4-(2,3-二氢吲哚-1-基)-4-氧代丁酸 | 105105-00-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: 4-(2,3-二氢吲哚-1-基)-4-氧代丁酸
• 英文名称: 4-(indolin-1-yl)-4-oxobutanoic acid
• 英文别名: 1-Succinyl-indolin；4-(2,3-Dihydro-indol-1-yl)-4-oxo-butyric acid；4-(2,3-dihydroindol-1-yl)-4-oxobutanoic acid
• CAS: 105105-00-8
• 化学式: C₁₂H₁₃NO₃
• mdl: MFCD00458379
• 分子量: 219.24
• InChiKey: SWNRXQYQTQVWKA-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  503.2±43.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.301±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.333
• 拓扑面积：
  57.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 海关编码：
  2933990090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(2,3-二氢吲哚-1-基)-4-氧代丁酸 在 palladium on activated charcoal 三氯化铝 、 草酰氯 、 氢气 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 溶剂黄146 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 60.0 ℃ 、344.74 kPa 条件下， 反应 47.0h， 生成 2,3,6,7-tetrahydroazepino[3,2,1-hi]indole-4(1H)-one
  参考文献：
  名称：

  5-哌嗪基-1,2,6,7-四氢-5H-氮杂环庚烷[3,2,1-hi]吲哚-4-酮衍生物的设计，合成和发现：新型的混合多巴胺D2 / D4受体系列拮抗剂。

  摘要：

  设计，合成并鉴定了5-哌嗪基-1,2,6,7-四氢-5H-叠氮[3,2,1-hi]吲哚-4-酮衍生物，并将其鉴定为混合多巴胺D（2）的新系列/ D（4）受体拮抗剂。该系列的特点是刚性三环系统是重要的药效基团核心结构，具有很高的结合亲和力。还描述了分子模型研究。

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(02)01056-9
• 作为产物：
  描述：

  methyl 4-(indolin-1-yl)-4-oxobutanoate 在 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 4.0h， 以67%的产率得到4-(2,3-二氢吲哚-1-基)-4-氧代丁酸
  参考文献：
  名称：

  Notum 共价抑制的结构见解

  摘要：

  羧酸酯酶 Notum 水解 Wingless/Integrated (Wnt) 配体的棕榈油酸酯部分，并使 Wnt 信号传导失活。 Notum 抑制剂可以恢复 Wnt 信号传导，这可能对骨质疏松症和阿尔茨海默病等疾病有治疗作用。我们报告了一类新型共价 Notum 抑制剂 4-(吲哚啉-1-基)-4-氧代丁酸酯的鉴定。 Notum 抑制剂复合物的高分辨率晶体结构揭示了亲核体丝氨酸 232 和水解丁酸酯之间形成的常见共价加合物。通过质谱分析证实了溶液中的共价相互作用。抑制效力根据所使用的弹头而变化。从机制上讲，所得酰基酶中间体羰基原子的位置不利于活性位点水的接近，再加上与酶袋残基的强疏水相互作用，阻碍了中间体的进一步加工并导致共价抑制。这些对 Notum 催化抑制的见解可能会指导更有效的 Notum 抑制剂的开发。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c00701

文献信息

• Exploitation of Conformational Dynamics in Imparting Selective Inhibition for Related Matrix Metalloproteinases
  作者：Kiran V. Mahasenan、Maria Bastian、Ming Gao、Emma Frost、Derong Ding、Katerina Zorina-Lichtenwalter、John Jacobs、Mark A. Suckow、Valerie A. Schroeder、William R. Wolter、Mayland Chang、Shahriar Mobashery

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.7b00130

  日期：2017.6.8

  Matrix metalloproteinases (MMPs) have numerous physiological functions and share a highly similar catalytic domain. Differential dynamical information on the closely related human MMP-8, -13, and -14 was integrated onto the benzoxazinone molecular template. An in silico library of 28,099 benzoxazinones was generated and evaluated in the context of the molecular-dynamics information. This led to experimental

