(3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-Dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde | 27999-65-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: (3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-Dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde
• 英文别名: 2',3'-O-isopropylideneuridine 5'-aldehyde；5’-aldehyde-2’,3’-isopropylideneuridine；(3aR,4R,6S,6aS)-4-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-6-carbaldehyde
• CAS: 27999-65-1
• 化学式: C₁₂H₁₄N₂O₆
• 分子量: 282.253
• InChiKey: ULFDPCIPYCEREB-PEBGCTIMSA-N

物化性质

• 密度：
  1.450±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  94.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-Dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde 在 9-borabicyclo[3.3.1]nonane dimer 、 sodium tert-pentoxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 1-(5-deoxy-1,2-O-isopropylidene-β-D-ribo-hexofuranosyl)uracyl
  参考文献：
  名称：

  在选定位置具有酰胺作为尿苷间键的 RNA 类似物的合成和性质

  摘要：

  已合成在选定位置具有酰胺核苷间键（AM1：3'-CH(2)CONH-5' 和 AM2：3'-CH(2)NHCO-5'）的寡核糖核苷酸类似物，并且由这些形成的双链体的热稳定性已通过 UV 熔解实验评估了具有互补 RNA 片段的类似物。研究了两个系列的具有 2'-OH 或 2'-OMe 邻近酰胺键的低聚物。单体合成子（3' 和 5'-C 胺和羧酸）合成如下： 对于 AM1 类似物的合成，采用已知的自由基烯丙基化序列，然后是双键断裂。为了合成 AM2 类似物，开发了通过添加硝基甲烷然后将硝基官能团转化为氨基或羧基的新途径。单体胺和羧酸偶联，然后进行保护基操作和膦酰化，得到用于寡核苷酸合成的二聚体 3'-膦酸结构单元。还制备了具有 3'-酰胺和 2'-OH 或 2'-OMe 基团的单体模型化合物，并通过 (1) H NMR 确定了它们的构象平衡。AM1 和 AM2 模型对北方构象异构体表现出相同的偏好（在

  DOI：

  10.1021/ja0360900
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 硫酸 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成 (3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-Dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  尿苷保护基对尿苷衍生的醛5'-炔基的非对映选择性的影响。

  摘要：

  描述了尿苷衍生的醛的5'-炔基化。炔基格氏试剂在羰基上的添加受到2'，3'-di-O-保护基（R1）的显着影响：O-烷基导致适度的非对映选择性（65:35），有利于5' R-异构体，而O-甲硅烷基则促进了更高的非对映选择性（最高达99：1），有利于5'S-异构体。报道了有关该保护基对非对映选择性的影响的研究。

  DOI：

  10.3762/bjoc.13.153

文献信息

• Development of a Highly β-Selective Ribosylation Reaction without Using Neighboring Group Participation:  Total Synthesis of (+)-Caprazol, a Core Structure of Caprazamycins
  作者：Shinpei Hirano、Satoshi Ichikawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jo701699h

  日期：2007.12.1

  (+)-caprazol are described. The key elements of our approach include the early stage introduction of the aminoribose in a highly β-selective manner, using the steric hindrance in the transition state and the construction of the diazepanone by a modified intramolecular reductive amination. The 5‘-C-glycyluridine derivative 9, which was prepared stereoselectively via Sharpless asymmetric aminohydroxylation,

  描述了（+）-辣椒碱的全合成的全部细节。我们方法的关键要素包括：以过渡型空间位阻，以高度β-选择性的方式早期引入氨基核糖，以及通过修饰的分子内还原胺化作用构建二氮杂酮。经由Sharpless不对称氨基羟基化立体选择性地制备的5'- C-甘氨酰尿苷衍生物9被2,3- O-亚烷基核呋喃糖基供体核糖化。揭示了增加缩醛单元的烷基取代基的尺寸导致改善了端基异构体位置的立体选择性，以及所需的核糖苷21b（1′′-β）和22b。当使用具有更空间位阻的3-亚戊基的核糖基氟化物16时，以80％的收率获得（1′′-α）（21b / 22b＝ 24.0 / 1）。还讨论了核糖基化的立体选择性的起源。使用模型醛37优化了二氮杂酮系统的构建，并通过包括催化加氢然后进行氢化物还原的两步反应序列，以88％的收率获得了所需的二氮杂酮38。将该方法应用于醛44可成功获得二氮杂酮衍生物45和46。，其官能团操作完成了（+）-卡巴唑的全部合成。
• Design, synthesis and biological evaluation of 5′-C-piperidinyl-5′-O-aminoribosyluridines as potential antibacterial agents
  作者：Takeshi Nakaya、Akira Matsuda、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1039/c5ob01037c

  日期：——

  Caprazamycin analogues, which were designed and synthesized via an aza-Prins–Ritter reaction, exhibit a good MraY and antibacterial activity without cytotoxicity against human cells.

