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5'-amino-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylideneuridine | 68691-77-0

中文名称
——
中文别名
——
英文名称
5'-amino-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylideneuridine
英文别名
1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(aminomethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]pyrimidine-2,4-dione
5'-amino-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylideneuridine化学式
CAS
68691-77-0
化学式
C12H17N3O5
mdl
——
分子量
283.284
InChiKey
YVSGXMATHIIWAN-PEBGCTIMSA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
  • 计算性质
  • ADMET
  • 安全信息
  • SDS
  • 制备方法与用途
  • 上下游信息
  • 反应信息
  • 文献信息
  • 表征谱图
  • 同类化合物
  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    -1.5
  • 重原子数:
    20
  • 可旋转键数:
    2
  • 环数:
    3.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    0.67
  • 拓扑面积:
    103
  • 氢给体数:
    2
  • 氢受体数:
    6

上下游信息

  • 上游原料
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
  • 下游产品
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
    • 1
    • 2

反应信息

  • 作为反应物:
    描述:
    5'-amino-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylideneuridine盐酸 作用下, 以 吡啶乙醇 为溶剂, 反应 2.0h, 生成 5'-benzamido-5'-deoxyuridine
    参考文献:
    名称:
    Skaric, Vinko; Katalenic, Darinka; Skaric, Djurdjica, Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1982, # 9, p. 2091 - 2098
    摘要:
    DOI:
  • 作为产物:
    描述:
    尿嘧啶核苷吡啶 、 sodium azide 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气对甲苯磺酸 作用下, 以 甲醇N,N-二甲基甲酰胺丙酮 为溶剂, 反应 97.0h, 生成 5'-amino-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylideneuridine
    参考文献:
    名称:
    带有焦磷酸生物电子等排体的新型双底物尿苷肽类似物作为人 O-GlcNAc 转移酶的抑制剂
    摘要:
    蛋白质O连接的 β-D- N-乙酰葡糖胺( O- GlcNAc) 修饰 ( O- GlcNAcylation) 是一种必不可少的翻译后和共翻译修饰,是 β-D- N-乙酰氨基葡萄糖与丝氨酸和苏氨酸残基的连接核质蛋白。某些蛋白质的异常O- GlcNAc 谱与代谢疾病如糖尿病和癌症有关。O- GlcNAc 转移酶 (OGT)抑制剂是研究蛋白O细胞生物学的重要工具-GlcNAc 修饰。在这项研究中,我们报告了新型尿苷肽缀合物分子,该分子由受体肽共价连接到催化失活的供体底物类似物上,该类似物带有焦磷酸盐生物等排体,并通过放射性 hOGT 测定探索它们对 OGT 的抑制活性。此外,我们通过分子建模研究了它们活动的结构基础,解释了它们对 OGT 抑制的缺乏效力。
    DOI:
    10.1016/j.bioorg.2021.104738
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文献信息