  基质金属蛋白酶（MMP）具有多种生理功能，并具有高度相似的催化结构域。有关紧密相关的人类MMP-8，-13和-14的差异动力学信息被整合到苯并嗪酮分子模板中。在分子动力学信息的背景下，生成了一个包含28,099个苯并恶嗪酮的计算机电子文库，并对其进行了评估。这导致对19种合成化合物进行实验评估并鉴定选择性抑制剂，这些抑制剂在描述MMP的生理功能方面具有潜在的实用性。此外，该方法作为一个例子，说明如何利用紧密相关的活性位点的动力学来实现小分子的选择性抑制，并应在具有相似活性位点的其他酶家族中找到应用。
• 内酰胺类衍生物、其制备方法及其在医药上的用途
  申请人：察略盛医药科技（上海）有限公司

  公开号：CN112079839A

  公开（公告）日：2020-12-15

  本发明涉及内酰胺类衍生物、其制备方法及其在医药上的应用。具体而言，本发明涉及一种通式(I)所示的内酰胺类衍生物、其制备方法及其可药用的盐，以及它们作为治疗剂，特别是用于治疗炎症性疾病、神经退行性疾病、肿瘤等和相关病症和疾病的用途，其中通式(I)中的各取代基的定义与说明书中的定义相同。
• INDOLINE SCAFFOLD SHP-2 INHIBITORS AND CANCER TREATMENT METHOD
  申请人：Wu Jie

  公开号：US20110190315A1

  公开（公告）日：2011-08-04

  The subject invention concerns methods and compounds for inhibiting Shp2. In one embodiment, a compound of the invention has a chemical structure as shown in formula I or II: wherein X, Y, and Z are independently N or S; R 1 is cycloalkyl, heterocycloalkyl, aryl, or heteroaryl, any of which can be optionally substituted with one or more of halogen; alkyl; heteroalkyl; —COOH; —C(R 3 ) 3 , wherein R 3 can independently be any of —H or halogen; or —OR 4 , wherein R 4 can be any of H, alkyl, or heteroalkyl; R 2 is alkyl, alkylcarbonyl, heteroalkylcarbonyl, aryl, arylcarbonyl, heterocycloalkylcarbonyl, cycloalkylcarbonyl, or —C(O)NR 6 R 7 , any of which can be optionally substituted with one or more of halogen; alkyl; heteroalkyl; carbonyl; —OR 4 , wherein R 4 can be —H, alkyl, or heteroalkyl; —OH; —C(R 3 ) 3 , wherein R 3 can independently be any of —H or halogen; aryl, which can be substituted with one or more of halogen or —OR 4 ; heterocycloalkyl; or —C(O)OR 5 , wherein R 5 can be —H or alkyl; R 6 and R 7 are independently —H, alkyl, heteroalkyl, aryl, or heteroaryl; and R′ is H or alkyl; or a pharmaceutically acceptable salt or hydrate thereof.

  本发明涉及用于抑制Shp2的方法和化合物。在一种实施例中，本发明的化合物具有如公式I或II所示的化学结构：其中X，Y和Z分别是N或S；R1是环烷基，杂环烷基，芳基或杂芳基，其中任何一个可以选择性地被一个或多个卤素；烷基；杂烷基；-COOH；-C（R3）3，其中R3可以独立地是-H或卤素；或-OR4，其中R4可以是H，烷基或杂烷基；R2是烷基，烷基羰基，杂烷基羰基，芳基，芳基羰基，杂环烷基羰基，环烷基羰基或-C（O）NR6R7，其中任何一个可以选择性地被一个或多个卤素；烷基；杂烷基；羰基；-OR4，其中R4可以是-H，烷基或杂烷基；-OH；-C（R3）3，其中R3可以独立地是-H或卤素；芳基，可以被一个或多个卤素或-OR4取代；杂环烷基；或-C（O）OR5，其中R5可以是-H或烷基；R6和R7独立地是-H，烷基，杂烷基，芳基或杂芳基；R'是H或烷基；或其药学上可接受的盐或水合物。
• Indoline scaffold SHP-2 inhibitors and cancer treatment method
  申请人：Wu Jie

