl N-[6-[(2-{3-[(N-{[(1,1-dimethylethyl)oxy]carbonyl}-β-alanyl)amino]phenyl}ethyl)amino]-2-(2-pyridinyl)-4-pyrimidinyl]-β-alaninate
  参考文献：
  名称：

  [EN] N-2-(2-PYRIDINYL)-4-PYRIMIDINYL-BETA-ALANINE DERIVATIVES AS INHIBITORS OF HISTONE DEMETHYLASE JMJD3
  [FR] DÉRIVÉS DE N-2-(2-PYRIDINYL)-4-PYRIMIDINYL-BÊTA-ALANINE EN TANT QU'INHIBITEURS D'HISTONE DÉMÉTHYLASE JMJD3

  摘要：

  治疗自身免疫疾病或症状的方法，包括向哺乳动物（如人类）施用具有化学式（I）的组蛋白去甲基化酶的治疗有效剂量。

  公开号：

  WO2012052390A1
• 作为产物：
  描述：

  吡啶-2-羧酰胺 在 sodium methylate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 ethyl 3-((6-chloro-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoate
  参考文献：
  名称：

  作为 JMJD3 和 HDAC 双重抑制剂的嘧啶基异羟肟酸衍生物的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  含有 Jumonji 结构域的蛋白去甲基化酶 3 (JMJD3) 和组蛋白去乙酰化酶 (HADC) 与多种癌症相关，被视为药物发现的抗肿瘤靶点。在本研究中，基于合理的药物设计策略，我们设计并合成了一系列含有异羟肟酸的嘧啶衍生物作为新型JMJD3和HDAC双重抑制剂，用于协同癌症治疗。化合物A5b同时表现出对JMJD3和HDAC1/6的抑制效力，并对人类癌细胞例如A549和U937表现出良好的细胞毒性。此外，机制研究表明， A549 细胞中的A5b处理增加了组蛋白 H3K27 的高甲基化和 H3K9 的高乙酰化，抑制了癌细胞的克隆形成、迁移和侵袭。此外，A5b通过裂解 caspase-7 和 PARP 诱导细胞凋亡，并通过上调 p21 表达诱导 G1 细胞周期停滞。所有这些结果表明，A5b是第一个针对 JMJD3 和 HDAC 的双重抑制剂，并且可以成为癌症治疗的潜在化合物。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2023.129466

文献信息

• Structure-Based Engineering of Irreversible Inhibitors against Histone Lysine Demethylase KDM5A
  作者：John R. Horton、Clayton B. Woodcock、Qin Chen、Xu Liu、Xing Zhang、John Shanks、Ganesha Rai、Bryan T. Mott、Daniel J. Jansen、Stephen C. Kales、Mark J. Henderson、Matthew Cyr、Katherine Pohida、Xin Hu、Pranav Shah、Xin Xu、Ajit Jadhav、David J. Maloney、Matthew D. Hall、Anton Simeonov、Haian Fu、Paula M. Vertino、Xiaodong Cheng

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b01219

  日期：2018.12.13

  dioxygenases are exceedingly well preserved, which challenges the design of selective inhibitors. We identified a noncatalytic cysteine (Cys481 in KDM5A) near the active sites of KDM5 histone H3 lysine 4 demethylases, which is absent in other histone demethylase families, that could be explored for interaction with the cysteine-reactive electrophile acrylamide. We synthesized analogs of a thienopyridine-based

