(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(((2R,3S)-3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yl)oxy)-2-(acetoxymethyl)-5-aminotetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate | 944412-79-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (2R,3R,4R,5R,6S)-6-(((2R,3S)-3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yl)oxy)-2-(acetoxymethyl)-5-aminotetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
• CAS: 944412-79-7
• 化学式: C₃₄H₄₀N₂O₁₂
• 分子量: 668.698
• InChiKey: SBRLPZPBTMCXDP-JGHHQKFESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.51
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  188.01
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R,6S)-6-(((2R,3S)-3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yl)oxy)-2-(acetoxymethyl)-5-aminotetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate 在 四(三苯基膦)钯 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-甲基苯胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.75h， 生成 2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(4,5-diacetoxy-6-(acetoxymethyl)-3-(2-(tritylthio)acetamido)tetrahydro-2H-pyran-2-yloxy)butanoic acid
  参考文献：
  名称：

  糖蛋白合成中的糖辅助连接

  摘要：

  糖辅助连接 (SAL) 为合成糖肽提供了一种有吸引力的策略，包括合成不含半胱氨酸的 β-O 连接和 N 连接糖肽。在这里，我们扩展了 SAL 用于合成 α-O 连接的糖肽和糖蛋白的效用。为了在糖蛋白合成的背景下探索 SAL，我们开发了一种新的化学合成路线，用于 α-O 连接的糖蛋白双萜 epsilon。在我们合成的第一阶段，SAL 通过 Gly-Val 连接点组装了双萜片段 Cys(Acm)37-Gly(52) 和片段 Val(53)-Phe(82)。随后，在 Acm 脱保护后，通过天然化学连接 (NCL) 将敌百虫片段 Cys(37)-Phe(82) 连接到片段 Asp(1)-Asn(36) 以提供完整的敌百虫 epsilon 序列。在最后的合成步骤中，应用氢解从糖部分去除硫醇手柄，同时将突变的 Cys(37) 转化为天然丙氨酸残基。此外，我们通过在乙酰氨基甲基 (Acm) 保护的半胱氨

  DOI：

  10.1021/ja0708971
• 作为产物：
  描述：

  (3R,4R,5S,6S)-6-((2R,3S)-3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yloxy)-2-(acetoxymethyl)-5-azidotetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate 在 溶剂黄146 、 锌 作用下， 反应 4.0h， 以94%的产率得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(((2R,3S)-3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yl)oxy)-2-(acetoxymethyl)-5-aminotetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
  参考文献：
  名称：

  糖蛋白合成中的糖辅助连接

  摘要：

  糖辅助连接 (SAL) 为合成糖肽提供了一种有吸引力的策略，包括合成不含半胱氨酸的 β-O 连接和 N 连接糖肽。在这里，我们扩展了 SAL 用于合成 α-O 连接的糖肽和糖蛋白的效用。为了在糖蛋白合成的背景下探索 SAL，我们开发了一种新的化学合成路线，用于 α-O 连接的糖蛋白双萜 epsilon。在我们合成的第一阶段，SAL 通过 Gly-Val 连接点组装了双萜片段 Cys(Acm)37-Gly(52) 和片段 Val(53)-Phe(82)。随后，在 Acm 脱保护后，通过天然化学连接 (NCL) 将敌百虫片段 Cys(37)-Phe(82) 连接到片段 Asp(1)-Asn(36) 以提供完整的敌百虫 epsilon 序列。在最后的合成步骤中，应用氢解从糖部分去除硫醇手柄，同时将突变的 Cys(37) 转化为天然丙氨酸残基。此外，我们通过在乙酰氨基甲基 (Acm) 保护的半胱氨

  DOI：

  10.1021/ja0708971

文献信息

• Extended Sugar-Assisted Glycopeptide Ligations:  Development, Scope, and Applications
  作者：Richard J. Payne、Simon Ficht、Sishi Tang、Ashraf Brik、Yu-Ying Yang、David A. Case、Chi-Huey Wong

  DOI：10.1021/ja073653p

  日期：2007.11.1

  of the method we report here the development of an extended SAL method. Glycopeptides containing up to six amino acid extensions N-terminal to the glycosylated residue were shown to facilitate ligation reactions with peptide thioesters, and these products were isolated in good yields. Kinetic analysis was used to show that as glycopeptides were extended by further amino acid residues, ligation reactions

  最近，我们报道了糖辅助连接 (SAL) 的发展，这是一种用于合成糖肽的新型肽连接方法。在对糖蛋白数据库中的大量糖蛋白序列进行筛选后，很明显，很大比例（约 53%）的 O-糖基化位点包含不会发生 SAL 反应的氨基酸残基。为了克服这些固有的局限性并扩大我们在此报告的扩展 SAL 方法的开发范围。糖基化残基 N 端最多含有 6 个氨基酸延伸的糖肽显示出促进与肽硫酯的连接反应，并且这些产物以良好的产率分离。动力学分析表明，随着糖肽被更多氨基酸残基延伸，连接反应变得更慢。这一发现通过使用 AMBER9 的分子动力学模拟得到了合理化。这些研究表明了一个普遍趋势，即硫酯中间体（N 端胺和硫酯的羰基碳）的反应位点之间的近端距离随着糖肽的延长而增加，从而减慢了连接速度。每种扩展的 SAL 方法都对连接点处的许多不同氨基酸组合显示出广泛的耐受性。对糖蛋白数据库的重新评估表明，现在可以利用 95% 的 O-连接糖基化位点来促进
• METHOD OF PREPARING GLYCOPEPTIDES
  申请人：THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE

  公开号：EP1996609B1

  公开（公告）日：2016-08-03