N⁶-methyl-N⁶-2-(hydroxyethyl)adenosine | 138333-52-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N⁶-methyl-N⁶-2-(hydroxyethyl)adenosine
• 英文别名: N⁶,N⁶-methyl(2-hydroxyethyl)adenosine；(2R,3R,4S,5R)-2-(6-((2-hydroxyethyl)(methyl)amino)-9H-purin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol；(2R,3R,4S,5R)-2-[6-[2-hydroxyethyl(methyl)amino]purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 138333-52-5
• 化学式: C₁₃H₁₉N₅O₅
• 分子量: 325.324
• InChiKey: LBPGNBDUZKQSHB-QYVSTXNMSA-N

物化性质

• 沸点：
  676.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.74±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-甲基-2-羟基乙胺 、 6-氯嘌呤核苷 以 乙醇 为溶剂， 以89 %的产率得到N⁶-methyl-N⁶-2-(hydroxyethyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  发现口服 AMP 激活蛋白激酶激活剂治疗高脂血症

  摘要：

  激活 AMP 激活蛋白激酶 (AMPK) 被认为可以缓解高脂血症。以虫草素和N6-(2-羟乙基)腺苷(HEA)为先导化合物，设计、合成了一系列腺苷衍生物，并评估了其对AMPK的激活作用。最后，化合物V1被鉴定为一种有效的AMPK激活剂，具有降脂作用。分子对接和圆二色性表明V1通过与AMPK的γ亚基结合发挥其活性。 V1显着降低C57BL/6小鼠、金仓鼠和恒河猴的血清低密度脂蛋白胆固醇水平。 V1被选为临床化合物并完成1期临床试验。治疗 5 小时和 12 小时后，单剂量 V1（2000 毫克）可增加人红细胞中的 AMPK 激活。 RNA测序数据表明，V1通过激活AMPK下调参与细胞凋亡过程、脂质代谢、内质网应激和肝脏炎症反应调节的基因表达。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c01267

文献信息

• Anti-HCV nucleoside derivatives
  申请人：——

  公开号：US20030008841A1

  公开（公告）日：2003-01-09

  The present invention comprises novel and known purine and pyrimidine nucleoside derivatives which have been discovered to be active against hepatitis C virus (HCV). The use of these derivatives for the treatment of HCV infection is claimed as are the novel nucleoside derivatives disclosed herein.

  本发明涉及新颖和已知的嘌呤和嘧啶核苷衍生物，已发现这些衍生物对丙型肝炎病毒（HCV）具有活性。本发明声明利用这些衍生物治疗HCV感染，以及本文所披露的新颖核苷衍生物。
• Improved Synthesis of Phosphoramidite-Protected N6-Methyladenosine via BOP-Mediated SNAr Reaction
  作者：Shifali Shishodia、Christopher J. Schofield

  DOI：10.3390/molecules26010147

  日期：——

  N6-methyladenosine(m6A) is the most abundant modification in mRNA. Studies on proteins that introduce and bind m6A require the efficient synthesis of oligonucleotides containing m6A. We report an improved five-step synthesis of the m6A phosphoramidite starting from inosine, utilising a 1-H-benzotriazol-1-yloxytris(dimethylamino)phosphoniumhexafluorophosphate (BOP)-mediated SNAr reaction in the key

  N6-甲基腺苷 (m6A) 是 mRNA 中最丰富的修饰。对引入和结合 m6A 的蛋白质的研究需要有效合成含有 m6A 的寡核苷酸。我们报告了从肌苷开始的 m6A 亚磷酰胺的改进的五步合成，在关键步骤中利用 1-H-苯并三唑-1-基氧基三（二甲氨基）鏻六氟磷酸盐（BOP）介导的 SNAr 反应。与报道的路线相比，该路线的总产量显着增加，并且可用于合成其他腺苷衍生物的亚磷酰胺，例如乙醇腺苷，一种由重要的抗癌药物卡莫司汀形成的 DNA 加合物的 RNA 类似物。
• Formation of etheno adducts of adenosine and cytidine from 1-halooxiranes. Evidence for a mechanism involving initial reaction with the endocyclic nitrogen atoms
  作者：F. Peter Guengerich、Veronica D. Raney