  数百种人类α-酮戊二酸（αKG）和Fe（II）依赖的双加氧酶的活性位点保存得非常好，这对选择性抑制剂的设计提出了挑战。我们在KDM5组蛋白H3赖氨酸4脱甲基酶的活性位点附近发现了一种非催化性半胱氨酸（在KDM5A中为Cys481），在其他组蛋白脱甲基酶家族中不存在，可以探索与半胱氨酸反应性亲电丙烯酰胺的相互作用。我们合成了噻吩并吡啶类抑制剂化学型的类似物，即2-（（3-氨基苯基）（2-（哌啶-1-基）乙氧基）甲基）噻吩并[3,2 - b ]吡啶-7-羧酸（N70）和含有（二甲基氨基）丁-2-烯氨基）苯基部分的衍生物（N71），旨在与Cys481形成共价相互作用。我们表征了对KDM5A的抑制和结合活性，并确定了与N70和N71配合的KDM5A催化结构域的共晶体结构。非共价抑制剂N70表现出可以在透析后逆转的αKG竞争性抑制作用，而N71的抑制作用取决于酶的浓度，甚至在透析后仍然存在，与共价修饰一致。
• Immobilization products and methods for the identification of histone demethylase interacting molecules and for the purification of histone demethylase proteins
  申请人：CELLZOME AG

  公开号：EP2592154A1

  公开（公告）日：2013-05-15

  The present invention relates to immobilization products comprising compounds of formula (I) and preparations thereof as well as methods and uses for the identification of histone demethylase interacting compounds or for the purification or identification of histone demethylase proteins.

  本发明涉及包含式(I)化合物的固定化产品及其制备方法，以及用于识别组蛋白去甲基化酶相互作用化合物或用于纯化或鉴定组蛋白去甲基化酶蛋白的方法和用途。
• [EN] N-2-(2-PYRIDINYL)-4-PYRIMIDINYL-BETA-ALANINE DERIVATIVES AS INHIBITORS OF HISTONE DEMETHYLASE JMJD3<br/>[FR] DÉRIVÉS DE N-2-(2-PYRIDINYL)-4-PYRIMIDINYL-BÊTA-ALANINE EN TANT QU'INHIBITEURS D'HISTONE DÉMÉTHYLASE JMJD3
  申请人：GLAXO GROUP LTD

  公开号：WO2012052390A1

  公开（公告）日：2012-04-26

  A method of treating autoimmune diseases or conditions in a mammal, such as a human, which comprises the administration of a therapeutically effective amount of histone demethylase enzymes of formula (I).

  治疗自身免疫疾病或症状的方法，包括向哺乳动物（如人类）施用具有化学式（I）的组蛋白去甲基化酶的治疗有效剂量。
• Design, synthesis and biological evaluation of pyrimidine base hydroxamic acid derivatives as dual JMJD3 and HDAC inhibitors
  作者：Anqi Li、Wenwen Zheng、Boren Xiao、Wenjun Huang、Lulu Li、Minglang Luo、Zijian Liu、Bizhu Chu、Yuyang Jiang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2023.129466

  日期：2023.10

  Jumonji domain-containing protein demethylase 3 (JMJD3) and histone deacetylase (HADC) are related to various cancers and regard as antitumor targets for drug discovery. In this study, based on rational drug design strategy, we designed and synthesized a series of pyrimidine derivatives with hydroxamic acid as novel dual JMJD3 and HDAC inhibitors for synergistic cancer treatment. Compound A5b exhibited

  含有 Jumonji 结构域的蛋白去甲基化酶 3 (JMJD3) 和组蛋白去乙酰化酶 (HADC) 与多种癌症相关，被视为药物发现的抗肿瘤靶点。在本研究中，基于合理的药物设计策略，我们设计并合成了一系列含有异羟肟酸的嘧啶衍生物作为新型JMJD3和HDAC双重抑制剂，用于协同癌症治疗。化合物A5b同时表现出对JMJD3和HDAC1/6的抑制效力，并对人类癌细胞例如A549和U937表现出良好的细胞毒性。此外，机制研究表明， A549 细胞中的A5b处理增加了组蛋白 H3K27 的高甲基化和 H3K9 的高乙酰化，抑制了癌细胞的克隆形成、迁移和侵袭。此外，A5b通过裂解 caspase-7 和 PARP 诱导细胞凋亡，并通过上调 p21 表达诱导 G1 细胞周期停滞。所有这些结果表明，A5b是第一个针对 JMJD3 和 HDAC 的双重抑制剂，并且可以成为癌症治疗的潜在化合物。