(5Z)-7-<(1R*,2S*,3S*,4S*)-3-phenylsulphonylaminobicyclo<2.2.1>-hept-2-yl>hept-5-enoic acid | 115266-92-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (5Z)-7-<(1R*,2S*,3S*,4S*)-3-phenylsulphonylaminobicyclo<2.2.1>-hept-2-yl>hept-5-enoic acid
• 英文别名: (5Z)-7-<3-endo-<(phenylsulfonyl)amino>bicyclo<2.2.1>hept-2-exo-yl>heptenoic acid；(5Z)-7-<3-endo-<(benzenesulfonamido)-bicyclo<2.2.1>heptyl>>hept-5-enoic acid；(Z)-7-[(1S,2R,3R,4R)-3-(benzenesulfonamido)-2-bicyclo[2.2.1]heptanyl]hept-5-enoic acid
• CAS: 115266-92-7
• 化学式: C₂₀H₂₇NO₄S
• 分子量: 377.505
• InChiKey: PWTCIBWRMQFJBC-BRVXPNRLSA-N

物化性质

• 熔点：
  85-86°

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  91.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (5Z)-7-<(1R*,2S*,3S*,4S*)-3-phenylsulphonylaminobicyclo<2.2.1>-hept-2-yl>hept-5-enoic acid 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 盐5-庚烯酸,7-[(1R,2S,3S,4S)-3-[(苯磺酰)氨基]二环[2.2.1]庚-2-基]-,单钠,(5Z)-rel-
  参考文献：
  名称：

  新型血栓烷受体拮抗剂（+/-）-（5Z）-7- [3-内-[（苯磺酰基）氨基]双环[2.2.1]庚-2-外-的各种衍生物的合成及体外活性yl]庚烯酸。

  摘要：

  通过其甲基合成了（+/-）-（5Z）-7-（3-endo-aminobicyclo [2.2.1] hept-2-exo-yl）庚烯酸（VI）的几种磺酰基衍生物（13a-t）酯10。用11a-t磺化10，然后皂化，得到13a-t。用大鼠洗涤的血小板（WP）和兔富含血小板的血浆（PRP）测量相应的钠盐14a-t对血小板聚集的抑制浓度（IC50）。还测量了某些衍生物对大鼠主动脉收缩的IC50值。对于带有芳基磺酰基残基的衍生物，大鼠WP的IC50值从2.9 nM依次增加到14n，14c，14d和14b，具体取决于中间亚甲基的数量。甲基衍生物14e表现出比正己基衍生物14f更高的IC 50值。用对甲基，对氟-，或14a中的对氯基保留或略微降低其IC50值，而pn-戊基或对氧羰基则显着提高其IC50值。代表性的14a抑制（15S）-15-羟基-11,9-（环氧甲氧基）prosta-5（Z），13（E

  DOI：

  10.1021/jm00117a028
• 作为产物：
  描述：

  4-羧丁基三苯基溴化膦 在 氢氧化钾 、 dimsylsodium 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 (5Z)-7-<(1R*,2S*,3S*,4S*)-3-phenylsulphonylaminobicyclo<2.2.1>-hept-2-yl>hept-5-enoic acid
  参考文献：
  名称：

  新型血栓烷受体拮抗剂（+/-）-（5Z）-7- [3-内-[（苯磺酰基）氨基]双环[2.2.1]庚-2-外-的各种衍生物的合成及体外活性yl]庚烯酸。

  摘要：

  通过其甲基合成了（+/-）-（5Z）-7-（3-endo-aminobicyclo [2.2.1] hept-2-exo-yl）庚烯酸（VI）的几种磺酰基衍生物（13a-t）酯10。用11a-t磺化10，然后皂化，得到13a-t。用大鼠洗涤的血小板（WP）和兔富含血小板的血浆（PRP）测量相应的钠盐14a-t对血小板聚集的抑制浓度（IC50）。还测量了某些衍生物对大鼠主动脉收缩的IC50值。对于带有芳基磺酰基残基的衍生物，大鼠WP的IC50值从2.9 nM依次增加到14n，14c，14d和14b，具体取决于中间亚甲基的数量。甲基衍生物14e表现出比正己基衍生物14f更高的IC 50值。用对甲基，对氟-，或14a中的对氯基保留或略微降低其IC50值，而pn-戊基或对氧羰基则显着提高其IC50值。代表性的14a抑制（15S）-15-羟基-11,9-（环氧甲氧基）prosta-5（Z），13（E

  DOI：

  10.1021/jm00117a028

文献信息

• METHOD FOR PREDICTING ACTIVATION ENERGY USING AN ATOMIC FINGERPRINT DESCRIPTOR OR AN ATOMIC DESCRIPTOR
  申请人：Bioinformatics&Molecular Design Research Center

