N-[1-[(2R,3R,4R,5S)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-formyloxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide | 487059-09-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: N-[1-[(2R,3R,4R,5S)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-formyloxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide
• CAS: 487059-09-6
• 化学式: C₂₃H₄₁N₃O₆Si₂
• 分子量: 511.766
• InChiKey: LWMAILUIYYHAKH-VBSBHUPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.08
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[1-[(2R,3R,4R,5S)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-formyloxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide 在 四丁基氟化铵 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 6.25h， 生成 diethyl [1'-(5'(S)-hydroxy-β-D-ribo-penta-1',4'-furanosyl)-N⁴-acetylcytosyl]-5'-phosphonate
  参考文献：
  名称：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的5'-羟基-5'-膦酸酯衍生物的立体选择性合成。

  摘要：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的（R）-和（S）-5'-羟基5'-膦酸酯衍生物均通过亚磷酸酯加成或路易斯酸介导的适当保护的5'-核苷醛进行氢膦酰化而制得。亚磷酸酯被添加到作为2'，3'-丙酮化物保护的胞嘧啶醛中，主要生成5'R异构体，而亚磷酸酯添加到相应的2'，3'-bis TBS衍生物则有利于5'S立体化学。相反，亚磷酸酯加到由ara-C衍生的2'，3'-双TBS保护的醛中仅得到5'R加合物。但是，相同的ara-C醛的TiCl（4）介导的氢膦酰化作用以2：1的比例有利于5'S立体异构体。一旦所有四个非对映异构体都存在，这些化合物的立体化学可根据其光谱数据或从其O-甲基扁桃酸酯衍生物获得。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了四种α-羟基膦酸作为核苷单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。

  DOI：

  10.1021/jo020483k
• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 吡啶 、 咪唑 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二甲基亚砜 、 甲苯 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 N-[1-[(2R,3R,4R,5S)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-formyloxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的5'-羟基-5'-膦酸酯衍生物的立体选择性合成。

  摘要：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的（R）-和（S）-5'-羟基5'-膦酸酯衍生物均通过亚磷酸酯加成或路易斯酸介导的适当保护的5'-核苷醛进行氢膦酰化而制得。亚磷酸酯被添加到作为2'，3'-丙酮化物保护的胞嘧啶醛中，主要生成5'R异构体，而亚磷酸酯添加到相应的2'，3'-bis TBS衍生物则有利于5'S立体化学。相反，亚磷酸酯加到由ara-C衍生的2'，3'-双TBS保护的醛中仅得到5'R加合物。但是，相同的ara-C醛的TiCl（4）介导的氢膦酰化作用以2：1的比例有利于5'S立体异构体。一旦所有四个非对映异构体都存在，这些化合物的立体化学可根据其光谱数据或从其O-甲基扁桃酸酯衍生物获得。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了四种α-羟基膦酸作为核苷单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。

  DOI：

  10.1021/jo020483k

文献信息

• Synthesis of sulfone-based nucleotide isosteres: identification of CMP-sialic acid synthetase inhibitors
  作者：Jessica H. Wong、Urvashi Sahni、Yanhong Li、Xi Chen、Jacquelyn Gervay-Hague

  DOI：10.1039/b819155g

  日期：——

  A modular replacement approach to the synthesis of sulfo-nucleotide analogs prepared from condensation of nucleoside aldehydes with bis phosphonate Horner-Wadsworth-Emmons reagents is disclosed. These analogs were shown to be inhibitors of Neisseria meningitidis CSS (NmCSS), which is a key enzyme in the biosynthesis of the capsular polysaccharides required for bacterial infection.

  一种模块化替代方法用于合成由核苷醛与双磷酸酯Horner-Wadsworth-Emmons试剂缩合制备的磺酸核苷类似物。研究表明，这些类似物是脑膜炎奈瑟氏菌CSS（NmCSS）的抑制剂，该酶在细菌感染所需的荚膜多糖的生物合成中起关键作用。
• α-Phosphono Lactone Analogues of Cytidine and Cytosine Arabinoside Diphosphates:  Synthesis via Ring Closing Metathesis
  作者：Xuemei Chen、David F. Wiemer

  DOI：10.1021/jo0300136

  日期：2003.8.1

  cytidine aldehydes, and gave some stereoselectivity in additions to an aldehyde derivative of ara-C. The resulting homoallylic alcohols were used as substrates in attempted Knovenagel and Horner-Wadsworth-Emmons condensations, but elimination was found to predominate over lactone formation under the conditions employed. The desired alpha-phosphono lactones could be prepared through a reaction sequence that

  核苷胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的α-膦酸内酯衍生物已由相应的核苷醛制备。发现与这些醛的烯丙基化反应的立体化学结果取决于对2'-和3'-羟基的保护基的选择以及在某种程度上取决于所使用的路易斯酸催化剂的性质。最终，发现条件有利于来自不同胞嘧啶醛的5'R或5'S非对映异构体，并且除了ara-C的醛衍生物之外还提供了一些立体选择性。在尝试的Knovenagel和Horner-Wadsworth-Emmons缩合尝试中，所得的均丙醇被用作底物，但发现在所采用的条件下，消除作用比内酯的形成更为重要。
• Synthesis of 5‘-Amino-5‘-phosphonate Analogues of Pyrimidine Nucleoside Monophosphates
  作者：Xuemei Chen、David F. Wiemer

  DOI：10.1021/jo030050x

  日期：2003.8.1

  diastereoselective, with the cytidine and uridine derivatives favoring the 5'S stereochemistry and the ara-C derivative favoring the 5'R isomer. The stereochemistry of one cytidine derivative was established by single-crystal diffraction analysis, and detailed comparisons of the (13)C NMR data allowed assignments of the other amino phosphonates.

  胞苷，胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）和尿苷的5'-氨基-5'-膦酰基衍生物已通过相应的核苷醛制备。在衍生自核苷醛和对甲氧基苄胺的亚胺中添加亚磷酸酯是有效的，使用该胺可将产物裂解为母体氨基膦酸。亚磷酸酯的添加被证明是非对映选择性的，胞苷和尿苷衍生物有利于5'S立体化学，而ara-C衍生物有利于5'R异构体。通过单晶衍射分析确定了一种胞苷衍生物的立体化学，对（13）C NMR数据进行的详细比较允许对其他氨基膦酸酯进行赋值。