6-(3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yloxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-(tritylthio)acetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate | 944412-75-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6-(3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yloxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-(tritylthio)acetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
• CAS: 944412-75-3
• 化学式: C₅₅H₅₆N₂O₁₃S
• 分子量: 985.121
• InChiKey: QPYFCMIUONXWQT-SERCBKIUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.39
• 重原子数：
  71.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  191.09
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yloxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-(tritylthio)acetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate 在 四(三苯基膦)钯 N-甲基苯胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.75h， 以100%的产率得到2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(4,5-diacetoxy-6-(acetoxymethyl)-3-(2-(tritylthio)acetamido)tetrahydro-2H-pyran-2-yloxy)butanoic acid
  参考文献：
  名称：

  扩展的糖辅助糖肽连接：发展、范围和应用

  摘要：

  最近，我们报道了糖辅助连接 (SAL) 的发展，这是一种用于合成糖肽的新型肽连接方法。在对糖蛋白数据库中的大量糖蛋白序列进行筛选后，很明显，很大比例（约 53%）的 O-糖基化位点包含不会发生 SAL 反应的氨基酸残基。为了克服这些固有的局限性并扩大我们在此报告的扩展 SAL 方法的开发范围。糖基化残基 N 端最多含有 6 个氨基酸延伸的糖肽显示出促进与肽硫酯的连接反应，并且这些产物以良好的产率分离。动力学分析表明，随着糖肽被更多氨基酸残基延伸，连接反应变得更慢。这一发现通过使用 AMBER9 的分子动力学模拟得到了合理化。这些研究表明了一个普遍趋势，即硫酯中间体（N 端胺和硫酯的羰基碳）的反应位点之间的近端距离随着糖肽的延长而增加，从而减慢了连接速度。每种扩展的 SAL 方法都对连接点处的许多不同氨基酸组合显示出广泛的耐受性。对糖蛋白数据库的重新评估表明，现在可以利用 95% 的 O-连接糖基化位点来促进

  DOI：

  10.1021/ja073653p
• 作为产物：
  描述：

  (3R,4R,5S,6S)-6-((2R,3S)-3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yloxy)-2-(acetoxymethyl)-5-azidotetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 锌 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 6-(3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutan-2-yloxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-(tritylthio)acetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
  参考文献：
  名称：

  糖蛋白合成中的糖辅助连接

  摘要：

  糖辅助连接 (SAL) 为合成糖肽提供了一种有吸引力的策略，包括合成不含半胱氨酸的 β-O 连接和 N 连接糖肽。在这里，我们扩展了 SAL 用于合成 α-O 连接的糖肽和糖蛋白的效用。为了在糖蛋白合成的背景下探索 SAL，我们开发了一种新的化学合成路线，用于 α-O 连接的糖蛋白双萜 epsilon。在我们合成的第一阶段，SAL 通过 Gly-Val 连接点组装了双萜片段 Cys(Acm)37-Gly(52) 和片段 Val(53)-Phe(82)。随后，在 Acm 脱保护后，通过天然化学连接 (NCL) 将敌百虫片段 Cys(37)-Phe(82) 连接到片段 Asp(1)-Asn(36) 以提供完整的敌百虫 epsilon 序列。在最后的合成步骤中，应用氢解从糖部分去除硫醇手柄，同时将突变的 Cys(37) 转化为天然丙氨酸残基。此外，我们通过在乙酰氨基甲基 (Acm) 保护的半胱氨

  DOI：

  10.1021/ja0708971

文献信息

• METHOD OF PREPARING GLYCOPEPTIDES
  申请人：THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE

  公开号：EP1996609B1

  公开（公告）日：2016-08-03