  公开号：EP2354987A2

  公开（公告）日：2011-08-10

  The present invention provides a method for constructing a database of atomic fingerprint descriptors. The invention provides a method for predicting activation energy using an atomic fingerprint descriptor and an atomic descriptor, the method comprising the steps of: (i) calculating the atomic fingerprint descriptor of a substrate; (ii) comparing the calculated atomic fingerprint descriptor with the constructed atomic fingerprint descriptor database to select an atomic position where cytochrome P450-mediated metabolism occurs; and (iii) predicting activation energy for the selected atomic position using an atomic descriptor. Also, the invention provides a method of predicting the activation energy of CYP450-mediated phase I metabolism using effective atomic descriptors. Specifically, the invention provides a method of predicting the activation energy either for cytochrome P450-mediated hydrogen abstraction or for tetrahedral intermediate formation in cytochrome P450-aromatic hydroxylation using equations including effective atomic descriptors. The method of the invention can rapidly predict activation energy for phase I metabolites at a practical level without having to perform a docking experiment between any additional CYP450 and the substrate, or a quantum mechanical calculation, thereby making it easier to develop new drugs using a computer. Also, the present invention may propose a strategy for increasing the bioavailability of drugs through the avoidance of metabolites based on the possibility of drug metabolism. Furthermore, the method of the present invention proposes new empirical approaches which can also be easily applied to activation energies for various chemical reactions, and makes it possible to explain physical and chemical factors that determine activation energy. In addition, through the prediction of activation energy according to the present invention, it is possible to predict i) metabolic products, ii) the relative rate of metabolism, iii) metabolic regioselectivity, iv) metabolic inhibition, v) drug-drug interactions, and vi) the toxicity of a metabolite.

  本发明提供了一种构建原子指纹描述符数据库的方法。本发明提供了一种使用原子指纹描述符和原子描述符预测活化能的方法，该方法包括以下步骤：(i) 计算底物的原子指纹描述符；(ii) 将计算的原子指纹描述符与构建的原子指纹描述符数据库进行比较，以选择细胞色素 P450 介导的代谢发生的原子位置；以及 (iii) 使用原子描述符预测所选原子位置的活化能。此外，本发明还提供了一种利用有效原子描述符预测 CYP450 介导的 I 期代谢活化能的方法。具体来说，本发明提供了一种利用包括有效原子描述符的方程预测细胞色素 P450 介导的氢抽取活化能或细胞色素 P450 芳烃羟化四面体中间体形成活化能的方法。本发明的方法可以在实用水平上快速预测 I 期代谢物的活化能，而无需在任何额外的 CYP450 和底物之间进行对接实验，也无需进行量子力学计算，从而使使用计算机开发新药物变得更加容易。同时，本发明还可以根据药物代谢的可能性，提出一种通过避免代谢物来提高药物生物利用度的策略。此外，本发明的方法提出了新的经验方法，也可以很容易地应用于各种化学反应的活化能，并使解释决定活化能的物理和化学因素成为可能。此外，根据本发明预测活化能，还可以预测 i) 代谢产物；ii) 代谢的相对速率；iii) 代谢的区域选择性；iv) 代谢抑制；v) 药物与药物之间的相互作用；以及 vi) 代谢产物的毒性。
• NARISADA, MASAYUKI;OTANI, MITSUAKI;VATANABEH, FUMIXIKO;XAGISITA, SANDZI;S+
  作者：NARISADA, MASAYUKI、OTANI, MITSUAKI、VATANABEH, FUMIXIKO、XAGISITA, SANDZI、S+

  DOI：——

  日期：——
• NARISADA, MASAYUKI;OHTAM, MITSUAKI;WATANABE, FUMIHIKO;HAGISHITA, SANJI;SE+
  作者：NARISADA, MASAYUKI、OHTAM, MITSUAKI、WATANABE, FUMIHIKO、HAGISHITA, SANJI、SE+

  DOI：——

  日期：——
• [EN] METHOD FOR PREDICTING ACTIVATION ENERGY USING AN ATOMIC FINGERPRINT DESCRIPTOR OR AN ATOMIC DESCRIPTOR<br/>[FR] PROCÉDÉ DE PRÉDICTION D'ÉNERGIE D'ACTIVATION AU MOYEN D'UN DESCRIPTEUR D'EMPREINTE ATOMIQUE OU D'UN DESCRIPTEUR ATOMIQUE
  申请人：BIOINFORMATICS & MOLECULAR DES

  公开号：WO2010056053A2

  公开（公告）日：2010-05-20

  본 발명은 원자 지문 표현자의 데이터베이스를 구축하는 방법을 제공한다. 또한, (i) 기질의 원자 지문 표현자(atomic fingerprint descriptor)를 계산하는 단계; (ii) 상기 방법으로 구축된 데이터와 비교하여 사이토크롬 P450 효소에 의한 대사반응이 가능한 원자 위치를 선별하는 단계; 및 (iii) 선별한 원자 위치에 대하여 원자 표현자(atomic descriptor)를 이용하여 활성화 에너지를 예측하는 단계를 포함하는, 원자 지문 표현자 및 원자 표현자를 이용하여 활성화 에너지를 예측하는 방법을 제공한다. 또한, 본 발명은 효과적인 원자 표현자를 이용하여 CYP450 효소에 의해 이뤄지는 1단계(phase I) 대사의 활성화에너지를 예측하는 방법을 제공한다. 구체적으로, 본 발명은 효과적인 원자 표현자를 포함한 방정식을 이용하여 사이토크롬 P450 효소에 의한 수소분리반응 또는 방향족 수산화반응의 4면체 중간체 형성의 활성화에너지를 예측하는 방법을 제공한다. 본 발명의 방법은 어떤 추가적인 CYP450과 기질의 도킹실험이나 양자역학적 계산이 없이 실용적 수준으로까지 1 단계(Phase I) 대사체들에 대해 빠르게 예측해 줌으로서 컴퓨터를 이용한 신약개발을 훨씬 더 용이하게 하고, 약물의 대사반응가능성 분석을 통한 대사체 회피설계를 통하여 약물의 생체이용률(bioavailability)를 증가시키는데 전략을 제시할 수 있다. 또한, 본 발명의 활성화 에너지 예측을 통하여 i) 대사 산물, ii) 대사의 상대적인 속도, iii) 대사의 위치선택성, iv) 대사의 저해, v) 약물 간 상호작용, 및 vi) 대사체의 독성을 예측할 수 있다.