1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracyl-6-yl-(6->7'-C)-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil | 292637-18-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracyl-6-yl-(6->7'-C)-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-dimethyl-6-[(1R)-1-tri(propan-2-yl)silyloxyprop-2-ynyl]-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-6-[(3R)-3-[(3aR,4R,6S,6aR)-4-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]-3-tri(propan-2-yl)silyloxyprop-1-ynyl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 292637-18-4
• 化学式: C₄₆H₇₀N₄O₁₂Si₂
• 分子量: 927.252
• InChiKey: MSDCHAVJOHGPBT-MKYHUYNASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.03
• 重原子数：
  64
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  173
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracyl-6-yl-(6->7'-C)-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil 、 N⁶-benzoyl-9-[6,7-dideoxy-2,3-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-7-C-(trimethylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]-8-iodoadenine 在 tris-(dibenzylideneacetone)dipalladium(0) 、 copper(l) iodide 、 P(fur)3 作用下， 以 三乙胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 24.0h， 以49%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  具有核碱基（包括骨干）的寡核苷。第12部分

  摘要：

  在对比相应的格氏试剂，双[（三甲基甲硅烷基）乙炔基]锌与5'-oxoadenosine反应3非对映选择性的β -D-同种异体-庚-6- ynofuranosyladenine 5。单体炔丙醇5和二聚炔丙醇22的锂化/碘化分别提供了8-碘腺苷7和18，大大缩短了二聚O-甲硅烷基化的8-碘腺苷25的合成。尿苷和腺苷混合的四聚体21和32被合成了。通过线性序列制备四聚体21。Sonogashira的9和13偶联产生了三聚体16，它被C-去甲硅烷基化为17。17和19的第二次Sonogashira偶联产生了四聚体21。通过汇聚路线，将乙炔29和碘化物30偶联，以更高的产率制备四聚体32。尿苷衍生的碘化物被证明比腺苷衍生的类似物和N 6具有更高的反应活性。-未保护的腺苷衍生的炔烃比其N 6-苯甲酰化的类似物更具反应性。

  DOI：

  10.1002/hlca.200490269
• 作为产物：
  描述：

  (3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-Dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 copper(l) iodide 、 tris(dibenzylideneacetone)dipalladium (0) 、 P(fur)3 、 乙基溴化镁 、 水 、 silver nitrate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 三乙胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 93.0h， 生成 1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracyl-6-yl-(6->7'-C)-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-5-O-(triisopropylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  具有包括核碱基的主链的寡核苷，第 1 部分，概念、力场计算以及尿苷衍生单体和二聚体的合成

  摘要：

  一种新型的寡核苷已被设计用于研究具有核碱基骨架的寡核苷形成同源和/或异源双链体的潜力（参见图 2）。它的特征在于尿苷的 C(5') 和 C(6) 之间以及腺苷的 C(5') 和 C(8) 之间的乙炔基连接。力场计算和 Maruzen 模型研究表明，这种寡核苷形成自主配对系统并与 RNA 杂交。我们描述了适合构建寡聚体和二聚体的尿苷衍生单体的合成。用三乙基甲硅烷基乙炔化物处理尿苷-5'-甲醛(2)得到非对映异构炔丙醇6和7(1:2, 80%;方案1)。基于 NOE 实验和 X 射线晶体结构分析确定了它们在 C(5') 处的构型。通过用二异丙基氨基锂 (LDA) 和 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 在 (R) 配置的醇 7 的 C(6) 处碘化，得到碘化物 17 (62%)，其在 O-C(5') 处被甲硅烷基化产生 18 (89%; 方案 2)。在 MeOH/H2O 中用 NaOH 对 7 进行

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1311::aid-hlca1311>3.0.co;2-2

文献信息

• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone. Part 11
  作者：Simon Eppacher、Nathalie Solladié、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200490264

  日期：2004.11

  A linear and a convergent synthesis of uridine-derived backbone-base-dedifferentiated (backbone including) oligonucleotide analogues were compared. The Sonogashira cross-coupling of the alkyne 1 and the iodide 2 gave the dimer 4 that was C-desilylated and again coupled with 2 to give the trimer 6 (Scheme 1). Repeating this linear sequence led to the pentamer 10. Coupling yields were satisfactory up

