丙炔基-六聚乙二醇 | 944560-99-0

• 物质功能分类: 化学试剂 - 有机试剂 - 炔烃
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 丙炔基-六聚乙二醇
• 英文名称: 3,6,9,12,15,18-hexaoxahenicos-20-yn-1-ol
• 英文别名: Propargyl-PEG7-alcohol；2-[2-[2-[2-[2-(2-prop-2-ynoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanol
• CAS: 944560-99-0
• 化学式: C₁₅H₂₈O₇
• 分子量: 320.383
• InChiKey: USWWECGLRVWCRJ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  408.8±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.083±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于水、DMSO、DCM、DMF

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.87
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险性防范说明：
  P264,P280,P302+P352,P337+P313,P305+P351+P338,P362+P364,P332+P313
• 危险性描述：
  H315,H319
• 储存条件：
  2-8°C，干燥

制备方法与用途

propargyl-PEG6-alcohol 是一种PROTAC连接桥，属于PEG类。propargyl-PEG6-OH 可用于合成一系列PROTAC分子。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  丙炔基-六聚乙二醇 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 乙酰硫酯-六聚乙二醇-炔
  参考文献：
  名称：

  Efficient synthesis of diverse heterobifunctionalized clickable oligo(ethylene glycol) linkers: potential applications in bioconjugation and targeted drug delivery

  摘要：

  在此，我们描述了一系列适用于叠氮-炔烃点击化学的异双功能寡（乙烯）醇（OEG）连接子 sequential synthesis，用于生物偶联化学应用。这些生物正交连接子的合成是通过将OEG中的一个羟基转化为炔烃或叠氮功能团，进而进行去对称化来完成的。OEG上的远端羟基则通过4-硝基苯基碳酸酯或美克酸酯（–OMs）基团进行活化。–OMs功能团作为一种有用的前驱体，用于形成包含不同高度反应性末端基团的多种异双功能化OEG连接子，例如：碘、–NH2、–SH和马来酰亚胺，这些基团与炔烃或叠氮功能团具有正交性。此外，炔烃和叠氮末端的OEG可通过采用Cu(I)催化的1,3-偶极环加成点击反应生成更大的离散聚（乙烯）醇（PEG）连接子（例如，PEG16和PEG24）。通过将整合素（αvβ3）受体靶向肽环（Arg-Gly-Asp-D-Phe-Lys）（cRGfKD）和荧光探针硫酸铑胺B附着于这些可点击的异双功能OEG中，证明了它们在生物偶联化学中的实用性。本文所呈现的合成方法适合于从易得且廉价的起始材料大规模生产多种新型异双功能化OEG。

  DOI：

  10.1039/c2ob26968f
• 作为产物：
  描述：

  六甘醇 、 3-溴丙炔 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 18.0h， 以31%的产率得到丙炔基-六聚乙二醇
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Polyanionic C5-Modified 2′-Deoxyuridine and 2′-Deoxycytidine-5′-Triphosphates and Their Properties as Substrates for DNA Polymerases

  摘要：

  修改后的2'-脱氧核苷酸三磷酸盐（dNTPs）在现有和新兴的生物分子技术中具有广泛的应用。对于这些应用，修改后的dNTPs能够作为DNA聚合酶的底物是一个基本要求。迄今为止，尽管这些核苷酸可能在使用基于硅纳米线检测系统的诊断应用中具有潜在价值，但很少有负电荷官能团的C5-修饰dNTPs的例子被描述。在这里，我们合成了带有二阴离子报告基团的C5-修饰的dUTP和dCTP核苷酸，每个核苷酸都通过基于聚乙二醇（PEG）的链接物与核碱基标记。研究了这些修改后的dNTPs与各种DNA聚合酶的底物特性，以研究改变PEG连接物长度和连接模式对核碱基的影响。一般来说，含有通过酰胺而不是醚键连接到核碱基的PEG连接物的核苷酸被证明是最好的底物，而含有从PEG6到PEG24的PEG连接物的核苷酸都可以被一个或多个DNA聚合酶所合并。最能够合并这些修改后的核苷酸的聚合酶包括Klentaq、Vent（exo-）和therminator，而Klenow（exo-）的合并通常非常差。

