2-氨基-3-o-(2-甲氧基乙基)腺苷酸 | 256224-02-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 2-氨基-3-o-(2-甲氧基乙基)腺苷酸
• 英文名称: 3'-O-methoxyethyl-2,6-diaminopurine riboside
• 英文别名: 2-Amino-3'-O-(2-methoxyethyl)adenosine；(2R,3R,4S,5R)-2-(2,6-diaminopurin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)-4-(2-methoxyethoxy)oxolan-3-ol
• CAS: 256224-02-9
• 化学式: C₁₃H₂₀N₆O₅
• 分子量: 340.339
• InChiKey: CUAPZJHEUMOFCW-WOUKDFQISA-N

物化性质

• 沸点：
  734.5±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.81±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  164
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氨基-3-o-(2-甲氧基乙基)腺苷酸 在 adenosine deaminase 作用下， 以 水 为溶剂， 以72%的产率得到3'-O-methoxyethylguanosine
  参考文献：
  名称：

  一种3’-氧-甲氧乙基核苷的制备方法

  摘要：

  本发明公开了一种3’‑氧‑甲氧乙基核苷的制备方法。所述方法包括步骤：(1)使结构如式B所示的化合物与硅烷化保护的碱基经缩合得到结构如式C所示的化合物；所述碱基选自胸腺嘧啶、5‑甲基胞嘧啶、腺嘌呤或2,6‑二氨基嘌呤；和(2)将结构如式C所示的化合物经碱解反应得到结构如式A所示的3’‑氧‑甲氧乙基核苷；

  公开号：

  CN108424432B
• 作为产物：
  描述：

  1,2 5,6-O-di(isopropylidene)-α-D-allofuranose 在 盐酸 、 ammonium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 potassium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 17.08h， 生成 2-氨基-3-o-(2-甲氧基乙基)腺苷酸
  参考文献：
  名称：

  一种3’-氧-甲氧乙基核苷的制备方法

  摘要：

  本发明公开了一种3’‑氧‑甲氧乙基核苷的制备方法。所述方法包括步骤：(1)使结构如式B所示的化合物与硅烷化保护的碱基经缩合得到结构如式C所示的化合物；所述碱基选自胸腺嘧啶、5‑甲基胞嘧啶、腺嘌呤或2,6‑二氨基嘌呤；和(2)将结构如式C所示的化合物经碱解反应得到结构如式A所示的3’‑氧‑甲氧乙基核苷；

  公开号：

  CN108424432B

文献信息

• Oligonucleotides having A-DNA form and B-DNA form conformational geometry
  申请人：——

  公开号：US20030096979A1

  公开（公告）日：2003-05-22

  Modified oligonucleotides containing both A-form conformation geometry and B-from conformation geometry nucleotides are disclosed. The B-form geometry allows the oligonucleotide to serve as substrates for RNase H when bound to a target nucleic acid strand. The A-form geometry imparts properties to the oligonucleotide that modulate binding affinity and nuclease resistance. By utilizing C2′ endo sugars or O4′ endo sugars, the B-form characteristics are imparted to a portion of the oligonucleotide. The A-form characteristics are imparted via use of either 2′-O-modified nucleotides that have 3′ endo geometries or use of end caps having particular nuclease stability or by use of both of these in conjunction with each other.

  修改的寡核苷酸同时包含A型构象几何和B型构象几何核苷酸。B型构象允许寡核苷酸在与靶核酸链结合时充当RNase H的底物。A型构象赋予寡核苷酸特定属性，调节结合亲和力和核酸酶抵抗性。通过利用C2′内醛糖或O4′内醛糖，将B型特性赋予寡核苷酸的一部分。通过使用具有3′内醛几何结构的2′-O修饰核苷酸或具有特定核酸酶稳定性的端盖，或者同时使用这两者来赋予A型特性。
• An Improved Process for the Manufacture of 5′-<i>O</i>-(4,4′-Dimethoxytrityl)-<i>N</i>²-isobutyryl-2′-<i>O</i>-(2-methoxyethyl)guanosine
  作者：Andrew K. McPherson、Daniel Capaldi、Lijian Chen、Philip Olsen

