{[(S)-2-(9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-propyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-acetic acid benzyl ester | 382149-37-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: {[(S)-2-(9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-propyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-acetic acid benzyl ester
• 英文别名: benzyl 2-[[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetate
• CAS: 382149-37-3
• 化学式: C₃₄H₃₄N₄O₇
• 分子量: 610.667
• InChiKey: MGEOJMJBMKCXJC-QHCPKHFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  {[(S)-2-(9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-propyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-acetic acid benzyl ester 在 5% Pd/C 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 N-(2-Fmoc-amino-2-L-methylethyl)-N-(thymin-1-ylacetyl)glycine
  参考文献：
  名称：

  双语肽核酸：在单个自组装生物聚合物中编码核酸和蛋白质的语言

  摘要：

  核酸和蛋白质是支持地球上所有生命的基本生物聚合物。核酸在核碱基序列中存储大量信息，而肽和蛋白质利用不同的氨基酸官能团来采用复杂的结构并执行广泛的活动。尽管大自然已经进化出读取核酸密码并将其翻译成氨基酸密码的机器，但现存的生物聚合物仅限于单独编码氨基酸或核苷酸序列，限制了它们在医学和生物技术中的潜在应用。在这里，我们描述了设计、合成、双语生物聚合物的刺激响应组装行为，将氨基酸和核碱基序列整合到单个肽核酸 (PNA) 支架中，以实现三级结构行为和可编程分子识别能力的可调存储和检索。沿着 PNA 骨架并入定义的氨基酸侧链序列产生具有“蛋白质代码”的两亲物，其在水性条件下指导自组装成胶束结构。然而，这些两亲物也携带一个“核苷酸密码”，因此随后引入互补 RNA 链会通过杂交诱导组装的序列特异性破坏。一起，这些特性使双语 PNA 成为一种强大的生物聚合物，它结合了两个信息系统来利用结构响应和序列识别。PNA

  DOI：

  10.1021/jacs.9b09146
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-丙氨醛 在 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 {[(S)-2-(9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-propyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-acetic acid benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of chiral peptide nucleic acids using Fmoc chemistry

  摘要：

  A Fmoc-based synthesis of chiral PNAs is described. Chiral monomer backbones were efficiently prepared by reductive amination of N-Fmoc-protected L,D-alaninals with glycine esters and the subsequent acylation of free amines with thymine-1-ylacetic acid. The dimer derivative of L-amino acid was prepared in solution. Finally, a chiral decamer was obtained by a solid phase strategy using a succinyl-linked support. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)00789-x

文献信息

• Bilingual Peptide Nucleic Acids: Encoding the Languages of Nucleic Acids and Proteins in a Single Self-Assembling Biopolymer
  作者：Colin S. Swenson、Arventh Velusamy、Hector S. Argueta-Gonzalez、Jennifer M. Heemstra

  DOI：10.1021/jacs.9b09146

  日期：2019.12.4

  synthesis, and stimuli-responsive assembly behavior of a bilingual biopolymer that integrates both amino acid and nucleobase sequences into a single peptide nucleic acid (PNA) scaffold to enable tunable storage and retrieval of tertiary structural behavior and programmable molecular recognition capabilities. Incorporation of a defined sequence of amino acid side-chains along the PNA backbone yields amphiphiles

  核酸和蛋白质是支持地球上所有生命的基本生物聚合物。核酸在核碱基序列中存储大量信息，而肽和蛋白质利用不同的氨基酸官能团来采用复杂的结构并执行广泛的活动。尽管大自然已经进化出读取核酸密码并将其翻译成氨基酸密码的机器，但现存的生物聚合物仅限于单独编码氨基酸或核苷酸序列，限制了它们在医学和生物技术中的潜在应用。在这里，我们描述了设计、合成、双语生物聚合物的刺激响应组装行为，将氨基酸和核碱基序列整合到单个肽核酸 (PNA) 支架中，以实现三级结构行为和可编程分子识别能力的可调存储和检索。沿着 PNA 骨架并入定义的氨基酸侧链序列产生具有“蛋白质代码”的两亲物，其在水性条件下指导自组装成胶束结构。然而，这些两亲物也携带一个“核苷酸密码”，因此随后引入互补 RNA 链会通过杂交诱导组装的序列特异性破坏。一起，这些特性使双语 PNA 成为一种强大的生物聚合物，它结合了两个信息系统来利用结构响应和序列识别。PNA
• Synthesis of chiral peptide nucleic acids using Fmoc chemistry
  作者：Yun Wu、Jie-Cheng Xu

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)00789-x

  日期：2001.9

  A Fmoc-based synthesis of chiral PNAs is described. Chiral monomer backbones were efficiently prepared by reductive amination of N-Fmoc-protected L,D-alaninals with glycine esters and the subsequent acylation of free amines with thymine-1-ylacetic acid. The dimer derivative of L-amino acid was prepared in solution. Finally, a chiral decamer was obtained by a solid phase strategy using a succinyl-linked support. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.