  公开号：US09174969B2

  公开（公告）日：2015-11-03

  The subject invention concerns methods and compounds for inhibiting Shp2. In one embodiment, a compound of the invention has a chemical structure as shown in formula I or II: wherein X, Y, and Z are independently N or S; R1 is cycloalkyl, heterocycloalkyl, aryl, or heteroaryl, any of which can be optionally substituted with one or more of halogen; alkyl; heteroalkyl; —COOH; —C(R3)3, wherein R3 can independently be any of —H or halogen; or —OR4, wherein R4 can be any of H, alkyl, or heteroalkyl; R2 is alkyl, alkylcarbonyl, heteroalkylcarbonyl, aryl, arylcarbonyl, heterocycloalkylcarbonyl, cycloalkylcarbonyl, or —C(O)NR6R7, any of which can be optionally substituted with one or more of halogen; alkyl; heteroalkyl; carbonyl; —OR4, wherein R4 can be —H, alkyl, or heteroalkyl; —OH; —C(R3)3, wherein R3 can independently be any of —H or halogen; aryl, which can be substituted with one or more of halogen or —OR4; heterocycloalkyl; or —C(O)OR5, wherein R5 can be —H or alkyl; R6 and R7 are independently —H, alkyl, heteroalkyl, aryl, or heteroaryl; and R′ is H or alkyl; or a pharmaceutically acceptable salt or hydrate thereof.

  本发明涉及用于抑制Shp2的方法和化合物。在一种实施方式中，本发明的化合物具有如公式I或II所示的化学结构：其中X、Y和Z分别是N或S；R1是环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基，其中任何一种可以选择性地被一个或多个卤素；烷基；杂基；-COOH；-C（R3）3，其中R3可以独立地是-H或卤素；或-OR4，其中R4可以是H、烷基或杂基烷基；R2是烷基、烷基羰基、杂基烷基羰基、芳基、芳基羰基、杂环烷基羰基、环烷基羰基或-C（O）NR6R7，其中任何一种可以选择性地被一个或多个卤素；烷基；杂基；羰基；-OR4，其中R4可以是-H、烷基或杂基烷基；-OH；-C（R3）3，其中R3可以独立地是-H或卤素；芳基，可以被一个或多个卤素或-OR4取代；杂环烷基；或-C（O）OR5，其中R5可以是-H或烷基；R6和R7独立地是-H、烷基、杂基烷基、芳基或杂芳基；R′是H或烷基；或其药学上可接受的盐或水合物。
• Rational Design of an Indolebutanoic Acid Derivative as a Novel Aldose Reductase Inhibitor Based on Docking and 3D QSAR Studies of Phenethylamine Derivatives
  作者：Won Suck Sun、Yoon Sun Park、Jakyung Yoo、Ki Duk Park、Sung Han Kim、Jung-Han Kim、Hyun-Ju Park

  DOI：10.1021/jm0205346

  日期：2003.12.1

  A series of 45 phenethylamine derivatives were synthesized and evaluated for their inhibitory activity against pig kidney aldose reductase (ALR2, EC 1.1.1.21). Their IC50 values ranged from 400 muM to 24 muM. The binding modes of compounds at the active site of ALR2 were examined using flexible docking. The results indicated that phenethylamine derivatives nicely fit into the active pocket of ALR2 by forming various hydrogen bonding and hydrophobic interactions. 3D-QSAR analysis was also conducted using FlexX-docked alignment of the compounds. The best prediction was obtained by CoMSIA combined with hydrophobic and hydrogen bond donor/acceptor field (q(2) = 0.557, r(2) = 0.934). A new derivative, 4-oxo-4-(4-hydroxyindole)butanoic acid, was designed, taking into account the CoMSIA field and the binding mode derived by FlexX docking. This rationally designed compound exhibits an ALR2 inhibition with an IC50 value of 7.4 muM, which compares favorably to that of a well-known ALR2 inhibitor, tolrestat (IC50 = 16 muM) and represents a potency approximately 240-fold higher than that of an original phenethylamine lead compound, YUA001.