酶促
异戊二烯和糖基转移看似无关的反应,可产生具有不同
生物学功能的分子和蛋白质修饰。然而,这两个反应都使用二
磷酸盐活化的供体,并且每个反应都通过阳离子物质进行:分别是烯丙基阳离子和氧碳鎓离子。在这项研究中,我们通过制备缬草醚作为能够稳定烯丙基而不是氧碳鎓阳离子的糖苷模拟物来探索这些过程之间的关系。发现芳基糖苷及其类似的缬草醚自发
水解的速率常数几乎相同,相应的活化焓和熵也是如此。这种密切的相似性扩展到相关的次级动力学同位素效应 (KIE),表明非常相似的过渡态稳定性和结构。筛选包含 100 多种 β-
葡萄糖苷酶的文库,确定了许多可催化这些缬草醚
水解的酶,kcat 值高达 20 s-1。对这样一种酶的详细分析表明,醚
水解通过与糖苷类似的机制以及非常相似的过渡态发生。这表明
环醇醚的酶促裂解率通常较低反映了这些酶对糖苷的进化专业化,而不是固有的反应性差异。对这样一种酶的详细分析表明,醚
水解通过与糖苷