(2R,3S,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-fluoro-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol | 20535-16-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3S,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-fluoro-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
• 英文别名: 3'-deoxy-3'-fluoro-9-β-D-xylofuranosyladenine；(2R,3S,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-fluoro-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 20535-16-4
• 化学式: C₁₀H₁₂FN₅O₃
• 分子量: 269.235
• InChiKey: QCDAWXDDXYQEJJ-GQTRHBFLSA-N

物化性质

• 沸点：
  628.6±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.01±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险性防范说明：
  P264,P280,P302+P352,P337+P313,P305+P351+P338,P362+P364,P332+P313
• 危险性描述：
  H315,H319

制备方法与用途

3'-脱氧-3'-氟木腺苷是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-fluoro-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol 在 磷酸三乙酯 、 三氯氧磷 作用下， 以104 mg的产率得到((2R,3R,4S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3-fluoro-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl dihydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Aplysia californica mediated cyclisation of novel 3′-modified NAD + analogues: a role for hydrogen bonding in the recognition of cyclic adenosine 5′-diphosphate ribose

  摘要：

  Cyclic ADP-ribose mobilizes intracellular Ca2+ in a variety of cells. To elucidate the nature of the interaction between the C3' substituent of cADP-ribose and the cADPR receptor, three analogues of NAD(+) modified in the adenosine ribase (xyloNAD(+) 3'F-xyloNAD(+) and 3'F-NAD(+) were chemically synthesised from D-xylose and adenine starting materials. 3'F-NAD(+) was readily converted to cyclic 3'F-ADP ribose by the action of the cyclase enzyme derived from the mollusc Aplysia californica. XyloNAD(+) and 3'F-xyloNAD(+) were cyclised only reluctantly and in poor yield to afford unstable cyclic products. Biological evaluation of cyclic 3'F-ADP ribose for calcium release in sea urchin egg homogenate gave an EC50 of 1.5 +/- 0.5 muM. This high value suggests that the ability of the C3' substituent to donate a hydrogen bond is crucial for agonism. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2003.10.012
• 作为产物：
  描述：

  腺苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 二乙胺基三氟化硫 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 氯仿 为溶剂， 反应 97.0h， 生成 (2R,3S,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-fluoro-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
  参考文献：
  名称：

  用于探索细菌中非核糖体肽合成的3'-氟-tRNA类似物的合成

  摘要：

  氟化氨-酰tRNA类似物：半合成路线的tRNA的氟类似物丙氨酸和Ala-tRNA的丙氨酸已经开发出来。这些分子是丙氨酰-tRNA合成酶和FemX转移酶底物的不可异构类似物，应该为这些酶对底物的识别提供新的见解。

  DOI：

  10.1002/cbic.201402523

文献信息

• 核苷化合物的氨基磷酸酯衍生物及其用途
  申请人：广东东阳光药业有限公司

  公开号：CN112010916B

  公开（公告）日：2022-12-27

  本发明属于药物技术领域，涉及核苷化合物的氨基磷酸酯衍生物及其用途，以及包含该类化合物的药物组合物，它们可以作为抗病毒试剂，尤其是抗新型冠状病毒(SARS‑CoV‑2)试剂。本发明还涉及制备这类化合物和药物组合物的方法，以及它们在预防或治疗病毒感染，包括但不限于，黄病毒科病毒感染、丝状病毒科病毒感染、肠道病毒科病毒感染、正粘液病毒科病毒感染、副粘液病毒科病毒感染、冠状病毒科病毒感染，特别是新型冠状病毒(SARS‑CoV‑2)感染中的用途。
• LOCKED NUCLEIC ACID CYCLIC DINUCLEOTIDE COMPOUNDS AND USES THEREOF
  申请人：ADURO BIOTECH, INC.

  公开号：US20190185511A1

  公开（公告）日：2019-06-20

  The present invention provides highly active locked nucleic acid cyclic-dinucleotide (LNA-CDN) immune stimulators that activate DCs via the cytoplasmic receptor known as STING (Stimulator of Interferon Genes). In particular, the LNA-CDNs of the present invention are provided in the form of a composition comprising one or more cyclic dinucleotides that induce human STING-dependent type I interferon production, wherein the cyclic dinucleotides present in the composition have at least one 2′, 4′ locked nucleic acids within the cyclic dinucleotide.