  DOI：10.1021/ja00029a041

  日期：1992.1

  The etheno derivatives of nucleic acid bases contain an additional ring and are of interest because of their useful fluorescence properties and their potential as mutagenic lesions in DNA. The mechanism of formation from 2-haloacetaldehydes is known to involve initial Schiff base formation at an exocyclic nitrogen; however, mechanisms of formation from the more relevant 1-substituted oxiranes have not been established. The reaction of N6-methyladenosine (5) with 1-chlorooxirane yielded the stable carbinolamine 7,8-dihydro-8-hydroxy-9-methyl-3-beta-D-ribofuranosylimidazo[2,1-i]purinium species (10), consistent with initial attack of the N1 atom of adenine at the methylene of 1-chlorooxirane. No products indicative of initial reaction at the N6 atom of adenine were found. Reaction of 2,2-dibromoethanol with adenosine or cytidine at pH 9.2 yielded 1,N6-ethenoadenosine (1) or 3,N4-ethenocytidine (2), respectively, presumably via the base-catalyzed formation of 1-bromooxirane from the bromohydrin. When reactions were done with 2,2-dibromo[1-C-13]ethanol, 1 contained label only at C-7 and 2 contained label only at C-3. A role for 2-bromoacetaldehyde in these reactions was ruled out by the lack of incorporation of deuterium from (H2O)-H-2 into 1 under conditions where the exchange of the methylene protons of 2-bromoacetaldehyde with the solvent was relatively rapid. The collective results are most consistent with a mechanism in which the basic endocyclic nitrogen (N1 of adenine or N3 of cytosine) reacts with the methylene carbon of the 1-halooxirane, and, after ring opening and loss of the leaving group, the resulting aldehyde reacts with the exocyclic nitrogen to form the additional ring.
• NUCLEOSIDE DERIVATIVES FOR THE TREATMENT OF HEPATITIS C
  申请人：F. HOFFMANN-LA ROCHE AG

  公开号：EP1315736A2

  公开（公告）日：2003-06-04
• [EN] NUCLEOSIDE DERIVATIVES FOR THE TREATMENT OF HEPATITIS C<br/>[FR] DERIVES DE NUCLEOSIDES
  申请人：——

