标记的 RNA 是研究 RNA 功能和定位的宝贵探针。然而,mRNA 标记仍然具有挑战性。在这里,我们开发了一种改进的方法,用于体外转录的 RNA 的 3' 端标记。我们合成了新型
腺苷 3',5'-
二磷酸腺苷类似物,在
腺苷的 N6 或 C2 位置修饰,带有含
叠氮化物的接头、荧光标记或
生物素,并评估这些构建体作为 T4 连接酶或酶后菌株直接标记 RNA 的底物- 促进
炔烃-
叠氮化物环加成 (
SPAAC)。所有类似物都是 T4 RNA 连接酶的底物。含有大量荧光标记或
生物素的类似物显示出比酶后
SPAAC 更好的整体标记产量。我们成功标记了未加帽的 RNA、
NAD 加帽的 RNA 和 5'-荧光标记的 m 7 Gp 3阿米加帽的mRNA。获得的高度同质的双标记 mRNA 具有翻译活性,并能够进行基于荧光的脱帽监测。这种方法将有助于使用各种功能化的基于 mRNA 的探针。