4β-hydroxygermacra-1(10)-5-diene

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: 4β-hydroxygermacra-1(10)-5-diene
• 英文别名: (-)-germacradien-4-ol；germacra-1(10),5-dien-4β-ol；germacradiene-4-ol；(1S,4S)-1,7-dimethyl-4-propan-2-ylcyclodeca-2,7-dien-1-ol
• 化学式: C₁₅H₂₆O
• 分子量: 222.371
• InChiKey: RHCTXHCNRLCYBN-CABCVRRESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  20.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4β-hydroxygermacra-1(10)-5-diene 在 N-氯代丁二酰亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以36 %的产率得到
  参考文献：
  名称：

  仿生阳离子环丙烷化可高效化学酶合成 6,8-Cycloeudesmanes

  摘要：

  阳离子环丙烷化涉及碳阳离子处的 γ- 消除，通过质子损失形成新的 σ-C-C 键。虽然在本体溶液中极为罕见，但它被认为是主要的生物合成环丙烷化途径之一。尽管受生物启发的合成化学有着丰富的历史，但阳离子环丙烷化反应尚未被用于合成工具箱，这可能是由于碳阳离子倾向于进行竞争性 E1 β-消除途径。在这里，我们提出了阳离子环丙烷化的深入合成和计算研究，重点关注 6,8-环丙烷作为本研究的平台。我们能够将仿生阳离子环丙烷化作用应用于几种 6,8-环丙烷和非天然类似物的合成──在这样做的过程中，

  DOI：

  10.1021/jacs.2c13116
• 作为产物：
  描述：

  法尼基二磷酸-三铵盐 在 germacradiene-4-ol synthase-wild type 、 magnesium 作用下， 生成 4β-hydroxygermacra-1(10)-5-diene
  参考文献：
  名称：

  Germacradien-4-ol 合成酶控制的水捕获机制

  摘要：

  来自Streptomyces citricolor的倍半萜合酶 Germacradiene-4-ol 合酶 (GdolS)是少数已知的将法呢基二磷酸 (FDP) 转化为单一羟基化产物的高保真萜烯合酶之一。未配体的 GdolS-E248A 晶体衍射到 1.50 Å，显示出典型的 1 类倍半萜烯合酶折叠，其活性位点处于开放构象。金属结合基序被鉴定为 D 80 DQFD 和 N 218 DVRSFAQE。一些结合水分子在 X 射线晶体结构中很明显，但没有一个明显定位于淬灭推定的最终碳正离子中间体。H 2 18孵化O 生成标记产物，证实醇官能团是由来自溶液的水对最终碳正离子的亲核捕获产生的。来自金属结合基序内的氨基酸残基的定点诱变，而不是通过与来自土曲霉的马兜铃烯合酶的序列比对鉴定，产生的主要是功能性 Germacradien-4-ol 合酶。只有 GdolS-N218Q 产生了完全不同的产物（~50%

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.6b00115

文献信息

• Mechanism of Germacradien-4-ol Synthase-Controlled Water Capture
  作者：Daniel J. Grundy、Mengbin Chen、Verónica González、Stefano Leoni、David J. Miller、David W. Christianson、Rudolf K. Allemann

  DOI：10.1021/acs.biochem.6b00115

  日期：2016.4.12

  were evident in the X-ray crystal structure, but none were obviously positioned to quench a putative final carbocation intermediate. Incubations in H218O generated labeled product, confirming that the alcohol functionality arises from nucleophilic capture of the final carbocation by water originating from solution. Site-directed mutagenesis of amino acid residues from both within the metal binding motifs

  来自Streptomyces citricolor的倍半萜合酶 Germacradiene-4-ol 合酶 (GdolS)是少数已知的将法呢基二磷酸 (FDP) 转化为单一羟基化产物的高保真萜烯合酶之一。未配体的 GdolS-E248A 晶体衍射到 1.50 Å，显示出典型的 1 类倍半萜烯合酶折叠，其活性位点处于开放构象。金属结合基序被鉴定为 D 80 DQFD 和 N 218 DVRSFAQE。一些结合水分子在 X 射线晶体结构中很明显，但没有一个明显定位于淬灭推定的最终碳正离子中间体。H 2 18孵化O 生成标记产物，证实醇官能团是由来自溶液的水对最终碳正离子的亲核捕获产生的。来自金属结合基序内的氨基酸残基的定点诱变，而不是通过与来自土曲霉的马兜铃烯合酶的序列比对鉴定，产生的主要是功能性 Germacradien-4-ol 合酶。只有 GdolS-N218Q 产生了完全不同的产物（~50%
• Immobilised Enzymes for Sesquiterpene Synthesis in Batch and Flow Systems
  作者：Donya Valikhani、Prabhakar Lal Srivastava、Rudolf K. Allemann、Thomas Wirth

  DOI：10.1002/cctc.201902135

  日期：2020.4.20

  Sesquiterpene synthases catalyse the bioconversion of farnesyl diphosphate into sesquiterpenes. The immobilisation of sesquiterpene synthases on controlled porosity glass through metal‐ion affinity binding is reported. The immobilised sesquiterpene synthases were able to maintain 50 % catalytic activity for at least 50 cycles under continuous flow conditions.

  倍半萜烯合酶催化二磷酸法呢酯向倍半萜烯的生物转化。据报道，通过金属离子亲和力结合将倍半萜烯合酶固定在可控制的孔隙率玻璃上。固定的倍半萜烯合酶在连续流动条件下能够保持50％的催化活性至少50个循环。
• Biomimetic Cationic Cyclopropanation Enables an Efficient Chemoenzymatic Synthesis of 6,8-Cycloeudesmanes
  作者：Phillip S. Grant、Ricardo Meyrelles、Oliver Gajsek、Gerhard Niederacher、Boris Maryasin、Nuno Maulide

  DOI：10.1021/jacs.2c13116

  日期：2023.3.15

  synthetic and computational study of cationic cyclopropanation, focusing on the 6,8-cycloeudesmanes as a platform for this investigation. We were able to apply biomimetic cationic cyclopropanation to the synthesis of several 6,8-cycloeudesmanes and non-natural analogues─in doing so, we showcase the power of this transformation in the preparation of complex cyclopropanes.

  阳离子环丙烷化涉及碳阳离子处的 γ- 消除，通过质子损失形成新的 σ-C-C 键。虽然在本体溶液中极为罕见，但它被认为是主要的生物合成环丙烷化途径之一。尽管受生物启发的合成化学有着丰富的历史，但阳离子环丙烷化反应尚未被用于合成工具箱，这可能是由于碳阳离子倾向于进行竞争性 E1 β-消除途径。在这里，我们提出了阳离子环丙烷化的深入合成和计算研究，重点关注 6,8-环丙烷作为本研究的平台。我们能够将仿生阳离子环丙烷化作用应用于几种 6,8-环丙烷和非天然类似物的合成──在这样做的过程中，