  本发明提供了高活性的锁定核酸环二核苷酸（LNA-CDN）免疫刺激剂，通过细胞质受体STING（干扰素基因刺激剂）激活DCs。具体而言，本发明的LNA-CDNs以一种组合物的形式提供，该组合物包括一种或多种诱导人类STING依赖型I型干扰素产生的环二核苷酸，其中组合物中的环二核苷酸至少有一个2′, 4′锁定核酸。
• Role of the stereochemistry of 3′-fluoro-3′-deoxy analogues of 2-5A in binding to and activation of mouse RNase L
  作者：Elena N. Kalinichenko、Tatjana L. Podkopaeva、Nicolai E. Poopeiko、Merike Kelve、Mart Saarma、Igor A. Mikhailopulo、Jacquelien E. van den Boogaart、Cornelis Altona

  DOI：10.1002/recl.19951140202

  日期：——

  with p3(A2′p)3A3′[32P]pC3′p for binding to RNase L in L929 cell extracts, and (ii) to activate the partially purified RNase L from L929 cell extracts to hydrolyze poly(U)[3H], was compared to that of the related 3′-deoxy analogue [Torrence et al., J. Biol. Chem. 263, 1131 (1988)] and the parent trimer, p3A3, using radiobinding and RNase L-(2′,5′)pentaadenylate(core)-agarose assays, respectively. Evidence

  两套2-5A类似物的三聚体的含9-（3-氟-3-脱氧β-d木-呋喃糖基）腺嘌呤（A合成˚F）或3'-氟-3'-脱氧腺苷（A ˚F）描述了在链的不同位置上的）以及相应的5'-单磷酸盐和5'-二磷酸化（核心）三聚体的制备。2-5A（i）的每个核糖和木糖异构体对的氟脱氧类似物与p 3（A2'p）3 A3'[ 32 P] pC3'p竞争结合L 929细胞提取物中RNase L的能力，和（ii）从L 929激活部分纯化的RNase L将用于水解聚（U）[ 3 H]的细胞提取物与相关的3'-脱氧类似物[ Torrence等人，J。化学 263，1131（1988）]和三聚体母体，第3阿3，分别使用radiobinding和RNase L-（2'，5'）pentaadenylate（芯） -琼脂糖测定，。证据表明三聚体的立体化学起着重要作用，特别是在第二步过程中。最惊人的发现是，与2-5A相比，p 3 A（A
• Nucleotides. Part XXXIVSynthesis of Modified Oligomeric 2?-5?A Analogues: Potential Antiviral Agents
  作者：Piet Herdewijn、Klaus Ruf、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19910740104

  日期：1991.1.30

  right positions. Their condensations with the intermediary dimeric 2′-terminal phosphodiesters 48 and 49 led to the fully protected 2′–5′-trimers 50–58 which were deblocked to form the free 2′–5′-trimers 59–63. Easy elimination of HBr on deprotection did not allow to form the trimeric (3′-bromo-3′-deoxy-β-D-xylofuranosyl)adenine analogue but only 63 carrying an unsaturated sugar moiety instead. The newly

  一系列新的2'–5'-寡核苷酸三聚体，其带有9-（2'，3'-脱水-β-D-核呋喃糖基）-（59），9-（3'-脱氧-β-D-甘油- pent-3-enofuranosyl）-（63），9-（3'-azido-3'-deoxy-β-D-xylofuranosyl）-（62）和9-（3'-halo-3'-deoxy-β通过磷酸三酯法合成了在2'-末端的-D-二呋喃呋喃糖基）腺嘌呤（60和61）部分。的适当的保护，改性单体结构单元（6，9，16，19，27，33，36，37，和43通常通过一系列反应将保护基团引入正确的位置来获得）。他们与中间商二聚体2'-终端磷酸二酯缩合48和49导致了充分的保障2'，5'-三聚体50-58，其被解封，形成游离'，5'-三聚体59 - 63。脱保护时容易消除HBr不允许形成三聚（3'-溴-3'-脱氧-β-D-木呋喃糖基）腺嘌呤类似物，而仅形成63个带有不饱和糖
• The β-Fluorine Effect. Electronic Versus Steric Effects in Radical Deoxygenations of Fluorine-Containing Pentofuranose Nucleosides
  作者：Stanislaw F. Wnuk、Dania R. Companioni、Vladimir Neschadimenko、Morris J. Robins

  DOI：10.1021/jo020428b

  日期：2002.12.1

  Stereoselective pyramidalization of free radicals by a vicinal fluorine substituent, the beta-fluorine effect, was invoked to rationalize a 77:23 anti/syn ratio of 2-deuterio-1-fluorocyclopentanes obtained by radical reduction of trans-2-fluoro-1-bromocyclopentane with tributyltin deuteride (Dolbier, W. R., Jr.; Bartberger, M. D. J. Org. Chem. 1995, 60, 4984-4985). We have evaluated analogous reductions

  借助邻位氟取代基对自由基进行立体选择性锥体化，即β-氟效应，以合理化通过反式-2-氟-1-基的自由基还原而获得的2-氘-1-氟环戊烷的77:23反/同比例。溴环戊烷和氘化三丁基锡（Dolbier，WR，Jr .; Bartberger，MDJ Org.Chem。1995，60，4984-4985）。我们已经评估了某些腺嘌呤2'（3'）-氟-3'（2'）-O-苯氧基硫羰基核苷衍生物的四种可能的立体异构体的类似还原。在所有情况下，腺嘌呤在β面上的立体作用都将氘从锡烷转移到呋喃糖环的α面上的C2'（C3'）。然而，β-氟效应增加了氘转移与邻位氟取代基的比率。