2-amino-6-O-(p-toluenesulfonyl)-9-[2-deoxy-3,5-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl]purine | 177533-37-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2-amino-6-O-(p-toluenesulfonyl)-9-[2-deoxy-3,5-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl]purine
• 英文别名: 3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O⁶-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-2'-deoxyguanosine；6-O-tosyl-3',5'-di-O-tert-butyldimethylsilyl-deoxyguanosine；[2-amino-9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl] 4-methylbenzenesulfonate
• CAS: 177533-37-8
• 化学式: C₂₉H₄₇N₅O₆SSi₂
• 分子量: 649.959
• InChiKey: QIUKQUCCZADOGA-YTFSRNRJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.18
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-amino-6-O-(p-toluenesulfonyl)-9-[2-deoxy-3,5-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl]purine 在 吡啶 、 ammonium hydroxide 、 四(三苯基膦)钯 、 四丁基氟化铵 、 1-羟基苯并三唑 、 lithium chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.67h， 生成 2-N-phenoxyacetyl 2-amino-6-(2-thiazolyl)-9-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)purine
  参考文献：
  名称：

  碱基对扩展转录系统的有效非自然碱基对

  摘要：

  为了通过转录将人工成分定点掺入 RNA，在 2-amino-6-(2-thiazolyl)purine（表示为 v）和 2-oxo(1H)pyridine（表示为 y ） 已开发。y 和 5 取代 y 的底物通过 T7 RNA 聚合酶在模板中与 v 相对地位点特异性地整合到 RNA 中。vy 配对在转录中的效率和保真度与天然 AT(U) 和 GC 配对一样高。此外，含有两个相邻 y 碱基的 RNA 也从含有两个 v 碱基的 DNA 模板转录而来。这种特定的转录允许大规模制备人工 RNA，并且可以与其他系统结合以同时将几种不同的成分整合到转录物中。

  DOI：

  10.1021/ja0425280
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧鸟苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 2-amino-6-O-(p-toluenesulfonyl)-9-[2-deoxy-3,5-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl]purine
  参考文献：
  名称：

  碱基对扩展转录系统的有效非自然碱基对

  摘要：

  为了通过转录将人工成分定点掺入 RNA，在 2-amino-6-(2-thiazolyl)purine（表示为 v）和 2-oxo(1H)pyridine（表示为 y ） 已开发。y 和 5 取代 y 的底物通过 T7 RNA 聚合酶在模板中与 v 相对地位点特异性地整合到 RNA 中。vy 配对在转录中的效率和保真度与天然 AT(U) 和 GC 配对一样高。此外，含有两个相邻 y 碱基的 RNA 也从含有两个 v 碱基的 DNA 模板转录而来。这种特定的转录允许大规模制备人工 RNA，并且可以与其他系统结合以同时将几种不同的成分整合到转录物中。

  DOI：

  10.1021/ja0425280

文献信息

• Influence of Biaryl Phosphine Structure on C−N and C−C Bond Formation
  作者：Ramendra Pratap、Damon Parrish、Padmaja Gunda、D. Venkataraman、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/ja902679b

  日期：2009.9.2

  phosphine ligands affect Pd-catalyzed C-N and C-C bond-forming reactions, a new ligand, 2-(dicyclohexylphosphino)-4'-(N,N-dimethylamino)-1,1'-biphenyl, was synthesized. This compound is isomeric with the commercially available 2-(dicyclohexylphosphino)-2'-(N,N-dimethylamino)-1,1'-biphenyl that has been useful in C-N bond-forming reactions of nucleosides. The new p-dimethylamino biphenyl ligand bears

  为了了解联苯膦配体的电子和其他结构特征如何影响 Pd 催化的 CN 和 CC 键形成反应，一种新的配体，2-(二环己基膦)-4'-(N,N-二甲氨基)-1,1 '-联苯，合成。该化合物与市售的 2-(二环己基膦基)-2'-(N,N-二甲氨基)-1,1'-联苯异构，后者已用于核苷的 CN 键形成反应。新的对二甲氨基联苯配体与邻二甲氨基异构体具有电子相似性，但它也具有与 2-（二环己基膦基）联苯的结构相似性，例如非膦环中未取代的邻位。而 2-（二环己基膦基）联苯可以支持形成 CC 键的催化剂，它不能有效地促进核苷底物的芳基胺化。然而，新的配体被证明可以有效地促进核苷底物的芳基胺化和 CC 键形成反应，一些反应甚至在室温下发生。因此，这种新配体的复合结构元素被认为是由它衍生的催化系统反应性的标准。我们已经通过 X 射线晶体学分析探测了异构 N，N-二甲氨基联苯配体的结构。已通过 (31) P 核磁共振研究了两种配体与
• Facile Cu-free Sonogashira cross-coupling of nucleoside C-6 arylsulfonates with terminal alkynes
  作者：Felix N. Ngassa、Jamie M. Gomez、Brandon E. Haines、Michael J. Ostach、Jared W. Hector、Lindsay J. Hoogenboom、Chelsea E. Page

  DOI：10.1016/j.tet.2010.08.032

  日期：2010.10

  The combination of PdCl2[CH3CN]2 with XPhos is an efficient catalytic system for the Sonogashira-type cross-coupling of 2′-deoxyguanosine O6-arylsulfonates with terminal alkynes. The reactions generally proceed under mild conditions requiring no Cu co-catalyst to give the corresponding C-6-alkynylated deoxynucleosides in moderate to good yields.