  公开号：WO2002018404A9

  公开（公告）日：2003-10-02

  [EN] Use of compounds of formula (I), wherein R<1> is hydrogen, hydroxy, alkyl, hydroxyalkyl, alkoxy, halogen, cyano, isocyano or azido; R<2> is hydrogen, hydroxy, alkoxy, chlorine, bromine or iodine; R<3> is hydrogen; or R<2> and R<3> together represent =CH2; or R<2> and R<3> represent fluorine; X is O, s or CH2; a, b, c, d denoting asymmetric carbon atoms each of which is substituted with 4 different substituents; and B signifies a purine base B1 which is connected through the 9-nitrogen of formula (B1), wherein R<4> is hydrogen, hydroxyl, alkyl, alkoxy, alkylthio, aryloxy, arylthio, heterocyclyl, NR<7>R<8>, halogen or SH; R<5> is hydrogen, hydroxy, alkyl, haloalkyl, cycloalkyl, alkoxy, alkylthio, aryl, aryloxy, arylthio, heterocyclyl, heterocyclylamino, halogen, NR<7>R<8>, NHOR<9>, NHNR<7>R<8> or SH; R<6> is hydrogen, hydroxy, alkyl, alkoxy, alkylthio, aryloxy, arylthio, heterocyclyl, NR<7>R<8>, halogen, SH or cyano; R<7> and R<8> are independently of each other hydrogen, alkyl, aryl, hydroxyalkyl, alkenylalkyl, alkynylalkyl, cycloalkyl or acyl; R<9> is hydrogen, alkyl or aryl; or B signifies an oxidised purine base B2 which is connected through the 9-nitrogen of formula (B2), wherein R<4>, R<5> and R<6> are as defined above; or B signifies a purine base B3 which is connected through the 9-nitrogen of formula (B3), wherein R<4> and R<6> are as defined above; R<10> is hydrogen, alkyl or aryl; Y is O, S or NR<11>; R<11> is hydrogen, hydroxy, alkyl, OR<9>, heterocyclyl or NR<7>R<8>; R<7>, R<8> and R<9> are as defined above; or B signifies a pyrimidine base B4 which is connected through the 1-nitrogen of formula (B4), wherein Z is O or S; R<12> is hydrogen, hydroxy, alkyl, alkoxy, haloalkyl, alkylthio, aryl, aryloxy, arylthio, heterocyclyl, heterocyclylamino, halogen, NR<7>R<8>, NHOR<9>, NHNR<7>R<8> or SH; R<13> is hydrogen, alkyl, hydroxyalkyl, alkoxyalkyl, haloalkyl, cycloalkyl or halogen; R<7>, R<8> and R<9> are as defined above; or B signifies a pyrimidine base B5 which is connected through the 1-nitrogen of formula (B5), wherein Y, Z, R<10> are as defined above for the treatment of diseases mediated by the Hepatitis C Virus (HIV) or for the preparation of a medicament for such treatment. The invention is concerned with novel and known purine and pyrimidine nucleoside derivatives, their use as inhibitors of subgenomic Hepatitis C Virus (HCV) RNA replication and pharmaceutical compositions of such compounds.
  [FR] L'invention concerne l'utilisation de composés représentés par la formule (I), dans laquelle R<1> représente hydrogène, hydroxy, alkyle, hydroxyalkyle, alcoxy, halogène, cyano, isocyano ou azido; R<2> représente hydrogène, hydroxy, alcoxy, chlore, brome ou iode; R<3> représente hydrogène; ou R<2> et R<3> représentent ensemble =CH2; ou R<2> et R<3> représentent fluor; X représente O, S ou CH2; a, b, c, d représentant des atomes de carbone asymétriqued dont chacun est subtitué avec 4 substituants différents; et B représente une base purique B1 qui est reliée au moyen du 9-azote représenté par la formule (B1), dans laquelle R<4> représente hydrogène, hydroxy, alkyle, alcoxy, alkylthio, aryloxy, arylthio, hétérocyclyle, NR<7>R<8>, halogène ou SH; R<5> représente hydrogène, hydroxy, alkyle, haloalkyle, cycloalkyle, alcoxy, alkylthio, aryle, aryloxy, arylthio, hétérocyclyle, hétérocyclylamino, halogène, NR<7>R<8>, NHOR<9>, NHNR<7>R<8> ou SH; R<6> représente hydrogène, hydroxy, alkyle, alcoxy, alkylthio, aryloxy, arylthio, hétérocyclyle, NR<7>R<8>, halogène, SH ou cyano; R<7> et R<8> représentent independamment l'un de l'autre hydrogène, alkyle, aryle, hydroxyalkyle, alcénylalkyle, alkynylalkyle, cycloalkyle ou acyle; R<9> représente hydrogène, alkyle ou aryle; ou B représente une base purique oxydée B2 qui est reliée au moyen du 9-azote représenté par la formule (B2), dans laquelle R<4>, R<5> et R<6> sont tels que définis ci-dessus; ou B représente une base purique B3 qui est reliée au moyen du 9-azote représenté par la formule (B3), dans laquelle R<4> et R<6> sont tels que définis ci-dessus; R<10> représente hydrogène, alkyle ou aryle; Y représente O, S ou NR<11>; R<11> représente hydrogène, hydroxy, alkyle, OR<9>, hétérocyclyle ou NR<7>R<8>; R<7>, R<8> et R<9> sont tels que définis ci-dessus; ou B représente une base pyrimidique B4 qui est reliée au moyen du 1-azote représenté par la formule (B4), dans laquelle Z représente O ou S; R<12> représente hydrogène, hydroxy, alkyle, alcoxy, haloalkyle, alkylthio, aryle, aryloxy, arylthio, hétérocyclyle, hétérocyclylamino, halogène, NR<7>R<8>, NHOR<9>, NHNR<7>R<8> ou SH; R<13> représente hydrogène, alkyle, hydroxyalkyle, alcoxyalkyle, haloalkyle, cycloalkyle ou halogène; R<7>, R<8> et R<9> sont tels que définis ci-dessus; ou B représente une base pyrimidique B5 qui est reliée au moyen du 1-azote représenté par la formule (B5), dans laquelle Y, Z, R<10> et R13 sont tels que définis ci-dessus, pour le traitement de maladies à médiation du virus de l'hépatite C (VHC) ou pour la préparation d'un médicament pour un tel traitement. L'invention concerne des dérivés de nucléosides puriques et pyrimidiques connus et nouveaux, ainsi que leur utilisation en tant qu'inhibiteur de la réplication de l'ARN du virus de l'hépatite C (VHC) subgénomique et des compositions pharmaceutiques de tels composés.