  • Parallel Solution-Phase Synthesis and General Biological Activity of a Uridine Antibiotic Analog Library
    作者:Omar Moukha-chafiq、Robert C. Reynolds
    DOI:10.1021/co4001452
    日期:2014.5.12
    coupling of the amino terminus of d-phenylalanine methyl ester to the free 5′-carboxylic acid moiety of 33 followed by sodium hydroxide treatment led to carboxylic acid analog 77. Hydrolysis of this material gave analog 78. The intermediate 77 served as the precursor for the preparation of novel dipeptidyl uridine analogs 79–99 through peptide coupling reactions to diverse amine reactants. None of the described
    在 NIH 路线图计划的中试规模库 (PSL) 计划下,以溶液相方式从胺2和羧酸33和77合成了一个包含 94 种尿苷抗生素类似物的小型库。多样醛,磺酰氯,和羧酸反应物套缩合,2,酸介导的解导致后,向目标化合物3 - 32以良好的收率和高的纯度。同样,用不同的胺和磺胺处理33得到34 – 75。d基末端的偶联-酸甲到33的游离 5'-羧酸部分,然后用氢氧化钠处理产生羧酸类似物77。该材料的解得到类似物78。中间77担任该前体为二肽基新颖尿苷类似物的制备79 - 99通过肽偶联到不同的胺反应剂反应。所描述的化合物均未显示出显着的抗癌或抗疟活性。通过 NIH MLPCN 计划提供和报告的初级筛选中的酶和受体,许多样品表现出各种有希望的抑制性、激动剂、拮抗剂或激活剂特性。
  • Tightly linked morpholino-nucleoside chimeras: new, compact cationic oligonucleotide analogues
    作者:Nóra Debreczeni、Miklós Bege、Mihály Herczeg、Ilona Bereczki、Gyula Batta、Pál Herczegh、Anikó Borbás
    DOI:10.1039/d1ob01174j
    日期:——
    cellular uptake and is therefore a major obstacle to the biological application of native oligonucleotides. Backbone modifications, particularly charge alterations is a proven strategy to provide artificial oligonucleotides with improved properties. Here, we describe the synthesis of a new type of oligonucleotide analogues consisting of a morpholino and a ribo- or deoxyribonucleoside in which the 5′-amino
    核酸的聚阴离子磷酸主链导致高核酸酶敏感性和低细胞摄取,因此是天然核苷酸生物应用的主要障碍。主链修饰,特别是电荷改变是一种经过验证的策略,可以提供具有改进特性的人工寡核苷酸。在这里,我们描述了由吗啉代和核糖核糖核苷组成的新型寡核苷酸类似物的合成,其中核苷单元的5'-基提供吗啉环的。该合成方案与三甲基和二甲基三甲基保护基团和叠氮基官能团兼容,并扩展到高级低聚物的合成。由于吗啉单元的N-烷基化叔胺结构,嵌合体在介质中带正电荷。
  • Simplified Novel Muraymycin Analogues; using a Serine Template Strategy for Linking Key Pharmacophores
    作者:Bhautikkumar Patel、Rachel V Kerr、Alpeshkumar K Malde、Matthew Zunk、Timothy D. H. Bugg、Gary Grant、Santosh Rudrawar
    DOI:10.1002/cmdc.202000033
    日期:2020.8.5
    of naturally occurring MraY inhibitors. Despite having potent antibiotic properties, the structural complexity of muraymycins advocates for simplified analogues as potential lead structures. Herein, we report a systematic structure‐activity relationship (SAR) study of serine template‐linked, simplified muraymycin‐type analogues. This preliminary SAR lead study of serine template analogues successfully
    抗生素研究的现状要求紧急发明可对多种药物具有耐药性的细菌起作用的新型药物。根据对新抗生素的紧迫性,世界卫生组织已将抗药性细菌分为关键,高和中优先级。天然存在的尿苷衍生的“核苷抗生素”通过抑制跨膜蛋白MraY(转座酶I)显示出对许多优先耐药生物的有希望的活性,这在临床上尚待探索。MraY的催化活性是细菌细胞活力和生长的重要过程,包括优先生物的活力。莫来霉素是天然存在的MraY抑制剂的一类。尽管具有强大的抗生素特性,穆雷霉素的结构复杂性提倡将简化的类似物作为潜在的先导结构。在本文中,我们报告了丝氨酸模板连接的简化穆来霉素型类似物的系统结构-活性关系(SAR)研究。这项关于丝氨酸模板类似物的SAR初步研究成功地揭示出,天然存在的穆雷霉素的复杂结构可以轻松简化,以提供抗药性强的优先抗性生物生物活性支架。这项研究将为基于简化的丝氨酸模板的新型抗菌先导化合物的开发铺平道路。这项关于丝氨酸模板类似物的
  • Evaluation of BBB permeable nucleolipid (NLDPU): A di-C15-ketalised palmitone appended uridine as neuro-tracer for SPECT
    作者:Swastika、Shubhra Chaturvedi、Ankur Kaul、Puja Panwar Hazari、Preeti Jha、Sunil Pal、Sangeeta Lal、B. Singh、Philippe Barthélémy、Anil K. Mishra
    DOI:10.1016/j.ijpharm.2019.04.074
    日期:2019.6
    cross intact BBB and evaluate as metal based neuro-imaging SPECT agent. Uridine based non-lipidic (NSDAU) and di-C15-ketal appended lipidic (NLDPU) ligands were conjugated to chelator, DTPA (DTPA-NSDAU and DTPA-NLDPU) using multi-step chemistry. The ligands were evaluated in parallel for comparative physical and biological parameters. Additionally, effects of enhanced lipophilicity on UV-absorption, acid
    尽管多年来一直在进行肿瘤诊断常规检查,但由于核苷分子成像探针跨血脑屏障(BBB)的低渗透性,因此其在神经系统应用中的应用受到了严重限制。为了扩大用于神经肿瘤早期诊断的核苷示踪剂的实用性,需要进行适当的修饰以增强其BBB的渗透性。在各种修饰中,据报道核苷的脂化可增强细胞通透性。扩展该概念,目的是举例说明脂化核苷作为潜在的脑示踪剂的可能性,该能力具有穿越完整BBB并评估为基于属的神经成像SPECT剂的能力。将基于尿苷的非脂质(NSDAU)和附加双C15-缩酮的脂质(NLDPU)配体螯合剂偶联,DTPADTPA-NSDAU和DTPA-NLDPU)使用多步化学法。平行评估配体的比较物理和生物学参数。另外,评估了亲脂性增强对紫外线吸收,酸强度,荧光和非特异性蛋白结合的影响。BSA的荧光淬灭表明DTPA-NLDPU与蛋白质的相互作用仅在10 mM以上,而不会引起构象变化。另外,发现DTPA-NL
  • A Modular Approach to Phosphoglycosyltransferase Inhibitors Inspired by Nucleoside Antibiotics
    作者:Marthe T. C. Walvoort、Vinita Lukose、Barbara Imperiali
    DOI:10.1002/chem.201503986
    日期:2016.3.7
    Phosphoglycosyltransferases (PGTs) represent “gatekeeper” enzymes in complex glycan assembly pathways by catalyzing transfer of a phosphosugar from an activated nucleotide diphosphosugar to a membrane‐resident polyprenol phosphate. The unique structures of selected nucleoside antibiotics, such as tunicamycin and mureidomycin A, which are known to inhibit comparable biochemical transformations, are
    磷酸糖基转移酶(PGT)通过催化磷酸糖从活化的核苷酸磷酸糖向膜驻留的聚戊二烯磷酸的转移,代表复杂糖组装途径中的“关守”酶。选定的核苷抗生素(如衣霉素和莫来霉素A)的独特结构被公认为可抑制类似的生化转化,它们被用作开发PGTs模块化合成抑制剂基础。本文中,我们介绍了两种易于操作的模块化支架作为单位细菌PGTs抑制剂的设计,合成和生化评估。所选化合物的IC 50值低至40μm 范围广泛,因此可作为未来开发具有生物学和医学意义的各种PGT的选择性和有效抑制剂的主要化合物。
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