  PdCl 2 [CH 3 CN] 2与XPhos的结合是2'-脱氧鸟苷O 6-芳基磺酸盐与末端炔烃的Sonogashira型交叉偶联的有效催化体系。反应通常在温和的条件下进行，不需要Cu助催化剂以中等至良好的产率得到相应的C-6-炔基化的脱氧核苷。
• Mild and Room Temperature C−C Bond Forming Reactions of Nucleoside C-6 Arylsulfonates
  作者：Mahesh K. Lakshman、Padmaja Gunda、Padmanava Pradhan

  DOI：10.1021/jo0513764

  日期：2005.12.1

  Palladium catalyzed cross coupling of nucleoside arylsulfonates and arylboronic acids has been accomplished under mild conditions and at room temperature. Among three structurally similar ligands that differ in their steric and electronic properties, one yielded an effective catalyst in conjunction with Pd(OAc)2. Of the nucleoside arylsulfonates evaluated, the O6-(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonate proved

  钯催化的核苷芳基磺酸盐和芳基硼酸的交叉偶联已在温和条件和室温下完成。在三种结构相似，空间和电子性质不同的配体中，一个配体与Pd（OAc）2结合产生了一种有效的催化剂。在所评估的核苷芳基磺酸盐中，O 6-（2,4,6-三甲基苯基）磺酸盐被证明是最佳的，但其他烷基和烷氧基衍生物也具有合理的反应性。另一方面，2-硝基苯基和2-噻吩基衍生物是无效的底物。PhMe和THP适合用作溶剂，尽管在PhMe中某些芳基硼酸的反应更快，但在某些情况下仍能获得良好的结果。相反，带有强吸电子基团的芳基硼酸的反应在THP中更成功地进行。包括核苷芳基磺酸盐上的取代基，配体取代基和溶剂在内的几种因素之间的相互作用是成功进行交叉偶联的原因。使用31 P NMR进行了初步研究，以研究Pd（OAc）2的相互作用与配体。在配体和Pd（OAc）2的化学计量比为1：1的情况下，获得了主要物质，可能是环palpalladation的产
• Efficient Synthesis of 6-Substituted Purine Derivatives Using Pd-Catalyzed Cross-Coupling Reactions with 2’-Deoxyguanosine O6-Tosylate
  作者：Fumi Nagatsugi、Yuki Ogata、Shuhei Imoto、Shigeki Sasaki

  DOI：10.3987/com-07-s(u)24

  日期：——

  6-Substituted purine analogs function in a variety of biological activities including antiviral pathways. A number of studies have reported on the development of the efficient synthesis of these nucleoside analogs. We previously demonstrated that oligonucleotides containing 2-amino-6-vinylpurine derivatives react with the cytosine at the target site with extreme selectivity. This was the first finding

  6-取代的嘌呤类似物在包括抗病毒途径在内的多种生物活性中起作用。许多研究报告了这些核苷类似物的有效合成的发展。我们之前证明了含有 2-氨基-6-乙烯基嘌呤衍生物的寡核苷酸与靶位点的胞嘧啶反应具有极高的选择性。这是鸟苷的O 6 -甲苯磺酸酯衍生物作为Pd(0)催化的与乙烯基三丁基锡烷的交叉偶联反应产生2-氨基-6-乙烯基嘌呤的有效底物的第一个发现。为了证明甲苯磺酸盐前体的有用性，在本研究中，我们研究了过渡金属催化剂和配体在使用硼酸或格氏试剂作为偶联伙伴来实现交叉偶联反应中。
• 2-Aminopurine derivatives with C6-substituted olefin as novel cross-linking agents and the synthesis of the corresponding β-phosphoramidite precursors
  作者：Fumi Nagatsugi、Kengo Uemura、Shouji Nakashima、Minoru Maeda、Shigeki Sasaki

  DOI：10.1016/s0040-4020(97)00069-0

  日期：1997.3

  The 6-vinylated 2-aminopurine nucleoside (1), which was prepared by the Pd(0)-catalyzed cross-coupling reaction using guanosine 6-O-tosylate and vinyl-tributylstannane, has been demonstrated as a potential cross-linking agent. However, attempts for its incorporation into oligonucleotides were unsuccessful because of the high reactivity toward nucleophiles. In this study, new 2'-deoxy nucleoside derivatives with 6-(2-substituted vinyl)-2-aminopurine were designed to diminish the reactivity of the vinyl group. These new nucleosides have been shown to maintain reactivity toward potent nucleophiles such as butylamine and thiols, suggesting that they would form cross-linking with the target nucleobase due to the proximity within the sense-antisense duplex. Thus, the corresponding beta-phosphoramidite precursors were successfully prepared, and were applied to an automated oligonucletotide synthesizer. (C) 1997 Elsevier Science Ltd.