  DOI：

  10.3390/molecules26082250

文献信息

• Synthesis and Anticancer Activity of Glucosylated Podophyllotoxin Derivatives Linked via 4β-Triazole Rings
  作者：Cheng-Ting Zi、Feng-Qing Xu、Gen-Tao Li、Yan Li、Zhong-Tao Ding、Jun Zhou、Zi-Hua Jiang、Jiang-Miao Hu

  DOI：10.3390/molecules181113992

  日期：——

  A series of 4β-triazole-linked glucose podophyllotoxin conjugates have been designed and synthesized by employing a click chemistry approach. All the compounds were evaluated for their anticancer activity against a panel of five human cancer cell lines (HL-60, SMMC-7721, A-549, MCF-7, SW480) using MTT assays. Most of these triazole derivatives have good anticancer activity. Among them, compound 35 showed the highest potency against all five cancer cell lines tested, with IC50 values ranging from 0.59 to 2.90 μM, which is significantly more active than the drug etoposide currently in clinical use. Structure-activity relationship analysis reveals that the acyl substitution on the glucose residue, the length of oligoethylene glycol linker, and the 4'-demethylation of podophyllotoxin scaffold can significantly affect the potency of the anticancer activity. Most notably, derivatives with a perbutyrylated glucose residue show much higher activity than their counterparts with either a free glucose or a peracetylated glucose residue.

  通过点击化学方法，设计并合成了系列4β-三氮唑连接的葡萄糖鬼臼毒素缀合物。所有化合物均通过MTT法对其在五种人癌细胞系（HL-60，SMMC-7721，A-549，MCF-7，SW480）中的抗癌活性进行了评估。这些三氮唑衍生物大多具有良好的抗癌活性。其中，化合物35对所有五种癌细胞系的活性最高，IC50值在0.59至2.90 μM之间，其活性显著高于临床使用的药物依托泊苷。结构-活性关系分析显示，葡萄糖残基上的酰基取代、聚乙烯 glycol 链的长度以及鬼臼毒素骨架的4'-脱甲基化对抗癌活性的强度有显著影响。特别值得注意的是，具有完全丁酰化的葡萄糖残基的衍生物比具有游离葡萄糖或完全乙酰化葡萄糖残基的对照组活性高得多。
• Elucidation of Distinct Modular Assemblies of Smoothened Receptor by Bitopic Ligand Measurement
  作者：Fei Zhao、Yiran Wu、Fang Zhou、Dongxiang Xue、Simeng Zhao、Wanglong Lu、Xiaoyan Liu、Tao Hu、Yanli Qiu、Rongyan Li、Tangjie Gu、Yueming Xu、Fei Xu、Guisheng Zhong、Zhongxing Jiang、Suwen Zhao、Houchao Tao

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01220

  日期：2021.9.23

  between the active status and receptor assembly. Different activity dependency on the linker length for these bitopic ligands corroborates the various occurrences of SMO assembly. These results reveal a rigid “near” assembly for active SMO, which is in contrast to previous results. Conversely, inactive SMO adopts a free ECD, which would be remotely captured at “far” assembly by cholesterol. Altogether

