Fmoc-O-苄基-L-丝氨酸 | 73724-46-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 丝氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: Fmoc-O-苄基-L-丝氨酸
• 英文名称: N-(9-fluorenylmethyloxycarbonyl)-L-serine benzyl ester
• 英文别名: Fmoc-Ser-OBn；N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-serine benzyl ester；N-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-L-serine benzyl ester；N-Fmoc-L-serine benzyl ester；(S)-Benzyl 2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-hydroxypropanoate；benzyl (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-hydroxypropanoate
• CAS: 73724-46-6
• 化学式: C₂₅H₂₃NO₅
• 分子量: 417.461
• InChiKey: GXJVEJVEJKIXCH-QHCPKHFHSA-N

物化性质

• 熔点：
  98-100℃
• 沸点：
  656.2±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.279±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  84.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 安全说明：
  S22,S24/25
• WGK Germany：
  3
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  | 2-8°C |

制备方法与用途

Fmoc-Ser-OBzl是一种丝氨酸衍生物[1]。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-O-苄基-L-丝氨酸 在 二(三苯基膦)环戊二烯基氯化钌(II) 、 hydrogen azide 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 (S)-benzyl 2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(5-(diethoxyphosphoryl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  Stable triazolylphosphonate analogues of phosphohistidine

  摘要：

  Histidine-phosphorylated proteins and the corresponding kinases are important components of bacterial and eukaryotic cell-signalling pathways, and are therefore potential drug targets. The study of these biomolecules has been hampered by the lability of the phosphoramidate functional group in the phosphohistidines and the lack of generic antibodies. Herein, the design and concise synthesis of stable triazolylphosphonate analogues of N1- and N3-phosphohistidine, and derivatives suitable for bioconjugation, are described.

  DOI：

  10.1007/s00726-011-1145-2
• 作为产物：
  描述：

  9-芴甲基-N-琥珀酰亚胺基碳酸酯 在 sodium carbonate 、 caesium carbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 0.25h， 生成 Fmoc-O-苄基-L-丝氨酸
  参考文献：
  名称：

  Influence of steric parameters on the synthesis of tetramates from α-amino-β-alkoxy-esters and Ph3PCCO

  摘要：

  alpha-Aminoesters react with Ph3PCCO in a domino addition-Wittig cyclization sequence affording enantiomerically pure tetramates. In the case of beta-oxo functionalized alpha-aminoesters, e.g., esters of serine, threonine or beta-hydroxyornithine the yields of this reaction depend heavily on the bulkiness of the beta-OR group and on the configuration of beta-carbon atom C-3. Smaller residues and 2R/3R-configured aminoesters give better yields. The alkoxycarbonyl group of the ester moiety and the residue on the N-atom are less important. These findings can be accounted for by assuming an early puckered transition state for the intramolecular ring-closing Wittig reaction. The addition of sub-stoichiometric amounts of benzoic acid or N-hydroxysuccinimide (for acid-sensitive compounds) is advantageous in some cases as it accelerates the formation of the intermediate amide ylides. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2011.10.099

文献信息

• Chemical Synthesis of a Heparan Sulfate Glycopeptide: Syndecan-1
  作者：Bo Yang、Keisuke Yoshida、Zhaojun Yin、Hang Dai、Herbert Kavunja、Mohammad H. El-Dakdouki、Suttipun Sungsuwan、Steven B. Dulaney、Xuefei Huang

  DOI：10.1002/anie.201205601

  日期：2012.10.1

  assembled. The protective groups utilized, as well as the sequences for formation of the glycosyl linkages and protecting group removal are critical to the success of the synthesis. This first preparation of a heparan sulfate glycopeptide lays the foundation for accessing other members of this class of molecules.

  首先完成：组装了标题化合物的高度复杂结构（见图）。所使用的保护基团以及用于形成糖基连接和保护基团去除的序列对于合成的成功至关重要。硫酸乙酰肝素糖肽的首次制备为获得此类分子的其他成员奠定了基础。
• Stable Benzylic (1-Ethynylcyclohexanyl)carbonates Protect Hydroxyl Moieties by the Synergistic Action of [Au]/[Ag] Catalytic System
  作者：Saptashwa Chakraborty、Bijoyananda Mishra、Mahesh Neralkar、Srinivas Hotha

  DOI：10.1021/acs.joc.9b00016

  日期：2019.6.7

  subjected to the benzylation successfully using a catalytic amount of gold phosphite and silver triflate. Furthermore, the protocol is suitable for even protecting menthol, cholesterol, serine, disaccharide OH, and furanosyl-derived alcohol easily. The often-utilized olefins and benzoates, as well as benzylidene-, silyl-, Troc-, and Fmoc-protecting groups do not get affected during the newly identified

