2,5'-anhydro-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(triethylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil | 292636-99-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2,5'-anhydro-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(triethylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil
• 英文别名: (1R,9R,10R,11R,15R)-13,13-dimethyl-9-(2-triethylsilylethynyl)-8,12,14,16-tetraoxa-2,6-diazatetracyclo[8.5.1.02,7.011,15]hexadeca-3,6-dien-5-one
• CAS: 292636-99-8
• 化学式: C₂₀H₂₈N₂O₅Si
• 分子量: 404.538
• InChiKey: LBNLMMMDSOCCPI-JVNHZCFISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.47
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  69.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,5'-anhydro-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(triethylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil 在 sodium hydroxide 、 水 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以95%的产率得到1-(6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  具有包括核碱基的主链的寡核苷，第 1 部分，概念、力场计算以及尿苷衍生单体和二聚体的合成

  摘要：

  一种新型的寡核苷已被设计用于研究具有核碱基骨架的寡核苷形成同源和/或异源双链体的潜力（参见图 2）。它的特征在于尿苷的 C(5') 和 C(6) 之间以及腺苷的 C(5') 和 C(8) 之间的乙炔基连接。力场计算和 Maruzen 模型研究表明，这种寡核苷形成自主配对系统并与 RNA 杂交。我们描述了适合构建寡聚体和二聚体的尿苷衍生单体的合成。用三乙基甲硅烷基乙炔化物处理尿苷-5'-甲醛(2)得到非对映异构炔丙醇6和7(1:2, 80%;方案1)。基于 NOE 实验和 X 射线晶体结构分析确定了它们在 C(5') 处的构型。通过用二异丙基氨基锂 (LDA) 和 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 在 (R) 配置的醇 7 的 C(6) 处碘化，得到碘化物 17 (62%)，其在 O-C(5') 处被甲硅烷基化产生 18 (89%; 方案 2)。在 MeOH/H2O 中用 NaOH 对 7 进行

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1311::aid-hlca1311>3.0.co;2-2
• 作为产物：
  描述：

  (3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-Dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde 在 乙基溴化镁 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 为溶剂， 反应 0.02h， 生成 2,5'-anhydro-1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(triethylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  具有包括核碱基的主链的寡核苷，第 1 部分，概念、力场计算以及尿苷衍生单体和二聚体的合成

  摘要：

  一种新型的寡核苷已被设计用于研究具有核碱基骨架的寡核苷形成同源和/或异源双链体的潜力（参见图 2）。它的特征在于尿苷的 C(5') 和 C(6) 之间以及腺苷的 C(5') 和 C(8) 之间的乙炔基连接。力场计算和 Maruzen 模型研究表明，这种寡核苷形成自主配对系统并与 RNA 杂交。我们描述了适合构建寡聚体和二聚体的尿苷衍生单体的合成。用三乙基甲硅烷基乙炔化物处理尿苷-5'-甲醛(2)得到非对映异构炔丙醇6和7(1:2, 80%;方案1)。基于 NOE 实验和 X 射线晶体结构分析确定了它们在 C(5') 处的构型。通过用二异丙基氨基锂 (LDA) 和 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 在 (R) 配置的醇 7 的 C(6) 处碘化，得到碘化物 17 (62%)，其在 O-C(5') 处被甲硅烷基化产生 18 (89%; 方案 2)。在 MeOH/H2O 中用 NaOH 对 7 进行

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1311::aid-hlca1311>3.0.co;2-2

文献信息

• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone, Part 1, Concept, Force-Field Calculations, and Synthesis of Uridine-Derived Monomers and Dimers
  作者：Simon Eppacher、Nathalie Solladié、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1311::aid-hlca1311>3.0.co;2-2

  日期：2000.7.5

  A new type of oligonucleosides has been devised to investigate the potential of oligonucleosides with a nucleobase-including backbone to form homo- and/or heteroduplexes (cf. Fig. 2). It is characterised by ethynyl-linkages between C(5′) and C(6) of uridine, and between C(5′) and C(8) of adenosine. Force-field calculations and Maruzen model studies suggest that such oligonucleosides form autonomous

  一种新型的寡核苷已被设计用于研究具有核碱基骨架的寡核苷形成同源和/或异源双链体的潜力（参见图 2）。它的特征在于尿苷的 C(5') 和 C(6) 之间以及腺苷的 C(5') 和 C(8) 之间的乙炔基连接。力场计算和 Maruzen 模型研究表明，这种寡核苷形成自主配对系统并与 RNA 杂交。我们描述了适合构建寡聚体和二聚体的尿苷衍生单体的合成。用三乙基甲硅烷基乙炔化物处理尿苷-5'-甲醛(2)得到非对映异构炔丙醇6和7(1:2, 80%;方案1)。基于 NOE 实验和 X 射线晶体结构分析确定了它们在 C(5') 处的构型。通过用二异丙基氨基锂 (LDA) 和 N-碘代琥珀酰亚胺 (NIS) 在 (R) 配置的醇 7 的 C(6) 处碘化，得到碘化物 17 (62%)，其在 O-C(5') 处被甲硅烷基化产生 18 (89%; 方案 2)。在 MeOH/H2O 中用 NaOH 对 7 进行