phenyl 2-azido-3-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-galactopyranoside | 370554-13-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 英文名称: phenyl 2-azido-3-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: phenyl 2-azido-2-deoxy-3-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-galactopyranoside；(2S,4aR,6S,7R,8R,8aR)-7-azido-2-phenyl-8-phenylmethoxy-6-phenylsulfanyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxine
• CAS: 370554-13-5
• 化学式: C₂₆H₂₅N₃O₄S
• 分子量: 475.568
• InChiKey: GYANYTDSBUXYFW-YKMXEGFISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  76.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phenyl 2-azido-3-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-galactopyranoside 在 硼烷四氢呋喃络合物 、 三氟甲磺酸 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氟化氢吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 7.33h， 生成
  参考文献：
  名称：

  鲍曼不动杆菌 D78 荚膜多糖全 1,2-顺式连接重复单元的全合成

  摘要：

  化学合成努力已导致从鲍曼不动杆菌KL4 相关荚膜多糖制备指定的四糖重复亚基。依赖于 1,2-顺式- 选择性 [2+2] 糖基化以产生完全受保护的四糖的收敛合成策略是该合成成功的关键。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.2c01034
• 作为产物：
  描述：

  phenyl 3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-1-thiol-D-galactopyranoside 在 sodium methylate 、 sodium hydride 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 124.5h， 生成 phenyl 2-azido-3-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-1-thio-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  肺炎链球菌脂蛋白酸重复单元的合成

  摘要：

  肺炎链球菌的脂磷壁酸重复单元是复杂的假五糖（3）。它由一个核糖磷酸酯，一个2-乙酰氨基-4-氨基-2,4,6-三苯氧基-半乳糖，一个葡萄糖和两个半乳糖胺残基组成，每个残基都不同地连接，但都在6位带有一个磷酸胆碱取代基。设计了用于有效和非对映控制的连接的嵌段（6 – 10），从而在完全脱保护后提供了高纯度的目标分子。生物学测试表明，缺少脂质部分的重复单元3不会刺激人类单核细胞（hMNCs）的促炎反应。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2011.11.088

文献信息

• METHOD OF SYNTHESIZING SUGAR CHAIN
  申请人：MITSUBISHI CHEMICAL CORPORATION

  公开号：EP1640379A1

  公开（公告）日：2006-03-29

  An object of the present invention is to provide a method for efficiently chemically synthesizing biomolecules including a nucleotide (nucleic acid), a peptide (protein), or a sugar chain, as representative examples. The present invention provides a method of solid-phase synthesis of sugar chain(s) for synthesizing multiple types of sugar chains in at least one sugar chain synthesis reaction system comprising multiple types of monosaccharide units, which is characterized in that it comprises changing the temperature in the sugar chain synthesis reaction system depending on the temperature rising rate that has been determined based on a decrease in side reaction(s) in the reaction system as an indicator.

  本发明的目的是提供一种有效地化学合成生物分子的方法，包括核苷酸（核酸）、肽（蛋白质）或糖链等代表性示例。本发明提供了一种固相合成糖链的方法，用于在至少一个糖链合成反应系统中合成多种类型的糖链，其特征在于根据已确定的反应系统中副反应减少的指标，改变糖链合成反应系统中的温度上升速率。
• Convergent Total Syntheses of Oligosaccharides by One-Pot Sequential Stereoselective Glycosylations
  作者：Takashi Hashihayata、Kazuhiro Ikegai、Kazuya Takeuchi、Hideki Jona、Teruaki Mukaiyama

  DOI：10.1246/bcsj.76.1829

  日期：2003.9

  amino acid 7 with thioglycoside 6 was successfully carried out by combining trityl trifluoromethanesulfonate (TrOTf) and N-iodosuccimide (NIS) which gave glycosyl amino acid 21 in high yield (97%, α/β = 83⁄17). Next, the glycosylation of thioglycoside 4 with galactosyl phenyl carbonate 2 or fluoride 3 was tried by the promotion of trityl tetrakis(pentafluorophenyl)borate [TrB(C6F5)4] or trifluoromethanesulfonic

  F1α 抗原是肿瘤相关 O 联粘蛋白糖基氨基酸的一个成员，通过一锅序贯糖基化进行了会聚全合成。通过结合三氟甲磺酸三苯甲基酯 (TrOTf) 和 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 成功地进行了氨基酸 7 与硫糖苷 6 的高度 α 选择性糖基化，以高产率 (97%, α/β = 83⁄17) 得到糖基氨基酸 21 ）。接下来，通过三苯甲基四(五氟苯基)硼酸酯[TrB(C6F5)4]或三氟甲磺酸(TfOH)的促进，尝试了硫代糖苷4与半乳糖苯基碳酸酯2或氟化物3的糖基化；通过进一步添加糖基氨基酸 5 和 NIS，分别以 80% 或 89% 的总产率提供受保护的 F1α 25。去除保护基团后以高产率获得所需的三糖。下一个，
• A Convergent Total Synthesis of the Mucin Related F1<i>α</i>Antigen by One-Pot Sequential Stereoselective Glycosylation
  作者：Teruaki Mukaiyama、Kazuhiro Ikegai、Hideki Jona、Takashi Hashihayata、Kazuya Takeuchi