  DOI：10.1021/acs.oprd.0c00261

  日期：2020.11.20

  A revised, optimized process for the manufacture of 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N2-isobutyryl-2′-O-(2-methoxyethyl)guanosine (MOE G PNS) that controls critical impurities to less than 0.2% was developed. The 2′-O-alkylation of 2,6-diaminopurine riboside (DAPR) with 1-bromo-2-methoxyethane (MOE-Br) in DMSO was examined using a design of experiments approach, which led to the selection of LiOH as the

  经过修订的优化工艺，用于生产5'- O-（4,4'-二甲氧基三苯甲基）-N 2-异丁酰基-2'- O-（2-甲氧基乙基）鸟苷（MOE G PNS），可将杂质降至最低超过了0.2％。使用设计的实验方法检查了DMSO中2，6-二氨基嘌呤核糖苷（DAPR）与1-溴-2-甲氧基乙烷（MOE-Br）的2' - O-烷基化反应，从而选择了LiOH作为最佳基础选择。优化了碱和MOE-Br的当量，以控制关键的3' - O-（2-甲氧基乙基）杂质和残留DAPR的水平。使用SP-207树脂通过固相萃取去除DMSO，得到所需的2'- O-（2-甲氧基乙基）-2,6-二氨基嘌呤核糖苷（MOE DAPR）在水溶液中的产率为53％。通过与MEK共蒸馏，可控制在批量生产的MOE-Br中常见的甲基溴杂质，从而控制所得的关键2'- O-甲基核苷杂质。将该水溶液伸缩式转化为MOE DAPR到2'- O的酶促转化-（2-甲氧基乙基）鸟苷（MOE
• Process Research on the Preparation of DMT Protected 2′-<i>O</i>-Methoxyethylguanosine for Oligonucleotide Synthesis in Therapeutic Applications
  作者：Shabbir Ali S. Taj、S. Narayanan、S. Suman Meenakshi、Yogesh S. Sanghvi、Bruce S. Ross、Vasulinga T. Ravikumar

  DOI：10.1080/15257770802271748

  日期：2008.8.28

  An optimized process to synthesize DMT protected 2 '-O-methoxyethylguanosine is described. A key step involves the enzymatic deamination of a mixture of alkylated products to selectively afford the desired material without resorting to chromatography for purification. This approach was scaled up to kilogram quantities for use in oligonucleotide therapeutics. [Formula: see text].

  描述了合成DMT保护的2'-O-甲氧基乙基鸟苷的优化方法。关键步骤涉及对烷基化产物混合物进行酶脱氨处理，以选择性地提供所需物质，而无需借助色谱法进行纯化。该方法按比例放大至千克数量，用于寡核苷酸治疗。[公式：见文字]。
• PROCESS FOR THE SYNTHESIS OF 2'-O-SUBSTITUTED PURINES
  申请人：Ravikumar Vasulinga

  公开号：US20080234475A1

  公开（公告）日：2008-09-25

  The present invention provides an improved process for the synthesis of 2′-O-substituted purine nucleosides. The process includes anhydro or thioanhydro ring opening of a selected 8,2′-cyclopurine nucleoside with a weak nucleophile in the presence of a Lewis acid ester, followed by reduction to afford the desired 2′-O-substituted purine nucleoside.

  本发明提供了一种改进的合成2'-O-取代嘌呤核苷的方法。该方法包括在路易斯酸酯的存在下，使用弱亲核试剂进行选择性的8,2'-环戊嘧啶核苷的无水或硫醇无水环开启，然后还原以得到所需的2'-O-取代嘌呤核苷。
• Human RNase H1 and oligonucleotide compositions thereof
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20040102618A1

  公开（公告）日：2004-05-27

  The present invention provides oligonucleotides that can serve as substrates for human Type 2 RNase H. The present invention is also directed to methods of using these oligonucleotides in enhancing antisense oligonucleotide therapies.

  本发明提供了可以作为人类2型RNA酶H底物的寡核苷酸。本发明还涉及使用这些寡核苷酸增强反义寡核苷酸治疗的方法。