  比较了尿苷衍生的骨架碱基去分化的（包括骨干）寡核苷酸类似物的线性和收敛的合成。炔烃1和碘化物2的Sonogashira交叉偶联得到C-去甲硅烷基化的二聚体4，并再次与2偶联以得到三聚体6（方案1）。重复该线性序列导致五聚体10。直到三聚体6的形成为止，偶联产率令人满意，但是对于与更高的低聚物偶联则降低。同样，炔烃5、7和9的偶联碘碘3的产率降低，分别得到三聚体12，四聚体13和五聚体14。通过将炔烃17与碘化物16偶联至二聚体18，随后在C（6 / I）至19进行碘化和O-甲硅烷基化来合成二聚碘尿嘧啶20（方案2）。碘化二聚体23是由碘化和制备ö -silylating已知二聚体21。20和23与二聚体5的偶联，三聚体7和四聚体9分别给出四聚体8和13，五聚体10和14以及六聚体15（方案3）。将直到五聚体14的低聚物脱保护以提供三聚体24，四聚体25和五聚体26（方案4）。没有证据表明五聚体26和rA
• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone, Part 1, Concept, Force-Field Calculations, and Synthesis of Uridine-Derived Monomers and Dimers
  作者：Simon Eppacher、Nathalie Solladié、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1311::aid-hlca1311>3.0.co;2-2

  日期：2000.7.5

  A new type of oligonucleosides has been devised to investigate the potential of oligonucleosides with a nucleobase-including backbone to form homo- and/or heteroduplexes (cf. Fig. 2). It is characterised by ethynyl-linkages between C(5′) and C(6) of uridine, and between C(5′) and C(8) of adenosine. Force-field calculations and Maruzen model studies suggest that such oligonucleosides form autonomous

  一种新型的寡核苷已被设计用于研究具有核碱基骨架的寡核苷形成同源和/或异源双链体的潜力（参见图 2）。它的特征在于尿苷的 C(5') 和 C(6) 之间以及腺苷的 C(5') 和 C(8) 之间的乙炔基连接。力场计算和 Maruzen 模型研究表明，这种寡核苷形成自主配对系统并与 RNA 杂交。我们描述了适合构建寡聚体和二聚体的尿苷衍生单体的合成。用三乙基甲硅烷基乙炔化物处理尿苷-5'-甲醛(2)得到非对映异构炔丙醇6和7(1:2, 80%;方案1)。基于 NOE 实验和 X 射线晶体结构分析确定了它们在 C(5') 处的构型。通过用二异丙基氨基锂 (LDA) 和 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 在 (R) 配置的醇 7 的 C(6) 处碘化，得到碘化物 17 (62%)，其在 O-C(5') 处被甲硅烷基化产生 18 (89%; 方案 2)。在 MeOH/H2O 中用 NaOH 对 7 进行
• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone. Part 12
  作者：Simon Eppacher、Punit Kumar Bhardwaj、Bruno Bernet、José Luis Bravo Gala、Thomas Knöpfel、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200490269

  日期：2004.12

  In contradistinction to the corresponding Grignard reagent, bis[(trimethylsilyl)ethynyl]zinc reacted with the 5′-oxoadenosine 3 diastereoselectively to the β-D-allo-hept-6-ynofuranosyladenine 5. Lithiation/iodination of the monomeric propargyl alcohol 5 and of the dimeric propargyl alcohol 22 provided the 8-iodoadenosines 7 and 18, respectively, considerably shortening the synthesis of the dimeric

  在对比相应的格氏试剂，双[（三甲基甲硅烷基）乙炔基]锌与5'-oxoadenosine反应3非对映选择性的β -D-同种异体-庚-6- ynofuranosyladenine 5。单体炔丙醇5和二聚炔丙醇22的锂化/碘化分别提供了8-碘腺苷7和18，大大缩短了二聚O-甲硅烷基化的8-碘腺苷25的合成。尿苷和腺苷混合的四聚体21和32被合成了。通过线性序列制备四聚体21。Sonogashira的9和13偶联产生了三聚体16，它被C-去甲硅烷基化为17。17和19的第二次Sonogashira偶联产生了四聚体21。通过汇聚路线，将乙炔29和碘化物30偶联，以更高的产率制备四聚体32。尿苷衍生的碘化物被证明比腺苷衍生的类似物和N 6具有更高的反应活性。-未保护的腺苷衍生的炔烃比其N 6-苯甲酰化的类似物更具反应性。