8-[acetyl(9H-fluoren-2-yl)amino]-3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine | 1009639-13-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 8-[acetyl(9H-fluoren-2-yl)amino]-3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: 8-[acetyl(2-fluorenyl)amino]-3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine
• CAS: 1009639-13-7
• 化学式: C₃₇H₅₂N₆O₅Si₂
• 分子量: 717.028
• InChiKey: MPFQHNWHVOGORR-FRXPANAUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.66
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.51
• 拓扑面积：
  137.59
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-[acetyl(9H-fluoren-2-yl)amino]-3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine 在 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以94%的产率得到N-[2-氨基-9-[(4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]-6-氧代-3H-嘌呤-8-基]-N-(9H-芴-2-基)乙酰胺
  参考文献：
  名称：

  8-(乙酰芳基氨基)-2'-脱氧鸟苷加合物合成位点特异性受损DNA链及其对各种DNA聚合酶的影响

  摘要：

  除了主要发现的 8-（芳基氨基）-2'-dG 外，DNA 链中的 8-（乙酰基芳基氨基）损伤也可能在化学致癌作用的诱导中起重要作用。使用不同芳香胺生成这些 8-(乙酰芳基氨基)-dG 加合物的合成途径已得到优化。8 种修饰的 dG 被转化为相应的亚磷酰胺，并在位点特异性地整合到不同的寡核苷酸中，从而形成 DNA 链。这些受损 DNA 链与互补寡核苷酸的带有损伤的杂交体被用来研究它们的熔解特性和它们的圆二色光谱。结果表明，切割位点内的损伤没有发生 EcoRI 限制。最后，三种不同的 DNA 聚合酶用于引物延伸研究。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201200984
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine 在 caesium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙二醇二甲醚 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 8-[acetyl(9H-fluoren-2-yl)amino]-3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  8-(乙酰芳基氨基)-2'-脱氧鸟苷加合物合成位点特异性受损DNA链及其对各种DNA聚合酶的影响

  摘要：

  除了主要发现的 8-（芳基氨基）-2'-dG 外，DNA 链中的 8-（乙酰基芳基氨基）损伤也可能在化学致癌作用的诱导中起重要作用。使用不同芳香胺生成这些 8-(乙酰芳基氨基)-dG 加合物的合成途径已得到优化。8 种修饰的 dG 被转化为相应的亚磷酰胺，并在位点特异性地整合到不同的寡核苷酸中，从而形成 DNA 链。这些受损 DNA 链与互补寡核苷酸的带有损伤的杂交体被用来研究它们的熔解特性和它们的圆二色光谱。结果表明，切割位点内的损伤没有发生 EcoRI 限制。最后，三种不同的 DNA 聚合酶用于引物延伸研究。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201200984

文献信息

• A New Short and Efficient Synthetic Route to C8-<i>N</i>-Acetylarylamine 2′-Deoxyguanosine Phosphoramidites
  作者：Chris Meier、Nicolas Böge、Sarah Krüger、Marcus Schröder

  DOI：10.1055/s-2007-990913

  日期：2007.12

  In addition to their C8-NH-arylamine-dG counterparts, C8-N-acetylarylamine adducts of 2′-deoxyguanosine (2′-dG) play an important role in the possible induction of chemical carcinogenesis. A new synthetic pathway of this adduct type using different aromatic amines has been developed following most probably an electrophilic amination reaction. These adducts can be converted into the corresponding phosphoramidites for incorporation into oligonucleotides.

  除了 C8-NH-arylamine-dG 对应物外，2′-脱氧鸟苷（2′-dG）的 C8-N-acetylarylamine 加合物在可能诱发化学致癌方面也发挥着重要作用。利用不同的芳香胺，很可能是通过亲电胺化反应，开发出了这种加合物类型的新合成途径。这些加合物可转化为相应的磷酰胺，用于掺入寡核苷酸中。