  寡糖和糖苷的化学合成要求利用许多保护基团，这些保护基团可以安装或脱保护，而不会影响存在的其他官能团。苄醚通常用于聚糖的合成，因为它们可以在中性条件下进行氢解。但是，苄基醚的安装通常是在强碱性条件下使用苄基卤化物进行的。很多时候，强碱性条件会对某些其他敏感功能（例如酯）有害。后来引入的试剂，例如三氯乙亚氨酸苄基酯和BnOTf都不易保存，因此，非常需要一种新方法。从[Au] / [Ag]催化的糖苷反应中得到提示，我们确定了一种方法，该方法能够保护羟基为苄基，p-甲氧基苄基或萘甲基甲醚，使用容易获得且稳定的碳酸盐试剂。使用催化量的亚磷酸金和三氟甲磺酸银成功地对许多糖类衍生的醇进行了苄基化反应。此外，该协议适用于轻松保护薄荷醇，胆固醇，丝氨酸，二糖OH和呋喃糖基衍生的醇。在新确定的方案中，经常使用的烯烃和苯甲酸酯以及亚苄基，甲硅烷基，Troc和Fmoc保护基不会受到影响。证明了区域选择性保护和一锅安装的苄基和对甲氧基苄基醚。
• New Approach for the Efficient Synthesis of Carbamate-Tethered Glycosylated Amino Acids and Their Insertion into Peptides
  作者：Vommina Sureshbabu、H. Hemantha

  DOI：10.1055/s-2008-1032087

  日期：——

  An efficient two-step route for the synthesis of carba­mate-tethered glycosylated amino acids by coupling of oxycarbonyl chlorides derived from side-chain hydroxyl group of N α-Fmoc-Ser, Thr, Tyr and homoserine (Hser) with appropriately protected sugar-1-amine has been described. The utility of these neoglycoamino acids as building blocks for the synthesis of neoglycopeptides possessing the carbamate moiety has been demonstrated.

  高效的两步路线用于合成由羧酸氯化物（来源于 N α -Fmoc-Ser、Thr、Tyr 和同丝氨酸 Hser 的侧链羟基）与适保护的糖胺1偶联制备的碳酸酰胺键连接的糖基化氨基酸。这些新糖基氨基酸作为合成具有碳酸酰胺基团的新糖肽的构建模块的实用性已得到证明。
• Synthese eines xylose-haltigen glycopeptides, das die aminosäure-sequenz 4 bis 7 des NH2-terminus der protein-core-struktur des rinderhaut-proteodermatan-sulfats enthält
  作者：Hari G. Garg、Thomas Hasenkamp、Hans Paulsen

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)90343-4

  日期：1986.8

  Abstract The synthesis is described of α-β- d -xylopyranosyl- l -serylglycyl- l -isoleucylglycine (7), a glycopeptide containing the amino acid sequence of the protein core-structure of beef-skin proteodermatan sulfate; coupling of N-protected O-XylpSer with protected GlyIleuGly followed by deprotection afforded 7.

  摘要描述了α-β-d-吡喃并吡喃糖基-1-丝氨酰甘氨酰-1-异亮氨酰甘氨酸（7）的合成方法，该肽是一种含有牛肉皮肤硫酸皮肤素蛋白的蛋白质核心结构氨基酸序列的糖肽。N-保护的O-XylpSer与受保护的GlyIleuGly偶联，然后脱保护得到7。
• Glycosylation of α-amino acids by sugar acetate donors with InBr3. Minimally competent Lewis acids
  作者：Mark R. Lefever、Lajos Z. Szabò、Bobbi Anglin、Michael Ferracane、Joanna Hogan、Lauren Cooney、Robin Polt

  DOI：10.1016/j.carres.2012.01.008

  日期：2012.4

  glycoside formation, but also promote undesired reactions of the glycoside products. Use of 'minimally competent' Lewis acids such as InBr(3) promotes the desired activation catalytically, and with greatly reduced side products from sugar peracetates.

  描述了一种用于制备用于 O 联糖肽合成的 Fmoc-丝氨酸和 Fmoc-苏氨酸糖苷的简化方法。路易斯酸促进糖苷形成，但也促进糖苷产物的不希望的反应。使用“最低限度的”路易斯酸（如 InBr(3)）可促进所需的活化催化，并大大减少过乙酸糖的副产物。