  FG 类蛋白偶联受体的特征在于除了具有七个 α 螺旋的共同跨膜结构域 (TMD) 外还有一个大的细胞外结构域 (ECD)。对于平滑受体 (SMO)，结构研究揭示了解剖的 ECD 和 TMD，以及它们的集成组件。但是，在不同情况下报告了不同的程序集。使用基于四个系列交叉共轭双位配体的无偏方法，我们探索了活性状态和受体组装之间的关系。这些双位配体对接头长度的不同活性依赖性证实了 SMO 组装的各种发生。这些结果揭示了主动 SMO 的刚性“近”组件，这与之前的结果相反。相反，不活动的 SMO 采用免费的 ECD，这将在“远”组装时被胆固醇远程捕获。总而言之，我们提出了一种胆固醇流动引起的 SMO 激活机制，涉及从远到近的组装 ECD 的勃起。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS RELATED TO MOLECULAR CONJUGATION<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS À LA CONJUGAISON MOLÉCULAIRE
  申请人：INTOCELL INC

  公开号：WO2021111185A1

  公开（公告）日：2021-06-10

  The invention relates to activated Michael acceptor (AMA) compounds that can undergo conjugation with biomolecules containing Michael donor moieties, thereby providing plasma-stable antibody-drug conjugates (ADCs). Pharmaceutical compositions of the ADCs are disclosed as well. Also provided herein are a number of applications (e.g., therapeutic applications) in which the compositions are useful.

  这项发明涉及可以与含有Michael供体基团的生物分子发生共轭反应的活化Michael受体（AMA）化合物，从而提供稳定的血浆抗体药物偶联物（ADCs）。还公开了ADCs的药物组合物。本文还提供了一些应用（例如治疗应用），其中这些组合物是有用的。
• METHODS AND COMPOSITIONS FOR PROTEIN LABELLING
  申请人：Gill Herman

  公开号：US20100221176A1

  公开（公告）日：2010-09-02

  A modular platform is provided for rapid preparation of various water-soluble prosthetic groups capable to efficiently introduce 18 F into proteins with 18 F labelling reagents.

  提供了一个模块化平台，用于快速准备各种水溶性假体基团，能够有效地将 18 F引入蛋白质中，使用 18 F标记试剂。
• Selective Inhibition of<i>Escherichia coli</i>RNA and DNA Topoisomerase I by Hoechst 33258 Derived Mono- and Bisbenzimidazoles
  作者：Nihar Ranjan、Sandra Story、Geraldine Fulcrand、Fenfei Leng、Muzammil Ahmad、Ada King、Souvik Sur、Weidong Wang、Yuk-Ching Tse-Dinh、Dev P. Arya

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b00191

  日期：2017.6.22

  Escherichia coli DNA topoisomerase I inhibition, binding to B-DNA duplex, and antibacterial activity has been evaluated. Bisbenzimidazoles with alkynyl side chains display excellent E. coli DNA topoisomerase I inhibition properties with IC50 values <5.0 μM. Several bisbenzimidazoles (3, 6, 7, 8) also inhibit RNA topoisomerase activity of E. coli DNA topoisomerase I. Bisbenzimidazoles inhibit bacterial growth

  已经合成了一系列基于Hoechst 33258的单和双苯并咪唑类化合物，并评估了它们对大肠杆菌DNA拓扑异构酶I的抑制作用，与​​B-DNA双链体的结合以及抗菌活性。具有炔基侧链的双苯并咪唑类化合物具有出色的大肠杆菌DNA拓扑异构酶I抑制特性，IC 50值<5.0μM。几个bisbenzimidazoles（3，6，7，8）也抑制拓扑异构酶的RNA的活性的大肠杆菌DNA拓扑异构酶I.对于革兰氏阳性菌株，双苯并咪唑类抑制细菌生长的效果比单苯并咪唑类更好。革兰氏阳性菌（肠球菌和葡萄球菌，包括两个MRSA菌株0.3–8μg/ mL）的最低抑菌浓度（MIC）比大多数革兰氏阴性菌（铜绿假单胞菌，16–32μg）低/ mL，肺炎克雷伯菌> 32μg/ mL）。Bisbenzimidazoles具有稳定的B-DNA双链体（1.2−23.4°C），细胞毒性研究表明，类似的变化取决于侧链长度。建模研究表明，