  DOI：10.1246/cl.2001.840

  日期：2001.8

  A convergent total synthesis of F1α antigen, a member of the tumor-associated O-linked mucin glycosyl amino acids, was accomplished by one-pot sequential glycosylation. In the first step, the corresponding disaccharide was formed from galactosyl phenylcarbonate 2 or fluoride 3 and thioglycoside 4 by the promotion of TrB(C6F5)4 or TfOH, and following glycosylation of glycosyl amino acid 5 by further

  F1α 抗原是肿瘤相关 O 联粘蛋白糖基氨基酸的一个成员，通过一锅顺序糖基化完成了会聚全合成。在第一步中，通过 TrB(C6F5)4 或 TfOH 的促进，由半乳糖基苯基碳酸酯 2 或氟化物 3 和硫糖苷 4 形成相应的二糖，然后通过进一步添加 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 使糖基氨基酸 5 糖基化分别以 80% 或 89% 的总产率提供受保护的 F1α。通过随后的去保护，F1α抗原以良好的产量获得。
• Probing the Influence of a 4,6-<i>O</i>-Acetal on the Reactivity of Galactopyranosyl Donors: Verification of the Disarming Influence of the <i>trans–gauche</i> Conformation of C5–C6 Bonds
  作者：Myriame Moumé-Pymbock、Takayuki Furukawa、Sujit Mondal、David Crich

  DOI：10.1021/ja405588x

  日期：2013.9.25

  6-O-alkylidene acetal on the rate of acid-catalyzed hydrolysis of methyl galactopyranosides and of spontaneous hydrolysis of 2,4-dinitrophenyl galactopyranosides has been studied through the synthesis and hydrolysis of analogs in which O6 is replaced by a methoxymethylene unit in which the methoxy group adopts either an equatorial or an axial position according to the configuration. Consistent with

  4,6-O-亚烷基缩醛对甲基吡喃半乳糖苷酸催化水解和 2,4-二硝基苯基吡喃半乳糖苷自发水解速率的影响已通过类似物的合成和水解进行研究，其中 O6 被替换为甲氧基亚甲基单元，其中甲氧基根据构型采用赤道或轴向位置。与早期在酸催化和自发水解条件下的研究一致，亚烷基缩醛或其 7-carba 类似物相对于缺乏环状保护基团的类似系统延迟水解。7-carba 类似物中 C6 的构型不影响酸催化水解的速率，但对 2,4-二硝基苯基半乳糖苷的自发水解速率影响很小，证实了早期关于羟甲基构象对糖苷反应性所起作用的研究。发现亚苄基缩醛相对于单环类似物稳定吡喃半乳糖衍生物的α-端基异构体。讨论了在 O2 处带有相邻基团活性保护基团的 4,6-O-亚苄基保护的吡喃半乳糖供体的 α 选择性的原因。
• Total Synthesis of Trisaccharide Repeating Unit of <i>Staphylococcus aureus</i> Strain M
  作者：Archana A. Shirsat、Diksha Rai、Balasaheb K. Ghotekar、Suvarn S. Kulkarni

  DOI：10.1021/acs.orglett.3c00997

  日期：2023.4.28

  An efficient total synthesis of a conjugation-ready trisaccharide repeating unit of Staphylococcus aureus strain M is reported here. The main challenges involved in this synthesis are the procurement of rare sugars (d-FucNAc and d-GalNAcA) and installation of consecutive 1,2-cis-glycosidic linkages between them. Stereoselective 1,2-cis glycosylation with the linker acceptor was achieved with easily

  此处报道了金黄色葡萄球菌菌株 M的可结合三糖重复单元的有效全合成。该合成中涉及的主要挑战是稀有糖（ d -FucNAc 和d -GalNAcA）的采购以及它们之间连续的 1,2-顺式-糖苷键的安装。通过采用 DMF 调节的预激活糖基化方法，使用容易获得的亚苄基保护的d-半乳糖胺硫代糖苷实现了与接头受体的立体选择性1,2-顺式糖基化。连续的 1,2-顺式在溶剂参与的帮助下建立了联系。羧酸功能是通过二糖基团上的糖基化后氧化引入的。三糖重复单元的全合成以最长的24步线性序列完成，总收率为4.5%。