  卡普拉霉素类似物是通过一种氮杂Prins-Ritter反应设计和合成的，表现出良好的MraY和抗菌活性，且对人类细胞没有细胞毒性。
• Synthesis of isoxazolidine-containing uridine derivatives as caprazamycin analogues
  作者：Mayumi Yamaguchi、Akira Matsuda、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1039/c4ob02142h

  日期：——

  antibacterial nucleoside natural products, was conducted by scaffold-hopping of the structurally complex diazepanone moiety to the isoxazolidine scaffold. The designed isoxazolidine-containing uridine derivatives were synthesized by an intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition of alkenyl nitrone as a key step. The lactone-fused isoxazolidine intermediate was easily converted to the target compounds by

  通过将结构复杂的二氮杂one酮部分跃迁到异恶唑烷骨架上，简化了有前途的抗菌核苷天然产物辣椒素的简化。通过烯内酮的分子内1，3-偶极环加成反应合成了设计的含异恶唑烷的尿苷衍生物。内酯稠合的异恶唑烷中间体通过亲核取代和亲电子封端所得伯醇使内酯部分开环后，通过依次引入关键取代基，可以轻松地将其转化为目标化合物。几种类似物对流感嗜血杆菌ATCC 10211（MIC 0.25-0.5杯mL（-1））表现出良好的活性，对耐万古霉素的屎肠球菌SR7914（MIC 4-8杯mL（-1））表现出中等的活性。
• Cerium(III) Chloride-Mediated Reactions of Sulfonamide Dianions
  作者：David C. Johnson、Theodore S. Widlanski

  DOI：10.1021/jo034001w

  日期：2003.6.1

  5'-aldehyde, 3'-ketouridine, and 3'-ketothymidine. The reaction was chemoselective for aldehydes in the presence of nitriles. Acetoxy groups are labile and thus not suitable protecting groups for alcohols under these conditions. N-Benzyl-alpha, N-dilithio methanesulfonamide was found to be of sufficient basicity to cause enolate formation with sensitive substrates, such as 1-phenylacetone. However, the

  本文介绍的是氯化铈（III）介导高产量以及通常非对映选择性地将N-苄基-α，N-二硫代甲磺酰胺加到具有重要生物意义的醛和酮中的能力的第一份报告。对碱敏感的底物，例如Fmoc保护的丙氨酸，柠檬醛，5-胆甾烯-3-酮，尿苷5'-醛，3'-酮胍和3'-酮基吡啶，进行平滑添加。在腈存在下，该反应对醛具有化学选择性。乙酰氧基不稳定，因此在这些条件下不适合作为醇的保护基。发现N-苄基-α，N-二硫代甲烷磺酰胺具有足够的碱性，以引起与敏感底物例如1-苯基丙酮的烯醇化物形成。然而，在这些情况下，氯化铈（III）的加入介导了二价阴离子的碱性并抑制了烯醇化物的形成。另外，铈（III）具有将各种N-脂族/芳族甲磺酰胺二价阴离子加到3'-酮胍中的一般用途。
• Pac13 is a Small, Monomeric Dehydratase that Mediates the Formation of the 3′‐Deoxy Nucleoside of Pacidamycins
  作者：Freideriki Michailidou、Chun‐wa Chung、Murray J. B. Brown、Andrew F. Bent、James H. Naismith、William J. Leavens、Sean M. Lynn、Sunil V. Sharma、Rebecca J. M. Goss

  DOI：10.1002/anie.201705639

  日期：2017.10.2

  unusual, small and monomeric dehydratase, Pac13, which catalyses the dehydration of uridine-5'-aldehyde. Here we report the structural characterisation of Pac13 with a series of ligands, and gain insight into the enzyme's mechanism demonstrating that H42 is critical to the enzyme's activity and that the reaction is likely to proceed via an E1cB mechanism. The resemblance of the 3'-deoxy pacidamycin moiety

  帕西霉素 (pacidamycin) 是尿苷肽抗生素 (UPA) 的一员，它具有临床上未开发的作用模式和不寻常的组装方式。也许这些分子最显着的特征是它们共有的生物合成独特的 3'-脱氧尿苷。该部分由一种不寻常的小型单体脱水酶 Pac13 生成，该酶催化尿苷-5'-醛的脱水。在这里，我们报告了 Pac13 与一系列配体的结构表征，并深入了解了该酶的机制，证明 H42 对于该酶的活性至关重要，并且该反应可能通过 E1cB 机制进行。 3'-脱氧帕卡霉素部分与合成抗逆转录病毒药物的相似性，为利用 Pac13 生物催化生成抗病毒化合物提供了潜在机会。