环[2-甲基丙氨酰-L-苯丙氨酰-D-脯氨酰-(alphas,2S)-alpha-氨基-H-氧代-2-环氧乙烷辛酰] | 53342-16-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 环[2-甲基丙氨酰-L-苯丙氨酰-D-脯氨酰-(alphas,2S)-alpha-氨基-H-氧代-2-环氧乙烷辛酰]
• 英文名称: chlamydocin
• 英文别名: (3S,9S,12R)-3-benzyl-6,6-dimethyl-9-[6-[(2S)-oxiran-2-yl]-6-oxohexyl]-1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.3.0]pentadecane-2,5,8,11-tetrone
• CAS: 53342-16-8
• 化学式: C₂₈H₃₈N₄O₆
• 分子量: 526.633
• InChiKey: SGYJGGKDGBXCNY-QXUYBEEESA-N

物化性质

• 沸点：
  861.8±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.27±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO：可溶；乙醇：可溶；甲醇：可溶

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 储存条件：
  存储条件：2-8°C，需密封并保持干燥。

制备方法与用途

生物活性

Chlamydocin 是一种真菌代谢产物，是一种高效的 HDAC 抑制剂，IC50 为 1.3 nM。Chlamydocin 具有很强的抗增殖和抗癌活性，通过激活 caspase-3 诱导细胞凋亡。

靶点
HDAC 1.3 nM (IC50)

体外研究

Chlamydocin 原初从真菌 Diheterospora chlamydosporia 中分离得到。它表现出对多种癌症细胞系的广谱抗增殖活性，不论其 p53 状态如何。这种抗增殖活性伴随着组蛋白 H3 和 H4 的过度乙酰化、p21cip1/waf1 的诱导以及细胞周期 G2/M 期的细胞积累。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  8-Benzyloxy-6(S),7(S)-O-isopropylidene-1-octanal 在 (R,R)-(-)-1,2-bis[(o-methoxyphenyl)(phenyl) phosphino]ethane(1,5-cyclooctadiene)rhodium(I) tetrafluoroborate 、 钯 吡啶 、 二氯乙酸 、 sodium hydroxide 、 1-氯-N,N,2-三甲基丙烯胺 、 potassium tert-butylate 、 氢气 、 草酸 、 potassium carbonate 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 、 乙酸乙酯 为溶剂， -70.0~95.0 ℃ 、300.0 kPa 条件下， 反应 120.5h， 生成 环[2-甲基丙氨酰-L-苯丙氨酰-D-脯氨酰-(alphas,2S)-alpha-氨基-H-氧代-2-环氧乙烷辛酰]
  参考文献：
  名称：

  Schmidt, Ulrich; Lieberknecht, Albrecht; Griesser, Helmut, Angewandte Chemie, 1984, vol. 96, # 4, p. 310 - 311

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Interleukin-2:remodeling and glycoconjugation of interleukin-2
  申请人：DeFrees Shawn

  公开号：US20050031584A1

  公开（公告）日：2005-02-10

  The invention includes methods and compositions for remodeling a peptide molecule, including the addition or deletion of one or more glycosyl groups to a peptide, and/or the addition of a modifying group to a peptide.

  该发明包括重塑肽分子的方法和组合物，包括向肽分子中添加或删除一个或多个糖基团，和/或向肽分子中添加修饰基团。
• Stereospecific synthesis of chlamydocin
  作者：Jack E. Baldwin、Robert M. Adlington、Christopher R.A. Godfrey、Vipulkumar K. Patel

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)88010-8

  日期：1993.9

  A stereospecific synthesis of the cyclic tetrapeptide chlamydocin via free radical homologation from a (S)-2-amino-5-iodopentanoic acid containing cyclic tetrapeptide is described.

  描述了通过自由基同源性从含环状四肽的（S）-2-氨基-5-碘戊酸的同系物立体合成环状四肽衣原蛋白。
• Synthesis of Chlamydocin by Chelate-Claisen Rearrangement
  作者：Christian Quirin、Uli Kazmaier

  DOI：10.1002/ejoc.200800890

  日期：2009.1

  Chelate-Claisen rearrangement of a chiral allylic ester allows the synthesis of the unusual epoxyketo amino acid Aoe found in chlamydocin, one representative of a group of peptide-based HDAc inhibitors. (© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)

  手性烯丙基酯的螯合-克莱森重排允许合成在衣藻菌素中发现的不寻常的环氧酮氨基酸 Aoe，衣藻菌素是一组基于肽的 HDAc 抑制剂的代表。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)
• Divergent Access to Histone Deacetylase Inhibitory Cyclopeptides via a Late-Stage Cyclopropane Ring Cleavage Strategy. Short Synthesis of Chlamydocin
  作者：Gábor Zoltán Elek、Kaur Koppel、Dzmitry M. Zubrytski、Nele Konrad、Ivar Järving、Margus Lopp、Dzmitry G. Kananovich

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b03305

  日期：2019.10.18

  The efficacy of the proposed diversity-oriented approach has been validated by short stereoselective synthesis of natural product chlamydocin, containing a challenging-to-install fragment of (2S,9S)-2-amino-8-oxo-9,10-epoxydecanoic acid (Aoe) and a range of its analogues, derivatives of 2-amino-8-oxodecanoic and 2-aminosuberic acids.

  基于通过在通用的多能环丙醇前体中裂解环丙烷环的裂解来安装多个锌结合功能的后期安装，提出了一种访问组蛋白脱乙酰基酶抑制肽的统一的步骤经济策略。通过短立体选择性合成天然产物衣藻多菌素，证实了所提出的面向多样性的方法的功效，该产物含有（2 S，9 S）-2-氨基-8-氧代-9,10-的具有挑战性的安装片段环氧癸酸（Aoe）及其一系列类似物，2-氨基-8-氧十二烷酸和2-氨基丁二酸的衍生物。
• Amino Acids and Peptides; 55¹. Synthesis of Biologically Active Cyclopeptides; 7¹. Total Synthesis of Chlamydocin
  作者：Ulrich Schmidt、Albrecht Lieberknecht、Helmut Griesser、Roland Utz、Thomas Beuttler、Frank Bartkowiak

  DOI：10.1055/s-1986-31636

  日期：——

  Methods for the synthesis of cyclopeptides containing non-essential amino acids are described. The total synthesis of the highly cancerostatic Chiamydocin is published.

  描述了包含非必需氨基酸的环肽合成方法。高度抗癌的Chiamydocin的全合成已经发表。